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<article-title xml:lang="es"><![CDATA[Identificación del agente causal de la pudrición basal del tallo de vainilla en cultivos bajo cobertizos en Colombia]]></article-title>
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<abstract abstract-type="short" xml:lang="es"><p><![CDATA[El cultivo de vainilla (Vanilla planifolia) es una actividad agroindustrial promisoria, de alto valor agregado para el sector rural colombiano. Sin embargo, el nivel de conocimiento que se tiene sobre su manejo agronómico y en especial fitosanitario es muy incipiente. Uno de los problemas que afecta los planes de expansión de este cultivo, es la pudrición basal del tallo. Por tal razón se planteó la presente investigación con el objetivo de determinar el agente causal de esta enfermedad en plantaciones de vainilla bajo cobertizos de techo sombra en el occidente de Antioquia. A partir de tejido de tallo infectado se obtuvieron 20 aislamientos, cinco de los cuales fueron seleccionados para realizar pruebas de patogenicidad. Los resultados indicaron que el agente causal de la pudrición basal de las plantas de vainilla en Colombia corresponde al hongo Fusarium oxysporum f. sp. vanillae. Adicionalmente, se identificaron los hongos Phoma sp., Lasiodiplodia sp. y Bionectria sp., siendo necesario en el futuro determinar si están asociados a alguna patología de este cultivo. Se espera que los resultados de este estudio sirvan de base para el establecimiento de un programa de manejo integrado de enfermedades que conduzca al aumento del área de siembra de esta orquídea en Colombia.]]></p></abstract>
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</front><body><![CDATA[  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="4">Contribuciones</font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2">&nbsp;</font></p>  	    <p align="center"><font face="verdana" size="4"><b>Identificaci&oacute;n del agente causal de la pudrici&oacute;n basal del tallo de vainilla en cultivos bajo cobertizos en Colombia</b></font></p>  	    <p align="center"><font face="verdana" size="2">&nbsp;</font></p>  	    <p align="center"><font face="verdana" size="3"><b>Identification of the causal agent of vanilla basal stem rot in crops under greenhouse shed conditions from Colombia</b></font></p>  	    <p align="center"><font face="verdana" size="2">&nbsp;</font></p>  	    <p align="center"><font face="verdana" size="2"><b>Carolina Santa Cardona<sup>1</sup> Mauricio Mar&iacute;n Montoya<sup>1</sup> Mar&iacute;a Claudia D&iacute;ez<sup>2</sup></b></font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2">&nbsp;</font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2">&nbsp;</font></p>  	    ]]></body>
<body><![CDATA[<p align="justify"><font face="verdana" size="2"><sup><i>1</i></sup> <i>Laboratorio de Biolog&iacute;a Celular y Molecular, Facultad de Ciencias, Universidad Nacional de Colombia Sede Medell&iacute;n, Calle 59A No 63 &#45;20, Medell&iacute;n, Colombia.</i></font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2"><i><sup>2</sup> Departamento de Ciencias Forestales, Facultad de Ciencias Agropecuarias, Universidad Nacional de Colombia Sede Medell&iacute;n, Calle 59A No 63 &#45; 20, Medell&iacute;n Colombia</i></font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2">&nbsp;</font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2"><b>*Autor para correspondencia: <i>    <br></i></b>Mauricio Mar&iacute;n Montoya <a href="mailto:mamarinm@unal.edu.co">mamarinm@unal.edu.co</a></font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2">&nbsp;</font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2">Recibido 24 de febrero 2012;    <br> 	Aceptado 2 de mayo 2012.</font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2">&nbsp;</font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2"><b>Abstract</b></font></p>  	    ]]></body>
