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<journal-title><![CDATA[Revista internacional de contaminación ambiental]]></journal-title>
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<article-title xml:lang="es"><![CDATA[Participación de diferentes genes en la reparación de rupturas de doble cadena en cepas de Escherichia coli expuestas a radiación gamma]]></article-title>
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<abstract abstract-type="short" xml:lang="en"><p><![CDATA[All living organisms are naturally exposed to radiation from different sources. Ionizing radiation produces a plethora of lesions upon ADN that can be categorized as single and double strand breaks and base damage. Among them, unrepaired double strand breaks (DSB) have the greatest biological significance, since they are responsible of cell death. In Escherichia coli this kind of lesions are repaired mostly by homologous recombination. In this work the participation of some recombination genes in the repair of DSB is evaluated. E. coli defective strains were exposed to gamma radiation and incubated for different periods in ideal conditions. Both microelectrophoresis and pulse field gel electrophoresis techniques were used to evaluate the kinetics of repair of such lesions, reflecting the importance of each defective gene in the process.]]></p></abstract>
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<kwd lng="es"><![CDATA[Reparación de rupturas dobles]]></kwd>
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</front><body><![CDATA[  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="4">Art&iacute;culos</font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2">&nbsp;</font></p>  	    <p align="center"><font face="verdana" size="4"><b>Participaci&oacute;n de diferentes genes en la reparaci&oacute;n de rupturas de doble cadena en cepas de <i>Escherichia coli</i> expuestas a radiaci&oacute;n gamma</b></font></p>  	    <p align="center"><font face="verdana" size="2">&nbsp;</font></p>              <p align="center"><font face="verdana" size="3"><b>Participation of some recombination genes in the repair of double strand breaks of <i>Escherichia coli</i> strains exposed to gamma radiation</b></font></p>          <p align="justify"><font face="verdana" size="2">&nbsp;</font></p>  	    <p align="center"><font face="verdana" size="2"><b>Jorge Humberto SERMENT GUERRERO*, Estefany MART&Iacute;NEZ MART&Iacute;NEZ y David ALC&Aacute;NTARA D&Iacute;AZ</b></font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2">&nbsp;</font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2"><i>Departamento de Biolog&iacute;a, Instituto Nacional de Investigaciones Nucleares, M&eacute;xico, </i>*Autor responsable: <a href="mailto:jorge.serment@inin.gob.mx">jorge.serment@inin.gob.mx</a></font></p>     ]]></body>
<body><![CDATA[<p align="justify"><font face="verdana" size="2">&nbsp;</font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2">Recibido mayo 2012,     <br> aceptado octubre 2012</font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2">&nbsp;</font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2"><b>RESUMEN</b></font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2">Todos los seres vivos est&aacute;n expuestos a la radiaci&oacute;n proveniente de diversas fuentes. La radiaci&oacute;n ionizante puede da&ntilde;ar al material gen&eacute;tico causando rupturas en una o en ambas cadenas, o bien lesiones diversas en las bases. Las rupturas de doble banda (RDB) tienen gran importancia biol&oacute;gica ya que de no eliminarse producen la muerte celular. En <i>Escherichia coli</i> este tipo de lesiones se reparan en su mayor&iacute;a por recombinaci&oacute;n hom&oacute;loga. En el presente trabajo se eval&uacute;a la participaci&oacute;n de algunos genes de recombinaci&oacute;n en la reparaci&oacute;n de RDB causadas por radiaci&oacute;n gamma. Se expusieron mutantes de <i>E. coli</i> defectuosos en genes de recombinaci&oacute;n a diversas dosis de radiaci&oacute;n gamma y se incubaron por diferentes periodos en condiciones ideales. Para evaluar las RDB se utilizaron tanto la t&eacute;cnica de microelectroforesis como la de electroforesis de campos pulsados. En ambos casos los resultados muestran la cin&eacute;tica de recuperaci&oacute;n para cada cepa, lo que refleja la importancia de cada gen en el proceso de reparaci&oacute;n de RDB.</font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2"><b>Palabras clave:</b> Reparaci&oacute;n de rupturas dobles, recombinaci&oacute;n, radiaci&oacute;n gamma.</font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2">&nbsp;</font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2"><b>ABSTRACT</b></font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2">All living organisms are naturally exposed to radiation from different sources. Ionizing radiation produces a plethora of lesions upon ADN that can be categorized as single and double strand breaks and base damage. Among them, unrepaired double strand breaks (DSB) have the greatest biological significance, since they are responsible of cell death. In <i>Escherichia</i> coli this kind of lesions are repaired mostly by homologous recombination. In this work the participation of some recombination genes in the repair of DSB is evaluated. <i>E. coli</i> defective strains were exposed to gamma radiation and incubated for different periods in ideal conditions. Both microelectrophoresis and pulse field gel electrophoresis techniques were used to evaluate the kinetics of repair of such lesions, reflecting the importance of each defective gene in the process.</font></p>  	    ]]></body>
