Resumen

NUNEZ-ROJAS, Edgar; PEREZ DE LA LUZ, Alexander; SAINT-MARTIN, Humberto  y  ALEJANDRE, José. Fifty Years of Molecular Simulations at UAM and in Mexico. J. Mex. Chem. Soc [online]. 2024, vol.68, n.4, pp.717-742.  Epub 03-Mar-2025. ISSN 1870-249X.  https://doi.org/10.29356/jmcs.v68i4.2291.

Los métodos de simulación molecular son el puente entre las interacciones moleculares y las propiedades macroscópicas de la materia. Las ecuaciones de la mecánica estadística dan el método probabilístico de Montecarlo mientras que las de Newton son las bases de la Dinámica Molecular, que es determinista. Una simulación molecular predice el movimiento de las moléculas y se pueden obtener cientos de propiedades fisicoquímicas para comprender su comportamiento en diferentes condiciones termodinámicas. Los métodos de simulación molecular se desarrollaron en la década de 1950 en Estados Unidos de América y en la década de 1980 en México, donde la Universidad Autónoma Metropolitana (UAM) fue pionera. Es un campo multidisciplinario que involucra a matemáticos, químicos, físicos, ingenieros de diferentes disciplinas, biólogos, informáticos, etc. Las supercomputadoras han jugado un papel importante en su desarrollo. Actualmente, Estados Unidos, China y la Comunidad Europea cuentan con más de 100 supercomputadoras en el ranking TOP500, mientras que Canadá y Brasil tienen 10, España 3, Argentina 1 y México ninguno. Estos recursos permiten incrementar las capacidades de formación, la producción de artículos de investigación, la organización de eventos académicos, etc.

En este trabajo hacemos una revisión del desarrollo de simulaciones moleculares en la UAM y en México. La difusión y promoción de este campo de investigación ha sido llevada a cabo por líderes académicos de varias universidades. Hemos organizado 12 Talleres de Dinámica Molecular a nivel nacional para enseñar y poner en práctica los conceptos básicos y 13 Simposios internacionales sobre Simulación Molecular para discutir el estado del arte en proyectos de investigación. El número de artículos sobre dinámica molecular crece exponencialmente con el tiempo; en 2023, se publicaron más de 250.000 en todo el mundo. México aportó el 10 % y la UAM el 10 % de los publicados en México. Hay más de 32 líderes mexicanos viviendo en México que han publicado alrededor de 120 artículos con al menos 100 citas, según Web of Science. Alrededor del 70 % pertenece al Sistema Nacional de Investigadores en los niveles III y Eméritos. Las líneas de investigación abarcan ecuaciones de estado en líquidos, equilibrio de fases, desarrollo de métodos de simulación y campos de fuerza, fluidos polares, electrolitos, coloides, polímeros, interacción fármaco/proteína, plegamiento de proteínas, entre otras.

Palabras llave : Simulación molecular; dinámica molecular; Monte Carlo; simulación en México; talleres y simposios; campos de fuerza; materia condensada; supercómputo.

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