<body><![CDATA[<p align="justify"><font face="verdana" size="2">Due to its high added value, vanilla (Vanilla planifolia) is a promising crop for the colombian agroindustry. Unfortunately, there is very little knowledge on the agronomical and phytosanitary management of this plant. One of the main issues concerning this crop is the basal stem rot. The objective of this work was to determine the causal agent of this disease in vanilla plantations under greenhouse shed conditions in western Antioquia. A total of 20 fungal isolates were obtained from infected stems and five of them were used in pathogenicity tests. Our results suggest that Fusarium oxysporum f. sp. vanillae is the causal agent of basal stem rot in Colombia. Phoma sp., Lasiodiplodia sp. and Bionectria sp. were also identified as associated to vanilla crops; future work should address their involvement in disease. This work will serve as the basis of plant disease management programs aimed at increasing the cultivated area of this orchid in Colombia.</font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2">    <br> 	<b>Key words:</b> <i>Vanilla planifolia</i>, <i>Fusarium oxysporum</i>, molecular identification, morphological identification, sequencing.</font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2">&nbsp;</font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2"><b>Resumen</b></font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2">El cultivo de vainilla (Vanilla planifolia) es una actividad agroindustrial promisoria, de alto valor agregado para el sector rural colombiano. Sin embargo, el nivel de conocimiento que se tiene sobre su manejo agron&oacute;mico y en especial fitosanitario es muy incipiente. Uno de los problemas que afecta los planes de expansi&oacute;n de este cultivo, es la pudrici&oacute;n basal del tallo. Por tal raz&oacute;n se plante&oacute; la presente investigaci&oacute;n con el objetivo de determinar el agente causal de esta enfermedad en plantaciones de vainilla bajo cobertizos de techo sombra en el occidente de Antioquia. A partir de tejido de tallo infectado se obtuvieron 20 aislamientos, cinco de los cuales fueron seleccionados para realizar pruebas de patogenicidad. Los resultados indicaron que el agente causal de la pudrici&oacute;n basal de las plantas de vainilla en Colombia corresponde al hongo Fusarium oxysporum f. sp. vanillae. Adicionalmente, se identificaron los hongos Phoma sp., Lasiodiplodia sp. y Bionectria sp., siendo necesario en el futuro determinar si est&aacute;n asociados a alguna patolog&iacute;a de este cultivo. Se espera que los resultados de este estudio sirvan de base para el establecimiento de un programa de manejo integrado de enfermedades que conduzca al aumento del &aacute;rea de siembra de esta orqu&iacute;dea en Colombia.</font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2"><b>Palabras clave:</b> <i>Vanilla planifolia</i>, <i>Fusarium oxysporum</i>, identificaci&oacute;n molecular, identificaci&oacute;n morfol&oacute;gica, secuenciaci&oacute;n.</font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2">&nbsp;</font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2"><b>Introducci&oacute;n</b></font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2">El g&eacute;nero <i>Vanilla</i> pertenece a la familia Orchidaceae, la cual consta de m&aacute;s de 110 especies (Bory <i>et al.,</i> 2008), destac&aacute;ndose por su importancia econ&oacute;mica <i>Vanilla planifolia</i> Andrews, <i>V. tahitensis</i> J.W. Moore y <i>V. pompona</i> Schiede, las cuales se cultivan comercialmente para la producci&oacute;n de extractos de vainilla natural, el saborizante m&aacute;s utilizado en la industria alimenticia y la segunda especia de mayor costo en el mercado mundial