<body><![CDATA[<p align="justify"><font face="verdana" size="2"><b>Key words:</b> DSB repair, recombination, gamma radiation.</font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2">&nbsp;</font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2"><b>INTRODUCCI&Oacute;N</b></font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2">Todos los seres vivos est&aacute;n expuestos a la radiaci&oacute;n proveniente ya sea de fuentes naturales (como son los rayos c&oacute;smicos o sustancias radioactivas existentes en la tierra, tales como el gas rad&oacute;n), o bien como resultado de diversas actividades humanas que se agregan a la exposici&oacute;n natural (explosiones nucleares, aplicaciones m&eacute;dicas, investigaci&oacute;n, etc.). Casi desde el descubrimiento de la radiaci&oacute;n se observaron los efectos que &eacute;sta ten&iacute;a sobre los seres vivos; sin embargo, fue a partir de las explosiones de las bombas de Hiroshima y Nagasaki que se despert&oacute; una gran inquietud por los da&ntilde;os producidos por este agente. La radiaci&oacute;n consiste de part&iacute;culas subat&oacute;micas u ondas electromagn&eacute;ticas energ&eacute;ticas que viajan a trav&eacute;s de un medio o espacio y que cuando chocan con las mol&eacute;culas de otro material les transfieren su energ&iacute;a. Al hacerlo, dependiendo de la energ&iacute;a que posea o que deposite, puede provocar que los electrones orbitales vibren, que se exciten al pasar a niveles de energ&iacute;a superiores o bien que salgan de su &oacute;rbita dando lugar a iones. A la radiaci&oacute;n que tiene la capacidad de transferir la energ&iacute;a suficiente para que ocurra esto &uacute;ltimo se le conoce como radiaci&oacute;n ionizante. Al incidir sobre las c&eacute;lulas la radiaci&oacute;n ionizante afecta tanto a los componentes estructurales como al material gen&eacute;tico, pero mientras que el da&ntilde;o en los primeros es moment&aacute;neo (ya que existe la posibilidad de sintetizar nuevas mol&eacute;culas para reemplazarlas), en el material gen&eacute;tico los efectos pueden ser permanentes y traer graves consecuencias a nivel celular, tisular, en los organismos o incluso en la poblaci&oacute;n, por lo que en general cuando se refiere a los efectos de la radiaci&oacute;n se considera al ADN como la mol&eacute;cula blanco (Teoul&eacute; 1987, Averbeck <i>et al.</i> 2006).</font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2">La radiaci&oacute;n afecta al material gen&eacute;tico de manera totalmente aleatoria en funci&oacute;n de dos alternativas conocidas como efectos directo e indirecto. El primero se refiere a la interacci&oacute;n de los fotones y part&iacute;culas ionizantes con el ADN, mientras que el segundo se debe a reacciones con los productos de la radi&oacute;lisis del agua en donde ocurre la mayor&iacute;a de las ionizaciones, ya que es el componente m&aacute;s abundante de la materia viva.</font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2">La radiaci&oacute;n ionizante puede da&ntilde;ar al material gen&eacute;tico causando diversas lesiones en las bases y rupturas en una o en ambas cadenas. Las rupturas de doble banda (RDB) representan uno de los da&ntilde;os m&aacute;s perjudiciales al ADN ya que de no eliminarse producen la muerte celular (Sargentini y Smith 1986). Para reparar estas lesiones la &uacute;nica posibilidad en la bacteria <i>Escherichia coli</i> es la recombinaci&oacute;n. En esencia el proceso se refiere al paso de fragmentos de una mol&eacute;cula de ADN a otra diferente, ya sea en forma rec&iacute;proca, es decir que haya intercambio entre ambas, o no rec&iacute;proca, en donde solamente una de ellas recibe material nuevo. Esta transferencia puede llevarse a cabo en regiones con secuencias similares (recombinaci&oacute;n hom&oacute;loga) o bien por la uni&oacute;n de extremos de ADN (recombinaci&oacute;n no hom&oacute;loga), evento que se da principalmente en eucariontes y de manera muy reducida en la mayor&iacute;a de las bacterias, aunque en algunas como <i>Deinococcus radiodurans</i> o <i>Bacillus subtilis</i> parece ser un mecanismo primordial (Kuzminov 1999). La recombinaci&oacute;n es muy importante ya que es la &uacute;nica posibilidad de componer el da&ntilde;o en el caso de rupturas de doble banda (RDB), puesto que al perderse la continuidad de la hebra de ADN no hay un molde a partir del cual resintetizarla, con la consecuente muerte de la c&eacute;lula. Asimismo, puede tambi&eacute;n intervenir para tolerar lesiones durante el proceso de duplicaci&oacute;n del ADN: cuando la polimerasa que cataliza la s&iacute;ntesis del ADN nuevo encuentra una lesi&oacute;n ilegible (d&iacute;mero, aducto, etc.), interrumpe el proceso y prosigue varios nucle&oacute;tidos m&aacute;s adelante, dejando un hueco enfrente del sitio donde se halla el da&ntilde;o. Para resolver este problema la c&eacute;lula lleva a cabo un evento de recombinaci&oacute;n no rec&iacute;proca, en el que una mol&eacute;cula hom&oacute;loga de ADN cede el fragmento hom&oacute;logo para as&iacute; rellenar el hueco que qued&oacute; en el ADN reci&eacute;n sintetizado (Kuzminov 1999).</font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2">En <i>Escherichia coli</i> existen dos v&iacute;as principales de recombinaci&oacute;n hom&oacute;loga, la v&iacute;a RecBCD y la v&iacute;a RecFOR, aunque en algunas bacterias existe tambi&eacute;n la v&iacute;a RecE que depende de la presencia del profago <i>rac</i> (Kuzminov 1999). La m&aacute;s importante es la que lleva a cabo la enzima RecBCD, ya que es la principal responsable de la reparaci&oacute;n de rupturas de doble cadena. Esta enzima reconoce los extremos libres parejos o casi parejos de ADN duplex y degrada el extremo 3' hasta encontrar una secuencia espec&iacute;fica denominada sitio <i>chi</i> (llamado as&iacute; por sus siglas en ingl&eacute;s <i>crossover hotspot instigator,</i> com&uacute;nmente representado con la letra griega x), en donde el complejo RecBCD se detiene, cambia de polaridad y degrada preferentemente el extremo 5', de modo que se genera una cadena libre terminada en 3'. Al mismo tiempo la enzima promueve la polimerizaci&oacute;n de RecA sobre esta cadena, iniciando el apareamiento con una secuencia hom&oacute;loga y el intercambio de bandas de ADN. Posteriormente la polimerasa I del ADN sintetiza la parte faltante (Dillingham y Kowalczykowski 2008).</font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2">La v&iacute;a RecFOR por su parte se encarga de la recombinaci&oacute;n en tramos de ADN de cadena sencilla (huecos). Cabe mencionar que estos huecos pueden formarse por la actividad de nucleasas como RecJ o Exo I a partir de cortes de cadena sencilla o bien por la interrupci&oacute;n de la s&iacute;ntesis de ADN. Al formarse este tipo de estructuras la enzima SSB (por sus siglas en ingl&eacute;s <i>single&#45;strand binding protein)</i> se pega a ellas para protegerlas y darles estabilidad; sin embargo, esta actividad interfiere con la formaci&oacute;n del filamento de RecA sobre el ADN. Posteriormente el complejo FOR (formado por las subunidades RecF, RecO y RecR) estimula precisamente el desalojamiento de SSB del ADN y promueve la entrada de RecA, que realiza el intercambio con la secuencia hom&oacute;loga de otra mol&eacute;cula de ADN (Umezu y Kolodner 1993, Umezu y Kolodner 1994).