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Botanical Sciences
versión On-line ISSN 2007-4476versión impresa ISSN 2007-4298
Resumen
ORTIZ-BRUNEL, Juan Pablo et al. Two chloroplast genomes with reduced inverted repeat regions in Mammillaria series Stylothelae (Cactaceae). Bot. sci [online]. 2024, vol.102, n.2, pp.499-512. Epub 04-Jun-2024. ISSN 2007-4476. https://doi.org/10.17129/botsci.3446.
Antecedentes:
Los genomas de cloroplasto de Cactaceae exhiben modificaciones en los límites de las regiones repetidas inversas (IRs), inversiones de genes y deleciones. En nueve especies de Mammillaria, se han encontrado tres estructuras de cloroplasto distintas, aunque no todas corresponden a las clasificaciones basadas en morfología.
Pregunta:
¿Existe una estructura de genoma de cloroplasto distinta en las especies de Mammillaria serie Stylothelae?
Especies estudiadas:
Mammillaria bocasana y M. erythrosperma.
Sitio y años de estudio:
México, de 2019 a 2023.
Métodos:
ADN de cloroplasto fue secuenciado y los plastomas fueron ensamblados de novo usando el programa Fast-Plast. Las secuencias completas fueron anotadas y verificadas. Las secuencias fueron alineadas en el programa MAUVE para detectar posibles cambios estructurales. Un análisis filogenético con máxima verosimilitud evaluó las relaciones de las especies estudiadas.
Resultados:
Los plastomas variaron desde 107,368 pb de longitud en Mammillaria bocasana hasta 108,069 pb en M. erythrosperma. Ambos presentaron una estructura cuadripartita y contuvieron 108 genes. Las IRs tuvieron ~1,600 pb y contuvieron los genes rpl2, rpl23 (pseudo) y trnI-CAU. MAUVE identificó una inversión de ~21 kb en la región larga de copia única que contiene genes relacionados con la fotosíntesis. El análisis filogenético recuperó a ambas especies como grupos hermanos dentro de Mammillaria subg. Mammillaria.
Conclusiones:
Las dos especies estudiadas de Mammillaria serie Stylothelae presentaron una estructura de plastoma sinapomórfica. Otras estructuras de plastomas de Mammillaria han evolucionado independientemente en linajes diferentes.
Palabras llave : plastomas isoméricos; estructura; genes ndh; plastoma.