Antecedentes:

El género Ipomoea, con una clasificación controversial, es uno de los géneros más diversos en las angiospermas. A pesar de su gran número de especies solo unos cuantos genomas de cloroplasto han sido secuenciados.

Preguntas y/o hipótesis:

Nos enfocamos en secuenciar y caracterizar el genoma de cloroplasto de una especie cuyas hojas son utilizadas como saborizante, conocida como “Xonequi”, Ipomoea dumosa. Nuestra hipótesis es que los análisis filogenéticos la identificarán en el clado “Quamoclit”.

Especies estudiadas:

Las 27 especies cuyos genomas de cloroplasto se han secuenciado fueron consideradas en los análisis y como el grupo externo se incluyó a Merremia hederacea.

Métodos:

La secuenciación se llevó a cabo usando la tecnología Sequencing PacBio HiFi y el ensamblaje con el software Organelle_PBA. El “Model Test” fue implementado en el alineamiento sin particiones para encontrar el modelo evolutivo. El árbol filogenético fue construido por Máxima Verosimilitud con 1,000 réplicas de bootstrap.

Resultados:

El genoma de cloroplasto de Ipomoea dumosa mostró un tamaño similar y características a los genomas previamente analizados del género. La reconstrucción filogenética identificó a I. dumosa cercanamente relacionada con I. quamoclit.

Conclusiones:

Los resultados sugieren que I. dumosa pertenece al clado Quamoclit, con el que comparte varios caracteres vegetativos y florales.

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