</font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2">Como ya se mencion&oacute;, las rupturas de doble banda tienen gran relevancia biol&oacute;gica ya que de no repararse son responsables de la muerte celular y por ello es importante contar con t&eacute;cnicas para evaluarlas. En el presente trabajo se estudi&oacute; la importancia de diferentes genes de recombinaci&oacute;n <b><i>(recB, xonA, recJ</i></b> y <b><i>recO)</i></b> en la reparaci&oacute;n de rupturas dobles, en cepas de <i>E. coli</i> defectuosas en dichos genes, mediante las t&eacute;cnicas de microelectroforesis unicelular (ensayo cometa) y electroforesis en campos pulsados.</font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2">&nbsp;</font></p>  	    ]]></body>
<body><![CDATA[<p align="justify"><font face="verdana" size="2"><b>METODOLOG&Iacute;A</b></font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2">Las cepas utilizadas en el presente trabajo forman parte de la colecci&oacute;n del laboratorio de Gen&eacute;tica Microbiana del Instituto Nacional de Investigaciones Nucleares y se enlistan en el <b><a href="/img/revistas/rica/v29n1/a5c1.jpg" target="_blank">cuadro I</a>.</b> Se utilizaron cepas con defectos en uno o dos de los genes de recombinaci&oacute;n arriba mencionados.</font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2">&nbsp;</font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2"><b>Cultivo e irradiaci&oacute;n de las bacterias</b></font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2">Se tom&oacute; una al&iacute;cuota de un cultivo en fase estacionaria, se diluy&oacute; 50 veces en caldo de Luria&#45;Bertani (LB) y se incub&oacute; hasta alcanzar la fase logar&iacute;tmica media de crecimiento, que corresponde a una concentraci&oacute;n de aproximadamente 2x10<sup>8</sup> c&eacute;lulas/mL (Abs<sub>600</sub>=<sup>:</sup>0.5). Se centrifug&oacute; a 10 000 rpm por 10 minutos, se resuspendi&oacute; el bot&oacute;n en amortiguador de fosfatos 0.2 M pH 7, se tomaron al&iacute;cuotas de 1 mL y se expusieron a diferentes dosis de radiaci&oacute;n gamma en un irradiador Gammacell <sup>60</sup>Co. Posteriormente, las suspensiones bacterianas se centrifugaron, se resuspendieron los botones en LB y se incubaron a 37 &deg;C. Se tomaron muestras de cada tratamiento a diferentes intervalos de tiempo (de 5 a 80 minutos) y se analiz&oacute; la fragmentaci&oacute;n del ADN mediante la t&eacute;cnica de microelecroforesis unicelular y electroforesis de campos pulsados <i>(Pulse&#45;Field Gel Electrophoresis).</i></font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2">&nbsp;</font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2"><b>Microelectroforesis unicelular</b></font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2">Las bacterias se mezclaron con un volumen igual de una soluci&oacute;n de agarosa 1 % y de esta mezcla se form&oacute; una capa de agarosa sobre portaobjetos preparados previamente con una capa de agarosa al 0.5 % que se dej&oacute; secar toda la noche. Se agregaron 80 &#956;L de la primera soluci&oacute;n de lisis (0.25 % SDS, lisozima 0.5 mg/mL, ribonucleasa 5 mg/mL) y se incubaron en una c&aacute;mara h&uacute;meda durante 30 minutos a 37 &deg;C. Se agreg&oacute; el mismo volumen de una segunda soluci&oacute;n de lisis (2.5 M NaCI, 100 mM EDTA, 10 mM tris pH10, 1 % de TritonX&#45;100) y se incubaron por 10 minutos a temperatura ambiente. Se sumergieron los portaobjetos en un amortiguador de digesti&oacute;n (2.5 M NaCI, 10 mM EDTA, 10 mM Tris pH 7.4) con proteinasa K (1 mg/mL) durante 30 minutos a 37 &deg;C y posteriormente en amortiguador de corrimiento (500 mM de acetato de sodio y 100 mM de Tris, pH 9) dentro de una c&aacute;mara de electroforesis. Se ajust&oacute; el volumen para dar una corriente de l00 mA durante 60 minutos a 4 &deg;C. Se retiraron los portaobjetos, se sumergieron en una soluci&oacute;n 1M de acetato de sodio/etanol (5 mL de acetato de sodio 5M en 45 mL de etanol absoluto) durante 30 minutos y se transfirieron a etanol al 70 %, durante 15 minutos. A cada preparaci&oacute;n se le agregaron 50 &#956;, de una soluci&oacute;n 1 mM. de YOYO&#45;1 (benzoxazolium&#45;4&#45;quinolinum oxazole yellow homodimer) o bromuro de etidio (20 &#956;g/mL) durante 3 minutos, se enjuagaron con PBS y se observaron al microscopio. Se contaron 250 c&eacute;lulas por preparaci&oacute;n (Singh <i>et al.</i> 1999).</font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2">&nbsp;</font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2"><b>Electroforesis de campos pulsados</b></font></p>  	    ]]></body>
<body><![CDATA[<p align="justify"><font face="verdana" size="2">A partir de una colonia bacteriana se hizo un cultivo de 16&#45;20 horas en caldo LB y de este cultivo se tomaron al&iacute;cuotas de 1 mL; cada una se centrifug&oacute; a 10 000 rpm durante 10 minutos, se decant&oacute; el sobrenadante y el bot&oacute;n se resuspendi&oacute; en 1 mL de amortiguador de fosfatos 20 mM. Se conservaron los tubos en hielo y se expusieron a diferentes dosis de radiaci&oacute;n gamma. Posteriormente una fracci&oacute;n se centrifug&oacute; a 12 000 rpm durante 30 segundos, se elimin&oacute; el sobrenadante y se resuspendi&oacute; en 200 &#956;L de agarosa de bajo punto de fusi&oacute;n (ABPF) al 1 % a 37 &deg;C. Los botones se repartieron en los moldes para formar peque&ntilde;os bloques de agarosa usados con el equipo de electroforesis por pulsos (PFGE) y el resto del cultivo se resuspendi&oacute; en 1 mL de LB y se incub&oacute; a 37 &deg;C durante diferentes periodos. Posteriormente se centrifug&oacute; nuevamente, se resuspendieron las bacterias en ABPF y se formaron los bloques como se indic&oacute; anteriormente.</font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2">&nbsp;</font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2"><b>Lisis celular</b></font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2">Este procedimiento fue adaptado a partir del trabajo de diversos autores (Chang y Taylor 1990, Barrett <i>et</i> al<b>.</b> 1994, Johnson <i>et al.</i> 1995, Matushek <i>et al.