Abstract

GUZMAN-LOPEZ, Oswaldo; RICANO-RODRIGUEZ, Celeste; LUIS-YONG, Daniela  and  RICANO-RODRIGUEZ, Jorge. NCBI: generalidades del repositorio y breve descripción de recursos aplicables al estudio de la fitogenética. Rev. fitotec. mex [online]. 2023, vol.46, n.1, pp.63-76.  Epub Apr 02, 2024. ISSN 0187-7380.  https://doi.org/10.35196/rfm.2023.1.63.

El Centro Nacional para la Información Biotecnológica (NCBI) proporciona acceso a un conjunto de recursos computacionales que permiten el conocimiento de sistemas biológicos; además, en éste se incluyen diversos repositorios de secuencias genómicas y proteicas, citas y resúmenes científicos referentes a las ciencias naturales y de la salud. En virtud de lo anterior, el objetivo de este trabajo fue llevar a cabo una recopilación de generalidades del NCBI, tomando como base de organización del documento los siguientes elementos: el sistema Entrez, fuentes de información y actualización de literatura, incluyendo la base de datos de taxonomía, gestión de metadatos y expresión genética, gestión de colecciones de secuencias nucleotídicas, procesamiento de secuencias genómicas y proteicas. De manera complementaria, se describen algunas herramientas aplicables al estudio de la fitogenética que han apoyado el ensamble de genomas completos de plantas; además, se discuten de manera breve algunos resultados de investigaciones derivados del uso de recursos bioinformáticos como anotaciones genómicas, generación y organización de metadatos, estudios de expresión genética incluyendo transcriptómica, búsqueda de alineaciones nucleotídicas locales y globales, así como estructuración y modelación tridimensional de proteínas, entre otros.

Keywords : BLAST; GenBank; NCBI; PubMed; recursos fitogenéticos.

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