despu&eacute;s del azafr&aacute;n (Havkin&#45;Frenkel y Dorn, 1997). Este cultivo es afectado por diferentes enfermedades, incluyendo pudriciones basales, marchitamientos vasculares, necrosis y tizones foliares, antracnosis, manchas de frutos y diversas virosis. Estudios realizados en varios pa&iacute;ses asi&aacute;ticos y africanos, han determinado la presencia de una gran variedad de hongos y oomycetes asociados a dichas sintomatolog&iacute;as, entre los que se destacan: <i>Phytophthora meadii, Fusarium oxysporum, Calospora vanillae, Sclerotium</i> sp., <i>Colletotrichum gloeosporioides, Colletotrichum vanilla</i> y <i>Cylindrocladium quinquiseptatum,</i> entre otros (Thomas y Sussela, 2001; Bhai y Dhanesh, 2008; Pinaria <i>et al.,</i> 2010). Adicionalmente, se han reportado diferentes enfermedades virales causadas por <i>Cucumovirus</i> y <i>Potyvirus,</i> que causan afecciones severas en el tejido foliar y en las vainas, causando una reducci&oacute;n significativa en el rendimiento de los cultivos de vainilla (Richard <i>et al.,</i> 2009).</font></p>  	    ]]></body>
<body><![CDATA[<p align="justify"><font face="verdana" size="2">En Colombia, se tienen registros de la presencia de poblaciones nativas de <i>V. planifolia</i> en los bosques de la regi&oacute;n del Pac&iacute;fico, Urab&aacute;, la costa Atl&aacute;ntica, los valles interandinos y la cuenca Amaz&oacute;nica (Ordo&ntilde;ez <i>et al.,</i> 2011), as&iacute; como de cultivos comerciales en algunos municipios de la regi&oacute;n de Urab&aacute; y el occidente antioque&ntilde;o, en sistemas agroforestales y cobertizos de techo&#45;sombra. Sin embargo, el nivel de conocimiento que se tiene en el pa&iacute;s sobre las diferentes variables agron&oacute;micas de este cultivo, es muy incipiente. Uno de los aspectos menos estudiados son los fitosanitarios, desconoci&eacute;ndose los agentes causales responsables de las diferentes enfermedades que afectan este cultivo. Ya que uno de los problemas m&aacute;s limitantes de la producci&oacute;n comercial de vainilla bajo condiciones de cobertizos de techo&#45;sombra en Colombia es la pudrici&oacute;n basal del tallo, en esta investigaci&oacute;n se determin&oacute; el agente causal de esta enfermedad en plantaciones del occidente del departamento de Antioquia, a partir de la identificaci&oacute;n molecular de aislamientos de hongos asociados a los s&iacute;ntomas de la enfermedad y del seguimiento de los postulados de Koch.</font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2">&nbsp;</font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2"><b>Materiales y m&eacute;todos</b></font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2"><b>Obtenci&oacute;n de muestras</b></font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2">Se seleccionaron porciones de tallo de 25 plantas con s&iacute;ntomas de pudrici&oacute;n basal en pl&aacute;ntulas de seis meses y plantas en plena producci&oacute;n, establecidas en cultivos de vainilla bajo cobertizos de techo&#45;sombra en el municipio de Sopetr&aacute;n (Antioquia) (coordenadas 6&deg;29'52.94" N y 75&deg;43'42.71" O, altitud 1052 msnm, temperatura promedio 26.8&deg;C y precipitaci&oacute;n promedio 1243 mm/a&ntilde;o). Las muestras se desinfestaron con una soluci&oacute;n de hipoclorito de sodio al 1% durante 1 min, posteriormente se enjuagaron con agua destilada est&eacute;ril y con un bistur&iacute; se extrajeron fragmentos de aproximadamente 0.5 cm<sup>2</sup> de la zona de avance de la enfermedad. Cuatro de estos fragmentos se colocaron en cajas de Petri con medio de cultivo papa dextrosa agar (PDA). Las cajas se incubaron a temperatura ambiente y en condiciones de oscuridad durante 8&#45;15 d&iacute;as.