</i> 1996, Sheneman y Katz 2003). Los bloques de agarosa se colocaron dentro de microtubos con 1 mL de soluci&oacute;n de lisis (100mM Tris HCl, 100mM EDTA, 20 mM NaCl, 1 % SDS, pH&#8776;10.0) adicionados con lisozima (200 &#956;g/mL) y se incubaron durante 1 hora a 50 &deg;C; pasada la hora, se retir&oacute; la soluci&oacute;n de lisis y se lavaron los bloques dos veces con Tris&#45;EDTA (TE) (20 mM Tris HCl, 50 mM EDTA, pH&#8776;8.0), por 10 minutos para cada lavado. Despu&eacute;s se agreg&oacute; 1 mL de soluci&oacute;n de lisis (pH&#8776;7.5) adicionada con proteinasa K (0.05 &#956;g/mL) y se incub&oacute; durante 1 hora a 50 &deg;C, para nuevamente realizar los dos lavados bajo las mismas condiciones. Las muestras se conservaron en TE a 4 &deg;C.</font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2">&nbsp;</font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2"><b>Determinaci&oacute;n de rupturas de doble banda (RDB) por electroforesis de campos pulsados (PFGE)</b></font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2">En un gel de agarosa al 1 %, se introdujeron las muestras (bloques) en los pozos y se sell&oacute; cada uno de ellos con agarosa de bajo punto de fusi&oacute;n al 1 %. Como testigo se a&ntilde;adi&oacute; un marcador de peso molecular de ADN (Pulse Marker 0.1&#45;200kb&#45;Sigma&#45;). Se coloc&oacute; el gel en el equipo Chef&#45; Dr&#174; III (Bio&#45;Rad), </font><font face="verdana" size="2">se agreg&oacute; el amortiguador (TBE 0.5x) y se corri&oacute; por 18 horas a 6V con periodos de cambio de 40 segundos y &aacute;ngulo de 120&deg;. Posteriormente se ti&ntilde;&oacute; el gel con bromuro de etidio (0.5 (ig/mL) durante 30 minutos, se coloc&oacute; en un transiluminador de UV, se document&oacute; y se analiz&oacute; mediante el software Quantity One&#174; de Bio&#45;Rad, que permite medir la intensidad luminosa de cada carril respecto a una distancia relativa.</font></p>     <p align="justify"><font face="verdana" size="2">&nbsp;</font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2"><b>RESULTADOS Y DISCUSI&Oacute;N</b></font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2"><b>Microelectroforesis</b></font></p>  	    ]]></body>
<body><![CDATA[<p align="justify"><font face="verdana" size="2">La t&eacute;cnica original de microelectroforesis unicelular neutra en bacterias propone el uso del colorante fluorescente YOYO para te&ntilde;ir el ADN en las preparaciones; sin embargo, en nuestras condiciones experimentales y con las dosis utilizadas, las im&aacute;genes que se obten&iacute;an eran muy confusas; por ello se prob&oacute; en su lugar el bromuro de etidio. Bajo el microscopio se identificaron tres distintas morfolog&iacute;as <b>(<a href="/img/revistas/rica/v29n1/a5f1.jpg" target="_blank">Fig. 1</a>),</b> cuyo porcentaje variaba en funci&oacute;n de la dosis, que se utilizaron como par&aacute;metros para evaluar el grado de fragmentaci&oacute;n (rupturas dobles), as&iacute; como la reparaci&oacute;n de los da&ntilde;os. Para verificar que estas morfolog&iacute;as estaban asociadas a RDB se hicieron experimentos con la enzima de restricci&oacute;n <i>Xbal,</i> utilizando una concentraci&oacute;n relativamente baja (0.01 unidades por laminilla) y diferentes tiempos de incubaci&oacute;n (5, 10, 20 y 40 minutos). Se observaron las mismas morfolog&iacute;as que con la radiaci&oacute;n y que variaba la proporci&oacute;n de &eacute;stas conforme transcurr&iacute;a el tiempo de incubaci&oacute;n, lo que nos confirm&oacute; que dichas morfolog&iacute;as estaban asociadas a RDB.</font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2">En los diagramas de barras <b>(<a href="/img/revistas/rica/v29n1/a5f2.jpg" target="_blank">Fig. 2</a>)</b> se presentan los niveles de fragmentaci&oacute;n de ADN en funci&oacute;n de la dosis y el tiempo de incubaci&oacute;n postirradiaci&oacute;n. Al extremo izquierdo se aprecian dichos niveles de fragmentaci&oacute;n al tiempo 0 y se puede notar que en todas las cepas aumenta con la dosis. Cabe hacer notar que en los testigos sin irradiar hay ADN fragmentado lo que posiblemente se deba a que los cultivos est&aacute;n en fase de crecimiento logar&iacute;tmico y este da&ntilde;o aparente es reflejo de las rupturas que se producen durante la replicaci&oacute;n normal del ADN. A medida que pasa el tiempo y que hay oportunidad de eliminar el da&ntilde;o, se observa que en la cepa de referencia PQ30, las rupturas producidas por la radiaci&oacute;n gamma desaparecen gradualmente conforme aumenta el periodo de incubaci&oacute;n y a los 80 minutos incluso a la dosis m&aacute;s alta (100 Gy), pr&aacute;cticamente desaparecen. En cambio en todas las dem&aacute;s, especialmente en el mutante doble <b><i>recJ,xonA</i></b> y en la cepa deficiente en <b><i>recB</i></b> se observan en abundancia las morfolog&iacute;as lV y V que persisten al transcurrir el tiempo, lo que pone de manifiesto la importancia de todos estos genes en la reparaci&oacute;n de RDB. Como era de esperarse, en la cepa <b><i>recB</i></b> no hay una reparaci&oacute;n importante ni siquiera al tiempo de incubaci&oacute;n mayor, ya que el producto de este gen es el encargado del inicio del proceso de recombinaci&oacute;n. A la dosis m&aacute;s alta, el porcentaje de c&eacute;lulas que han reparado el da&ntilde;o coincide con los datos de letalidad ya existentes en el laboratorio <b>(<a href="#f3">Fig. 3</a>),</b> lo que apoya la idea de que los cometas efectivamente reflejan RDB y que son estas lesiones no reparadas las responsables de la muerte celular.