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Revista fitotecnia mexicana
versión impresa ISSN 0187-7380
Resumen
ESPINOSA-VICTORIA, David; LOPEZ-REYES, Lucía y DE LA CRUZ-BENITEZ, Aldo. Uso del gen 16s rRNA para caracterización de bacterias solubilizadoras de fosfatos asociadas al maíz. Rev. fitotec. mex [online]. 2009, vol.32, n.1, pp.31-37. ISSN 0187-7380.
Se caracterizaron fenotípica y genotípicamente 36 cepas de bacterias solubilizadoras de fosfato (BSP), aisladas de la rizosfera y rizoplano del maíz (Zea mays L.) en diferentes estados de México. Primeramente, se evaluó la capacidad de cada cepa para solubilizar fosfato, empleando fosfato tricálcico como fuente de fósforo en el medio de cultivo NBRIP-BPB. También, se evaluó su capacidad solubilizadora de fosfato pero adicionando al medio el amortiguador de pH MES (2-[Morfolino] ácido etanosulfónico). El análisis de patrones de restricción de ARN ribosomal amplificado (ARDRA) fue empleado para el estudio de la diversidad genética. A partir de la matriz generada, se construyó un dendrograma por el método UPGMA. El gen 16S rRNA de las cepas BUAP29, BUAP36 y CP08 fue amplificado, clonado y secuenciado para su clasificación taxonómicamente. Las 36 cepas bacterianas presentaron diversos niveles de actividad solubilizadora de fosfato tricálcico. Solamente las cepas BUAP33, BUAP17 y BUAP21 no presentaron el típico halo de solubilización cuando se adicionó al medio el amortiguador MES. El análisis de los patrones ARDRA así como el dendrograma mostraron una gran diversidad genética entre las 36 BSP analizadas, donde solamente las cepas BUAP36 y BUAP15 exhibieron 100% de similitud. El alineamiento de las secuencias del gen 16S rRNA de las cepas CP08, BUAP29 y BUAP36 presentó 99% de identidad con las secuencias de Advenella incenata cepa R-16599 (con número de acceso AY569458.1 en NCBI), Burkholderia sp (con número de acceso AY353696 en NCBI) y Burkholderia gladioli cepa 223-1 (con número de acceso DQ355168.1 en NCBI), respectivamente. En el presente estudio se reporta por primera vez a A. incenata como una BSP.
Palabras llave : ARDRA; acterias solubilizadoras de fosfato; diversidad genética; 16S rRNA.