</font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2">&nbsp;</font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2"><b>Extracci&oacute;n de DNA&nbsp;</b></font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2">Cada aislamiento purificado se coloc&oacute; en matraces conteniendo 20 mL de medio l&iacute;quido extracto de malta al 2% (ME), y se mantuvieron bajo las condiciones descritas previamente durante 16&#45;20 d&iacute;as. El micelio obtenido despu&eacute;s de este tiempo se utiliz&oacute; para realizar las extracciones de DNA por los m&eacute;todos: CTAB 3X y kit DNeasy Plant mini (Qiagen, EUA). En el primer caso se utilizaron 200 mg de micelio macerado con nitr&oacute;geno l&iacute;quido, colocados en tubos eppendorf de 1,5 mL y se le adicionaron 400 &#956;L de buffer CTAB 3X de acuerdo al protocolo descrito por Doyle y Doyle (1990). Para el caso de la extracci&oacute;n de DNA con kit DNeasy Plant mini, se utilizaron 100 mg de micelio macerado, y se prosigui&oacute; con las instrucciones del fabricante. La integridad del DNA se determin&oacute; por electroforesis en gel de agarosa al 1% suplementado con bromuro de etidio (10 mg/mL). Los geles se fotodocumentaron con el sistema digital Bio Doc Analyze (Biometra, Alemania). La concentraci&oacute;n y pureza del DNA se determin&oacute; por lecturas a 260 nm y 280 nm en un Nanodrop 2000C (Thermo, EUA).</font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2">&nbsp;</font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2"><b>Identificaci&oacute;n molecular de hongos</b></font></p>  	    ]]></body>
<body><![CDATA[<p align="left"><font face="verdana" size="2">Para la identificaci&oacute;n filogen&eacute;tica de los hongos a nivel de especie se realiz&oacute; la amplificaci&oacute;n y secuenciaci&oacute;n de las regiones del Espaciador Transcrito Interno (ITS) del rDNA con los iniciadores universales ITS1 (5' TCC GTA GGT GAA CCT GCG G 3') e ITS4 (5' TCC TCC GCT TAT TGA TAT GC 3') (White et al., 1990). Adicionalmente, en ocho de los aislamientos se secuenci&oacute; un segmento del extremo 5' de la subunidad grande (28S) del rDNA, que contiene los dominios D1 y D2, utilizados en estudios filogen&eacute;ticos de hongos (Zuluaga et al., 2011). Para la amplificaci&oacute;n de esta regi&oacute;n se utilizaron los iniciadores LROR (5' ACC CGC TGA ACT TAA GC 3') y LR6 (5' CGC CAG TTC TGC TTA CC 3') (Hopple y Vilgalys 1999). Las reacciones de PCR se prepararon en un volumen final de 25 &#956;L, agreg&aacute;ndole 14.6 &#956;L H<sub>2</sub>Odd, 1X Buffer PCR, 0.2 mM dNTPs, 2 mM MgCl<sub>2</sub> , 0.4 2 2 &#956;M de cada iniciador, 2 U de Taq polimerasa (Fermentas, Lituania), 0.2 &#956;L de BSA (10mg/&#956;L) y 25 ng/&#956;L de DNA. El progr ama de ampl i f i c a c i&oacute;n cons i s t i&oacute; de una desnaturalizaci&oacute;n inicial a 95&deg;C durante 3 min, seguida de 40 ciclos a 94&deg;C por 30 s, 58&deg;C por 50 s, 72&deg;C por 1 min, y una extensi&oacute;n final a 72&deg;C por 5 min. Los amplicones obtenidos fueron visualizados en electroforesis de agarosa al 1.5%, tal como se describi&oacute; anteriormente y el tama&ntilde;o de los fragmentos (500 a 600 pb para ITS y 1100 pb para 28S), fue verificado por comparaci&oacute;n con el marcador de peso molecular Generuler 100 pares de bases (bp) Plus (Fermentas, Lituania). Las bandas del tama&ntilde;o esperado se purificaron directamente del gel mediante los kits QIAquick PCR Purification y QIAquick Gel Extraction (Qiagen, USA). Se realiz&oacute; una secuenciaci&oacute;n directa de los productos de PCR en ambas direcciones mediante la metodolog&iacute;a de Big Dye Terminator Cycle (Applied Biosystems, EUA), en un secuenciador ABI Prism 3730XL (PE Applied Biosystems).</font></p>  	    <p align="left"><font face="verdana" size="2">Las secuencias obtenidas con cada iniciador, se editaron y ensamblaron con el software Chromas Lite. Las secuencias consenso se compararon con la base de datos de GenBank, mediante el programa BLAS TN (<a href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST" target="_blank">http://www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST</a>).