</font></p>  	    <p align="center"><font face="verdana" size="2"><a name="f3"></a></font></p>  	    <p align="center"><font face="verdana" size="2"><img src="/img/revistas/rica/v29n1/a5f3.jpg"></font></p>     <p align="justify"><font face="verdana" size="2">En la cepa defectuosa en <b><i>recO</i></b> se observa que a los 80 minutos de incubaci&oacute;n hay una disminuci&oacute;n importante en la frecuencia de las morfolog&iacute;as asociadas a fragmentaci&oacute;n, si bien no es tan marcada como en la cepa silvestre. El producto de <b><i>recO</i></b> forma parte del complejo enzim&aacute;tico RecFOR, que desplaza a la enzima SSB cuando se une a ADN de una hebra y promueve la entrada de RecA para que pueda llevarse a cabo la recombinaci&oacute;n. Esto sugiere que, si bien s&iacute; tiene una participaci&oacute;n en la eliminaci&oacute;n de RDB, la v&iacute;a RecF no es la principal opci&oacute;n para reparar RDB. En las cepas <b><i>recJ</i></b> o <b><i>xonA</i></b> tambi&eacute;n se observa reparaci&oacute;n, sin embargo esto ocurre m&aacute;s lentamente que en PQ30 (wt) o IN237 (recO). Ambos genes codifican para exonucleasas que est&aacute;n involucradas en diversos procesos de reparaci&oacute;n, como la reparaci&oacute;n por escisi&oacute;n de bases o en eventos de recombinaci&oacute;n. Se ha propuesto que el producto de estos genes "rasura" RDB con extremos disparejos para que las pueda reconocer RecBCD. El que no act&uacute;en estas enzimas retrasa considerablemente el proceso de reparaci&oacute;n, sin embargo la c&eacute;lula es capaz de sobreponerse. El doble mutante <b><i>recJxonA</i></b> (IN901) confirma lo anterior, ya que se observa un comportamiento similar al de la cepa <b><i>recB,</i></b> lo que apoya la idea de la participaci&oacute;n de estas exonucleasas en la preparaci&oacute;n del sustrato para RecBCD.</font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2">&nbsp;</font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2"><b>Electroforesis de campos pulsados</b></font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2">Para evaluar estos experimentos se tom&oacute; la intensidad de fluorescencia por carril y se calcul&oacute; la distribuci&oacute;n del porcentaje en tres diferentes regiones conforme a lo reportado por Handa y Kobayashi (2001) y que corresponde a tres tipos de conformaci&oacute;n de ADN de acuerdo con la regi&oacute;n del gel en la que se encuentre: Circular, ADN lineal de alto peso molecular y fragmentos de ADN <b>(<a href="/img/revistas/rica/v29n1/a5f4.jpg" target="_blank">Fig. 4</a>).</b> El ADN circular se queda atrapado en las ramificaciones de la agarosa en el momento de formarse los bloques (Beverly 1988, Birren y Lai 1993); el ADN lineal de alto peso molecular (DLAPM) como consecuencia de una ruptura doble sale de los pozos y forma una banda muy ancha e intensa un poco m&aacute;s adelante, mientras que los fragmentos m&aacute;s peque&ntilde;os migran m&aacute;s all&aacute; a lo largo del carril (Kusano <i>et al.</i> 1995, Naito <i>et al.</i> 1995).</font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2">En los experimentos sin incubaci&oacute;n podemos observar que el grado de fragmentaci&oacute;n aumenta conforme aumenta la dosis de exposici&oacute;n para todas las cepas; sin embargo, se observa una diferencia entre las cepas de acuerdo con el gen de reparaci&oacute;n defectuoso. As&iacute;, la cepa con menor fragmentaci&oacute;n fue la silvestre, mientras que la que presenta mayor grado de fragmentaci&oacute;n fue IN602, defectuosa en <b><i>recB,</i></b> lo que sugiere que ya desde el principio ha ocurrido cierto grado de reparaci&oacute;n <b>(<a href="#f5">Fig. 5</a>).</b> Esto concuerda con reportes anteriores que indican que estos mecanismos de recombinaci&oacute;n se encuentran presentes dentro de la bacteria como genes "de mantenimiento" <i>(housekeeping)</i> y empiezan a funcionar en el momento mismo en que ocurre una lesi&oacute;n (Kuzminov 1999, Cox <i>et al.</i> 2000).</font></p>  	    <p align="center"><font face="verdana" size="2"><a name="f5"></a></font></p>  	    ]]></body>
<body><![CDATA[<p align="center"><font face="verdana" size="2"><img src="/img/revistas/rica/v29n1/a5f5.jpg"></font></p>     <p align="justify"><font face="verdana" size="2">En cuanto a los experimentos de cin&eacute;tica de reparaci&oacute;n, los resultados de las electroforesis en campos pulsados nos muestran un comportamiento muy similar a lo observado en la microelectroforesis. En la <b><a href="/img/revistas/rica/v29n1/a5f6.jpg" target="_blank">figura 6</a></b> se observa que al aumentar el tiempo de incubaci&oacute;n postirradiaci&oacute;n, la intensidad a lo largo del carril disminuye y se concentra en ciertas zonas (bandas), lo que indica la reparaci&oacute;n de las RDB. En la cepa silvestre (PQ30) la intensidad es menor con respecto a las dem&aacute;s, pues al poseer todos sus mecanismos de recombinaci&oacute;n intactos, es capaz de reparar eficientemente las lesiones y eliminar casi por completo las rupturas.</font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2">Para la cepa IN237 <b><i>recO</i></b> puede verse que para las dosis m&aacute;s altas (100 y 150Gy) y al tiempo de incubaci&oacute;n m&aacute;s corto, la intensidad es alta y al aumentar el tiempo, su intensidad disminuye dr&aacute;sticamente. Esto confirma lo reportado recientemente por Handa y colaboradores (2009), en donde a partir de extractos de las diferentes prote&iacute;nas pertenecientes a la v&iacute;a RecF sugieren que RecO junto con RecR, RecF y RecJ pueden participar en la reparaci&oacute;n de rupturas dobles de un modo similar al que realiza el grupo epist&aacute;tico Rad52 en levaduras y otros eucariontes. Los autores proponen que Rad52 y RecO son hom&oacute;logos funcionales ya que facilitan el reconocimiento y uni&oacute;n de RecA o de su hom&oacute;logo Rad51 sobre ADN de cadena sencilla sustituyendo a SSB (o RPA) con lo que se genera un filamento nucleoprot&eacute;ico que permite la recombinaci&oacute;n hom&oacute;loga y por ende la reparaci&oacute;n de rupturas dobles. Del mismo modo parece haber una similitud entre las funciones de RecF y RecR y las de Rad55/57, as&iacute; como de RecJ y ExoI.</font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2">En las cepas con defectos en las exonucleasas de cadena sencilla RecJ (IN400) y ExoI (IN900), se observa un efecto muy similar entre s&iacute;. A los 20 minutos de incubaci&oacute;n a&uacute;n permanece una buena parte de las rupturas, pues la fragmentaci&oacute;n de ADN es muy notoria (intensidad); sin embargo, a pesar de que la reparaci&oacute;n es m&aacute;s lenta se puede apreciar que en el periodo de incubaci&oacute;n m&aacute;s largo las bacterias logran eliminar la mayor parte de las rupturas. En el mutante doble <b><i>recJ, xonA</i></b> (IN901) se observa un sinergismo dado por ambos defectos, de manera que ni a&uacute;n en el tiempo de incubaci&oacute;n m&aacute;s largo se eliminan las rupturas. Una limitante para el complejo enzim&aacute;tico RecBCD es que s&oacute;lo reconoce rupturas dobles parejas, as&iacute; que para poder reparar las que no tienen este tipo de estructura, es necesario que tales extremos colgantes se emparejen y tal es la actividad que al parecer llevan a cabo exonucleasas como ExoI (xonA) y RecJ <b><i>(recJ)</i></b> (Thoms y Wackernagel, 1998). Los resultados con el mutante doble <b><i>recJ, xonA</i></b> IN901 apoyan lo anterior pues se observa que la intensidad de los carriles correspondientes a las dosis de 100 y 150 Gy son muy altas (similares a las observadas en IN602 <b><i>recB)</i></b> y no disminuye con el tiempo de incubaci&oacute;n, lo que indica que el da&ntilde;o no se elimina. Esto concuerda con los datos de supervivencia en los que se puede ver que al faltar ambas enzimas aumenta notablemente la letalidad con respecto a la cepa silvestre.