GUZMAN-LOPEZ, Oswaldo; RICANO-RODRIGUEZ, Celeste; LUIS-YONG, Daniela    RICANO-RODRIGUEZ, Jorge. NCBI: generalidades del repositorio y breve descripción de recursos aplicables al estudio de la fitogenética. []. , 46, 1, pp.63-76.   02--2024. ISSN 0187-7380.  https://doi.org/10.35196/rfm.2023.1.63.

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El Centro Nacional para la Información Biotecnológica (NCBI) proporciona acceso a un conjunto de recursos computacionales que permiten el conocimiento de sistemas biológicos; además, en éste se incluyen diversos repositorios de secuencias genómicas y proteicas, citas y resúmenes científicos referentes a las ciencias naturales y de la salud. En virtud de lo anterior, el objetivo de este trabajo fue llevar a cabo una recopilación de generalidades del NCBI, tomando como base de organización del documento los siguientes elementos: el sistema Entrez, fuentes de información y actualización de literatura, incluyendo la base de datos de taxonomía, gestión de metadatos y expresión genética, gestión de colecciones de secuencias nucleotídicas, procesamiento de secuencias genómicas y proteicas. De manera complementaria, se describen algunas herramientas aplicables al estudio de la fitogenética que han apoyado el ensamble de genomas completos de plantas; además, se discuten de manera breve algunos resultados de investigaciones derivados del uso de recursos bioinformáticos como anotaciones genómicas, generación y organización de metadatos, estudios de expresión genética incluyendo transcriptómica, búsqueda de alineaciones nucleotídicas locales y globales, así como estructuración y modelación tridimensional de proteínas, entre otros.

The National Center for Biotechnology Information (NCBI) provides access to a set of computational resources that allow knowledge of biological systems; in addition, it includes various repositories of genomic and protein sequences, citations and scientific abstracts concerning the natural and health sciences. This work aimed to carry out a compilation of NCBI generalities, taking the following elements as the organizational basis of the document: the Entrez system, sources of information and updating of literature, including the taxonomy database, management of metadata and genetic expression, management of nucleotide sequence collections, processing of genomic and protein sequences. In addition, some useful tools applicable to the study of plant genetics that have supported the assembly of complete plant genomes are described, briefly discussing some research results derived from the use of bioinformatics resources such as genomic annotations, generation and organization of metadata, gene expression studies including transcriptomics, search for local and global nucleotide alignments, as well as structuring and three-dimensional modeling of proteins, among others.

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