</font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2">Posteriormente, con secuencias representativas de los g&eacute;neros y especies pre&#45;identificadas en el an&aacute;lisis BLAST, se procedi&oacute; a realizar un alineamiento con el algoritmo Clustal W incluido en el software Bioedit 6.0.6. (Hall, 1999). La matriz obtenida fue utilizada para realizar un an&aacute;lisis filogen&eacute;tico basado en el m&eacute;todo de m&aacute;xima parsimonia (MP) con b&uacute;squeda heur&iacute;stica y TBR (tree&#45;bisectionreconnection), mediante el software PAUP 4.0b10 (Swofford, 1998). El soporte de la topolog&iacute;a interna del &aacute;rbol filogen&eacute;tico se realiz&oacute; mediante an&aacute;lisis de bootstrap con 1000 iteraciones (Felsenstein, 1985). Los n&uacute;meros de accesi&oacute;n de las secuencias de este trabajo corresponden al rango JQ975396 a JQ975407.</font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2">&nbsp;</font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2"><b>Identificaci&oacute;n morfol&oacute;gica</b></font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2">De cada uno de los subclados obtenidos en el &aacute;rbol filogen&eacute;tico, se seleccion&oacute; un aislamiento para la observaci&oacute;n y descripci&oacute;n de sus estructuras en un microscopio &oacute;ptico Zeiss modelo Axioplan (G&ouml;ttingen, Alemania) acoplado a un sistema fotogr&aacute;fico digital. Para la caracterizaci&oacute;n de las colonias, se coloc&oacute; un disco de 4 mm de di&aacute;metro con micelio del hongo en el centro de las cajas de Petri con los medios PDA, ME y Agar&#45;V8. Para inducir esporulaci&oacute;n, cada repetici&oacute;n se mantuvo bajo diferentes condiciones de fotoper&iacute;odo: luz constante, oscuridad constante y 12 h luz / 12 h oscuridad. Transcurridos 15 y 30 d&iacute;as de incubaci&oacute;n, se evalu&oacute; la coloraci&oacute;n, di&aacute;metro y presencia de estructuras reproductivas de los hongos en cada uno de los medios. Como base de comparaci&oacute;n para el an&aacute;lisis microsc&oacute;pico de los hongos, se usaron las herramientas de b&uacute;squeda del Mycobank (<a href="http://www.mycobank.org/" target="_blank">http://www.mycobank.org/</a>).</font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2">&nbsp;</font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2"><b>Pruebas de patogenicidad</b></font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2">Las evaluaciones microsc&oacute;picas, coloniales y los resultados de los an&aacute;lisis filogen&eacute;ticos, permitieron seleccionar cinco aislamientos (MA124_1, MA127_5, MA128_10, MA13618, MA140 22) como asociados a la pudrici&oacute;n basal de plantas de vainilla, dada su identificaci&oacute;n como posibles microrganismos fitopat&oacute;genos. Los hongos seleccionados para esta prueba se transfirieron a medio ME y se mantuvieron a temperatura ambiente, bajo condiciones de oscuridad durante 15 d&iacute;as. Para realizar las pruebas de patogenicidad bajo condiciones de cobertizos de techo&#45;sombra, se utilizaron plantas de vainilla de seis meses de edad.</font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2">Cada uno de los aislamientos seleccionados se inocul&oacute; sobre 10 plantas, utilizando el sistema de herida en el cambium vascular de la parte basal del tallo. Se realizaron cortes tipo bolsillo, ubic&aacute;ndose en su interior un disco de 4 mm de ME con micelio del hongo. Posteriormente, se coloc&oacute; un algod&oacute;n humedecido con agua destilada est&eacute;ril rodeando la herida y se cubri&oacute; con cintas pl&aacute;sticas (papel vinipel). La evaluaci&oacute;n de los s&iacute;ntomas causados por los hongos se realiz&oacute; a los 15 y 30 d&iacute;as despu&eacute;s de la inoculaci&oacute;n.</font></p>  	    ]]></body>