</font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2">En la cepa IN602 se observa que la reparaci&oacute;n del da&ntilde;o es muy deficiente incluso a los tiempos de incubaci&oacute;n m&aacute;s prolongados (60 minutos), lo que pone de manifiesto la importancia que tiene <b><i>recB</i></b> en la reparaci&oacute;n de este tipo de lesiones. En <i>Escherichia coli</i> la reparaci&oacute;n de rupturas dobles se lleva a cabo principalmente por el mecanismo de recombinaci&oacute;n hom&oacute;loga, de tal modo que el ADN se restaura en la forma correcta y no se generan translocaciones en las que tambi&eacute;n se logra restaurar la continuidad de la mol&eacute;cula pero de una manera incorrecta. Los extremos de ADN en las rupturas dobles se unen en la forma correcta a trav&eacute;s de la participaci&oacute;n de regiones de ADN hom&oacute;logas no da&ntilde;adas. En t&eacute;rminos generales el proceso ocurre as&iacute;: RecBCD se une a uno de los extremos de la ruptura doble y comienza a degradar la cadena de ADN (liberando nucle&oacute;tidos si es en el extremo 3' &oacute; bien oligonucle&oacute;tidos si es en el 5') hasta encontrar una secuencia espec&iacute;fica conocida como sitio X. A partir de aqu&iacute; se inactiva RecD y RecBC sigue funcionando como helicasa que en el extremo 3' promueve la entrada de RecA formando un filamento nucleoprot&eacute;ico que se puede intercambiar con la secuencia hom&oacute;loga de otra mol&eacute;cula de ADN de cadena doble (Anderson y Kowalczykowski 1997, Dillingham y Kowalczykowski 2008). As&iacute;, la cepa <b><i>recB</i></b> IN602 tiene sensibilidad muy alta a la radiaci&oacute;n gamma, debido a que es incapaz de iniciar este proceso de recombinaci&oacute;n hom&oacute;loga, lo que coincide con reportes previos (Sargentini y Smith 1986, Brcic&#45;Kostic <i>et al.</i> 1991)</font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2">Dentro de la bacteria con frecuencia se producen rupturas de doble banda durante la replicaci&oacute;n del ADN y para que se reinicie este preceso es necesaria la participaci&oacute;n de los diferentes sistemas de recombinaci&oacute;n, por lo que, como se hab&iacute;a mencionado antes, se considera a &eacute;stos como de mantenimiento. Las deficiencias en estos sistemas hacen que la reactivaci&oacute;n de las horquillas de replicaci&oacute;n, y por lo tanto el crecimiento de los cultivos, sea m&aacute;s lenta en relaci&oacute;n con una cepa silvestre. En la <b><a href="#f7">figura 7</a></b> se muestra la cin&eacute;tica de crecimiento de cultivos sin irradiar de las diferentes cepas utilizadas. Durante su progresi&oacute;n las horquillas de duplicaci&oacute;n frecuentemente encuentran lesiones que las inactivan; &eacute;stas aparecen ya sea durante condiciones normales de crecimiento aerobio o bien por la exposici&oacute;n a agentes que da&ntilde;an al ADN. Cuando son cortes en la cadena se convierten en rupturas dobles que son reparadas principalmente por la v&iacute;a RecBCD, mientras que si encuentran otro tipo de lesiones, estas podr&iacute;an detener la actividad de la polimerasa III de modo que se formar&iacute;a un hueco que ser&iacute;a reparado principalmente por la v&iacute;a RecFOR. En ambos casos intervendr&iacute;an mecanismos de recombinaci&oacute;n ya sea para reparar la ruptura doble o bien para reactivar las horquillas y reiniciar la s&iacute;ntesis de ADN. Los defectos en genes de las distintas v&iacute;as de recombinaci&oacute;n suponen un retardo en la reactivaci&oacute;n de las horquillas (o incluso la muerte de las c&eacute;lulas) lo que llevar&iacute;a un retardo en el crecimiento de los cultivos. La ausencia de RecO hace que los huecos (gaps) permanezcan por m&aacute;s tiempo y que eventualmente se conviertan en RDB que finalmente podr&iacute;an repararse por la v&iacute;a RecBCD.</font></p> 	    <p align="center"><a name="f7"></a></p> 	    <p align="center"><img src="/img/revistas/rica/v29n1/a5f7.jpg"></p>      <p align="justify"><font face="verdana" size="2">En el caso de las exonucleasas (RecJ y ExoI), estas pueden intervenir tanto en el caso de rupturas dobles, procesando extremos disparejos que no pudiera reconocer la enzima RecBCD, como en el caso de la aparici&oacute;n de cortes o huecos, extendiendo las regiones de ADN de banda sencilla para que se puedan reparar y reactivar. Se ha propuesto tambi&eacute;n que intervienen en la reactivaci&oacute;n por regresi&oacute;n de la horquilla, de modo que las deficiencias en estos genes retardan el crecimiento de los cultivos (Cox 2001). La importancia de cada uno de los defectos propuesta en el presente trabajo coincide con el retardo en la cin&eacute;tica de crecimiento, as&iacute; como con los datos de supervivencia, lo que refleja la importancia de los genes defectuosos en la reparaci&oacute;n de rupturas dobles.</font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2">&nbsp;</font></p>  	    ]]></body>
<body><![CDATA[<p align="justify"><font face="verdana" size="2"><b>CONCLUSIONES</b></font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2">El empleo de la t&eacute;cnica de electroforesis por pulsos es un m&eacute;todo adecuado para demostrar la formaci&oacute;n de rupturas de doble banda en el ADN, inducidas por la radiaci&oacute;n gamma, pues los resultados encontrados concuerdan perfectamente con los resultados reportados en el experimento realizado empleando la t&eacute;cnica de microelectroforesis neutra (ensayo cometa). La electroforesis por campos pulsados tiene la ventaja de ser un m&eacute;todo relativamente m&aacute;s sencillo ya que es m&aacute;s f&aacute;cil la manipulaci&oacute;n de las muestras y en consecuencia el tiempo empleado en su ejecuci&oacute;n es considerablemente menor.</font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2">La respuesta celular al da&ntilde;o depende de la dosis empleada, el estado de la c&eacute;lula y los mecanismos de los que se valga para resarcir el da&ntilde;o; as&iacute; por ejemplo, a una dosis mayor de radiaci&oacute;n y con una pobre recombinaci&oacute;n, la c&eacute;lula tiene menos posibilidades de tolerar el da&ntilde;o, pues se genera una mayor cantidad de RDB que no pueden ser reparadas debido a la deficiencia en sus mecanismos de reparaci&oacute;n, dando por resultado una mayor letalidad.</font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2">Finalmente puede decirse que la importancia de los genes implicados en la reparaci&oacute;n de rupturas dobles tiene el siguiente orden, de mayor a menor: <b>recB&gt;xonA/recJ&gt;xonA&gt;recJ&gt;recO.</b> De ello se puede concluir que, si bien, las diversas v&iacute;as de recombinaci&oacute;n act&uacute;an preferentemente sobre un tipo espec&iacute;fico de estructuras en el ADN, en la realidad esas v&iacute;as son capaces de interactuar unas con otras para lograr la supervivencia de la c&eacute;lula.</font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2">&nbsp;</font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2"><b>AGRADECIMIENTOS</b></font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2">Los autores agradecen a la C. Alicia Hern&aacute;ndez Arenas por la valiosa ayuda t&eacute;cnica durante el desarrollo de esta investigaci&oacute;n. Este trabajo est&aacute; dedicado a la memoria de la M. en C. Matilde Bre&ntilde;a Valle, quien fuera Jefe del Departamento de Biolog&iacute;a del Instituto Nacional de Investigaciones Nucleares.</font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2">&nbsp;</font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2"><b>REFERENCIAS</b></font></p>  	    <!-- ref --><p align="justify"><font face="verdana" size="2">Averbeck D., Testard I. y Boucher D. (2006). Changing views in ionizing radiation&#45;induced cellular effects. Int. J. Low Radiation 3, 117&#45;134.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=7218289&pid=S0188-4999201300010000500001&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></font></p>  	    <!-- ref --><p align="justify"><font face="verdana" size="2">Barrett T.J., Lior H., Green J.H., Khakhria R., Wells J.G., Bell B.P., Greene K.D., Lewis J. y Griffin P.M. (1994). Laboratory investigation of a multistate food&#45;borne outbreak of <i>Escherichia coli</i> O157:H7 by using pulsed&#45;field gel electrophoresis and phage typing. J. Clin. Microbiol. 32, 3013&#45;3017.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=7218291&pid=S0188-4999201300010000500002&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></font></p>  	    <!-- ref --><p align="justify"><font face="verdana" size="2">Beverley S.M. (1988). Characterization of the 'unusual' mobility of large circular ADNs in pulsed field&#45;gradient electrophoresis. NAR 16, 925&#45;939.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=7218293&pid=S0188-4999201300010000500003&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></font></p>  	    <!-- ref --><p align="justify"><font face="verdana" size="2">Br&#269;i&#263; &#45;Kosti&#263; K., Salaj&#45;Smic E., Marsi&#263; N., Kaji&#263; S., Stojiljkovic I. y Trgov&#269;evi&#263; Z . (1991). Interaction of RecBCD enzyme with ADN damaged by gamma radiation. Mol. Gen. Genet. 228, 136&#45;142.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=7218295&pid=S0188-4999201300010000500004&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></font></p>      <!-- ref --><p align="justify"><font face="verdana" size="2">Bre&ntilde;a M. y Serment J. (1998). SOS induction by gamma radiation in <i>E. coli</i> strains defective in repair and or recombination mechanisms. Mutagenesis 13, 637&#45;641.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=7218297&pid=S0188-4999201300010000500005&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></font></p>  	    <!-- ref --><p align="justify"><font face="verdana" size="2">Cox M. (2001). Recombinational ADN repair of damaged replication forks in <i>Escherichia coli:</i> questions. Annu. Rev. Genet. 35, 53&#45;82.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=7218299&pid=S0188-4999201300010000500006&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></font></p>  	    <!-- ref --><p align="justify"><font face="verdana" size="2">Cox M., Goodman M., Kreuzer K., Sherrat D., Sandler S. y Marians K. (2000). The importance of repairing stalled replication forks. Nature 404, 38&#45;41.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=7218301&pid=S0188-4999201300010000500007&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></font></p>  	    <!-- ref --><p align="justify"><font face="verdana" size="2">Dillingham M.S. y Kowalczykowski S.C. (2008). RecBCD enzyme and the repair of double&#45;stranded ADN breaks. Microbiol. Mol. Biol. Rev. 72, 642&#45;671.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=7218303&pid=S0188-4999201300010000500008&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></font></p>  	    <!-- ref --><p align="justify"><font face="verdana" size="2">Game J.C., Sitney K.C., Cook V.E. y Mortimer R.K. (1989). Use of a ring chromosome and pulsed&#45;field gels to study interhomolog recombination, double&#45;strand ADN breaks and sister&#45;chromatid exchange in yeast. Genetics 123, 695&#45;713.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=7218305&pid=S0188-4999201300010000500009&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></font></p>  	    <!-- ref --><p align="justify"><font face="verdana" size="2">Handa N. y Kobayashi I. (2003) Accumulation of large non&#45;circular forms of the chromosome in recombination&#45;defective mutants of <i>Escherichia coli.</i> BMC Molecular Biology doi:10.1186/1471&#45;2199&#45;4&#45;5.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=7218307&pid=S0188-4999201300010000500010&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></font></p>  	    <!-- ref --><p align="justify"><font face="verdana" size="2">Handa N., Morimatsu K., Lovett S.T. y Kowalczykowski S.C. (2009). Reconstitution of initial steps of dsADN break repair by the RecF pathway of <i>E. coli.</i> Gene. Dev. 23, 1234&#45;1245.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=7218309&pid=S0188-4999201300010000500011&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></font></p>  	    <!