<body><![CDATA[<p align="justify"><font face="verdana" size="2">Adicionalmente, los dos aislamientos identificados como pertenecientes al g&eacute;nero <i>Fusarium</i> (MA136_18, MA140_22), fueron inoculados con 1 mL de una soluci&oacute;n de 1x10<sup>6</sup> c/mL inyectada en la base del tallo y tambi&eacute;n se adicion&oacute; sobre el suelo 5 mL de la misma suspensi&oacute;n de conidias, con el fin de alcanzar las ra&iacute;ces subterr&aacute;neas de la planta. En este caso se evalu&oacute; el n&uacute;mero de plantas con s&iacute;ntomas de pudrici&oacute;n basal. Como grupo control del experimento, se utilizaron 10 plantas a las cuales se les realiz&oacute; el corte tipo bolsillo y la cobertura con algod&oacute;n y vinilpel, pero no se coloc&oacute; discos de agar con el in&oacute;culo fungico. As&iacute; mismo, cinco plantas fueron inoculadas por inyecci&oacute;n y riego con 5 mL de agua destilada est&eacute;ril, como controles para dicho sistema de evaluaci&oacute;n. Transcurrido el per&iacute;odo de 30 d&iacute;as, se procedi&oacute; al re&#45;aislamiento en los medios ME y PDA de los hongos presentes en los tejidos sintom&aacute;ticos, realiz&aacute;ndose nuevas observaciones microsc&oacute;picas para completar los postulados de Koch.</font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2">&nbsp;</font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2"><b>Resultados</b></font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2"><b>Sintomatolog&iacute;a en plantas</b></font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2">En los cultivos de vainilla bajo cobertizos de techo&#45;sombra del occidente de Antioquia, se evidenciaron dos tipos principales de s&iacute;ntomas en tallos asociados a enfermedades presumiblemente de or&iacute;gen mic&oacute;tico. El primero de ellos correspondi&oacute; a una pudrici&oacute;n inicialmente h&uacute;meda rodeada de un halo clor&oacute;tico y descendente, que termin&oacute; con una necrosis seca y con el estrangulamiento de la base del tallo; mientras que el otro s&iacute;ntoma se caracteriz&oacute; por la presencia de peque&ntilde;os puntos necr&oacute;ticos que coalescieron constituy&eacute;ndose en tizones de tallo con desarrollo longitudinal bidireccional y perimetral (<a href="/img/revistas/rmm/v35/a4f1.jpg" target="_blank">Figura 1</a>).</font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2">&nbsp;</font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2"><b>Identificaci&oacute;n molecular de hongos An&aacute;lisis filogen&eacute;tico de regiones ITS de rDNA.</b> A partir de las 25 muestras de tejidos de tallo sintom&aacute;ticas, se obtuvieron 20 aislamientos de hongos que representaban nueve morfotipos. La amplificaci&oacute;n del DNA extra&iacute;do en los 20 aislamientos, permiti&oacute; la obtenci&oacute;n de amplicones de 500 a 600 bp para las regiones ITS del DNAr <a href="/img/revistas/rmm/v35/a4f2.jpg" target="_blank">(Figura 2</a>). El an&aacute;lisis BLAST de las secuencias de los 20 aislamientos, permiti&oacute; la identificaci&oacute;n de hongos de los g&eacute;neros: <i>Lasiodiplodia</i> (4 aislamientos), <i>Fusarium</i> (4 aislamientos), <i>Phoma</i> (3 aislamientos), <i>Bionectria</i> (2 aislamientos), <i>Arthrinium</i> (3 aislamientos) y <i>Nigrospora</i> (1 aislamiento), adem&aacute;s de tres ascomycetes no determinados a nivel de g&eacute;nero, uno de ellos posiblemente asociado a la familia Xylariaceae (<a href="/img/revistas/rmm/v35/a4t1.jpg" target="_blank">Tabla 1</a>).