-- ref --><p align="justify"><font face="verdana" size="2">Johnson J.M., Weagant S.D., Jinneman K.C., Bryant J.L. (1995). Use of pulsed&#45;field gel electrophoresis for epidemiological study of <i>Escherichia coli</i> O157:H7 during a food&#45;borne outbreak. App. Env. Microbiol. 61, 2806&#45;2808.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=7218311&pid=S0188-4999201300010000500012&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></font></p>  	    <!-- ref --><p align="justify"><font face="verdana" size="2">Kusano K., Naito T., Handa N. y Kobayashi I. (1995). Restriction&#45;modification systems as genomic parasites in competition for specific sequences. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 92, 11095&#45;11099.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=7218313&pid=S0188-4999201300010000500013&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></font></p>  	    <!-- ref --><p align="justify"><font face="verdana" size="2">Kuzminov A. (1999). Recombinational repair of ADN damage in <i>Escherichia coli</i> and bacteriophage l. Microbiol. Mol. Biol. Rev. 63, 751&#45;813.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=7218315&pid=S0188-4999201300010000500014&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></font></p>  	    <!-- ref --><p align="justify"><font face="verdana" size="2">Matushek M.G., Bonten M.J. M. y Hayden M.K. (1996). Rapid preparation of bacterial ADN for pulsed&#45;field gel electrophoresis. J. Clin. Microbiol. 34, 2598&#45;2600.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=7218317&pid=S0188-4999201300010000500015&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></font></p>  	    <!-- ref --><p align="justify"><font face="verdana" size="2">Chang N. y Taylor D.E. (1990). Use of pulsed&#45;field agarose gel electrophoresis to size genomes of <i>Campylobacter</i> species and to construct a SalI map of <i>Campylobacter jejuni</i> UA580. J. Bacteriol. 172, 5211&#45;5217.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=7218319&pid=S0188-4999201300010000500016&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></font></p>  	    <!-- ref --><p align="justify"><font face="verdana" size="2">Naito T., Kusano K. y Kobayashi I. (1995). Selfish behavior of restriction&#45;modification systems. Science, 267, 897&#45;899</font>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=7218321&pid=S0188-4999201300010000500017&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><p align="justify"><font face="verdana" size="2">Quillardet P. y Hofnung M. (1985). The SOS chromotest, a colorimetric bacterial assay for genotoxins: procedures. Mutat. Res. 147, 65&#45;78.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=7218322&pid=S0188-4999201300010000500018&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></font></p>  	    <!-- ref --><p align="justify"><font face="verdana" size="2">Singh N.P., Stephens R.E., Singh H. y Lai H. (1999). Visual quantification of ADN double&#45;strand breaks in bacteria. Mutat. Res. 429, 159&#45;168.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=7218324&pid=S0188-4999201300010000500019&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></font></p>  	    <!-- ref --><p align="justify"><font face="verdana" size="2">Sargentini N.J. y Smith K.C. (1986). Quantitation of the involvement of the <i>recA, recB, recC, recF, recJ, recN, lexA, radA, radB, uvrD,</i> and <i>umuC</i> genes in the repair of X&#45;ray&#45;induced ADN double&#45;strand breaks in <i>Escherichia coli.</i> Radiat. Res. 107, 58&#45;72.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=7218326&pid=S0188-4999201300010000500020&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></font></p>  	    <!-- ref --><p align="justify"><font face="verdana" size="2">Serment&#45;Guerrero J., Bre&ntilde;a&#45;Valle M. y Espinosa&#45;Aguirre, J.J. (2008). <i>In vivo</i> role of <i>Escherichia coli</i> single&#45;strand exonucleases in SOS induction by gamma radiation. Mutagenesis 23, 317&#45;323.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=7218328&pid=S0188-4999201300010000500021&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></font></p>  	    ]]></body>
<body><![CDATA[<!-- ref --><p align="justify"><font face="verdana" size="2">Sheneman D.E. y Katz D.S. (2003). An inexpensive sample mold for pulsed&#45;field electrophoresis. J. Microbiol. Meth. 53, 127&#45;129.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=7218330&pid=S0188-4999201300010000500022&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></font></p>  	    <!-- ref --><p align="justify"><font face="verdana" size="2">T&eacute;oule R. (1987) Radiation&#45;induced ADN damage and its repair. Int. J. Radiat. Biol. Relat. Stud. Phys. Chem. Med. 51, 573&#45;589.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=7218332&pid=S0188-4999201300010000500023&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></font></p>  	    <!-- ref --><p align="justify"><font face="verdana" size="2">Thoms B. y Wackernagel W. (1998). Interaction of RecBCD enzyme with ADN at double&#45;strand breaks produced in UV&#45;irradiated <i>Escherichia coli:</i> requirement for ADN end processing. J. Bacteriol. 180, 5639&#45;5645.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=7218334&pid=S0188-4999201300010000500024&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></font></p>  	    <!-- ref --><p align="justify"><font face="verdana" size="2">Umezu K. y Kolodner R. (1993). Biochemical interaction of the <i>Escherichia coli</i> RecF, RecO, and RecR proteins with RecA protein and single&#45;stranded ADN binding protein. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 90, 3875&#45;3879.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=7218336&pid=S0188-4999201300010000500025&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></font></p>  	    <!-- ref --><p align="justify"><font face="verdana" size="2">Umezu K. y Kolodner R. (1994). Protein interactions in genetic recombination in <i>Escherichia coli:</i> interactions involving RecO and RecR overcome the inhibition of RecA by single&#45;stranded ADN binding protein. J. Biol. Chem. 269, 30005&#45;30013.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=7218338&pid=S0188-4999201300010000500026&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></font></p>     ]]></body>
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