</font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2">El &aacute;rbol filogen&eacute;tico se construy&oacute; con 15 secuencias obtenidas en el presente trabajo; 22 secuencias de hongos depositadas en el GenBank y seleccionadas por presentar altos niveles de identidad con los aqu&iacute; obtenidos y el hongo roya <i>Puccinia acroptili,</i> utilizado como grupo externo de an&aacute;lisis <i>(outgroups)</i> y seleccionado por no estar filogen&eacute;ticamente relacionados con ninguno de los hongos bajo estudio.</font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2">El alineamiento final de las secuencias fue de 532 sitios, de los cuales 141 caracteres eran constantes, 63 variables pero no informativos y 328 informativos. La longitud del &aacute;rbol filogen&eacute;tico con m&aacute;xima parsimonia fue de 1198 pasos, con &iacute;ndices de consistencia (IC) y retenci&oacute;n (IR) de 0.66 y 0.88, respectivamente. En el &aacute;rbol filogen&eacute;tico se presentaron ocho clados bien definidos, todos ellos con soportes de bootstrap de 100% (<a href="#f3">Figura 3</a>). Estos clados permitieron identificar a nivel de especie a los hongos <i>Lasiodiplodia gonubiensis</i> (1 aislamiento), <i>L. theobromae</i> (2 aislamientos) y <i>Fusarium oxysporum</i> (2 aislamientos), mientras que el an&aacute;lisis filogen&eacute;tico con la regi&oacute;n ITS, no ofreci&oacute; una resoluci&oacute;n suficiente para determinar las especies de los hongos identificados como miembros de los g&eacute;neros <i>Phoma</i> (2 aislamientos), <i>Arthrinium</i> (3 aislamientos), <i>Bionectria</i> (2 aislamientos) y <i>Nigrospora</i> (1 aislamiento).</font></p>  	    <p align="center"><font face="verdana" size="2"><a name="f3"></a></font></p>  	    ]]></body>
<body><![CDATA[<p align="center"><font face="verdana" size="2"><img src="/img/revistas/rmm/v35/a4f3.jpg"></font></p>     <p align="justify"><font face="verdana" size="2"><b>An&aacute;lisis filogen&eacute;tico de 28S de rDNA.</b> La amplificaci&oacute;n de la regi&oacute;n 5' del 28S del DNAr se realiz&oacute; para ocho de los aislamientos previamente identificados mediante an&aacute;lisis de ITS, con el fin de reconfirmar la ubicaci&oacute;n taxon&oacute;mica, especialmente de los aislamientos identificados como <i>F. oxysporum,</i> dada la baja resoluci&oacute;n que en algunos casos presenta la regi&oacute;n ITS para los miembros de este g&eacute;nero (Leslie y Summerell, 2006). Los amplicones obtenidos fueron de 1100 bp aproximadamente (<a href="#f4">Figura 4</a>). El an&aacute;lisis filogen&eacute;tico permiti&oacute; identificar a los hongos <i>Lasidiplodia</i> sp., <i>F. oxysporum</i> y <i>Phoma</i> sp., mientras que los dos aislamientos de <i>Arthrinium</i> se presentaron como un clado asociado con el Ascomycete sordarial <i>Apiospora setosae.</i> El alineamiento final para este an&aacute;lisis alcanz&oacute; 969 sitios, de los cuales 568 caracteres eran constantes, 150 variables pero no informativos y 251 informativos. La longitud del &aacute;rbol filogen&eacute;tico con m&aacute;xima parsimonia fue de 705 pasos, con &iacute;ndices de consistencia (IC) y retenci&oacute;n (IR) de 0.78 y 0.90, respectivamente y su enraizamiento se efect&uacute;o con base en secuencias del hongo roya <i>Puccinia graminis</i>. Adicionalmente, el an&aacute;lisis de BLAST de las secuencias permiti&oacute; confirmar la identidad de uno de los aislamientos como miembro del g&eacute;nero <i>Bionectria,</i> aunque no fue incluido en el an&aacute;lisis filogen&eacute;tico debido a que la secuencia obtenida fue muy corta (522 bp).</font></p>  	    <p align="center"><font face="verdana" size="2"><a name="f4"></a></font></p>  	    <p align="center"><font face="verdana" size="2"><img src="/img/revistas/rmm/v35/a4f4.jpg"></font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2"><b>Caracterizaci&oacute;n morfol&oacute;gica</b></font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2">Las observaciones microsc&oacute;picas y coloniales permitieron confirmar las identificaciones moleculares realizadas para los hongos <i>F. oxysporum, Arthrinium</i> sp. y <i>Bionectria</i> sp. Sin embargo, los hongos identificados mediante secuenciaci&oacute;n como miembros de <i>Phoma, Lasiodiplodia</i> y <i>Nigrospora,</i> adem&aacute;s de los tres ascomycetes sin filiaci&oacute;n gen&eacute;rica, solamente produjeron micelio en los medios de cultivo y condiciones de fotoper&iacute;odo evaluadas, no siendo posible su identificaci&oacute;n morfol&oacute;gica. Para el caso de <i>F. oxysporum,</i> se presentaron colonias de r&aacute;pido crecimiento, con micelio a&eacute;reo inicialmente blanco y con cambios en el tiempo a color p&uacute;rpura. Microsc&oacute;picamente, presentaban conidi&oacute;foros cortos, simples, con monofi&aacute;lides laterales y densamente ramificados. Macroconidias fusiformes del tipo alantoespora (23&#45;54 x 3.0&#45;4.5 &#956;m), levemente curvadas, con tres a cinco septos y c&eacute;lulas basales pediceladas. Microconidias (5&#45;12 x 2.3&#45;3.5 &#956;m) abundantes, no catenuladas y frecuentemente no septadas, elipsoidales a cil&iacute;ndricas, rectas a curvadas. En cultivos de dos semanas, se observ&oacute; la presencia de clamidosporas terminales o intercaladas (5&#45;13 &#956;m), con paredes lisas o d&eacute;bilmente rugosas (<a href="/img/revistas/rmm/v35/a4f5.jpg" target="_blank">Figura 5</a>).</font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2">&nbsp;</font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2"><b>Pruebas de patogenicidad</b></font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2">Transcurridos 30 d&iacute;as despu&eacute;s de la inoculaci&oacute;n con los cinco hongos seleccionados, se evidenci&oacute; que solamente los hongos identificados como miembros de la especie <i>F. oxysporum</i> (MA13618 y MA140 22) indujeron desarrollo de lesiones necr&oacute;ticas en los tallos de las plantas evaluadas, mientras que aquellos identificados como <i>Lasiodiplodia gonubiensis</i> (MA124_1), <i>Phoma</i> sp. (MA127_5) y <i>Bionectria</i> sp. (MA128_10) no generaron ninguna lesi&oacute;n en los tallos. Estas lesiones necr&oacute;ticas inducidas por <i>F. oxysporum</i> variaron de 1.1 a 10 cm de longitud, presentaron un aspecto acuoso con halos clor&oacute;ticos y desarrollo con tendencia descendente (<a href="/img/revistas/rmm/v35/a4f5.jpg" target="_blank">Figura 5</a>). El aislamiento MA136_18 caus&oacute; la muerte de dos plantas, mientras que el MA140_22 provoc&oacute; la muerte de 5 plantas por estrangulamiento de la base del tallo (<a href="/img/revistas/rmm/v35/a4t2.jpg" target="_blank">Tabla 2</a>). Adicionalmente, ambos aislamientos causaron s&iacute;ntomas de lesiones basales de plantas cuando se inocularon con la suspensi&oacute;n de conidias, siendo el aislamiento MA140_22 aparentemente el m&aacute;s agresivo, al inducir s&iacute;ntomas en 7 de las 10 plantas inoculadas, mientras que el MA136_18 afect&oacute; durante el mes de evaluaci&oacute;n a 3 de las 10 plantas. Las plantas utilizadas como controles negativos, no presentaron ning&uacute;n tipo de lesi&oacute;n y continuaron con su crecimiento normal despu&eacute;s del mes de evaluaci&oacute;n.</font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2">Con el fin de cumplir con los postulados de Koch, se procedi&oacute; al re&#45;aislamiento de los hongos a partir de las plantas que presentaron los tejidos sintom&aacute;ticos inoculados con los dos aislamientos de <i>F. oxysporum.</i> En todos los casos se logr&oacute; la obtenci&oacute;n de colonias t&iacute;picas de este hongo, con micelio a&eacute;reo de color p&uacute;rpura despu&eacute;s de 15 d&iacute;as de incubaci&oacute;n y producci&oacute;n abundante de macroconidias, microconidias y clamidosporas con morfolog&iacute;a y dimensiones similares a las inicialmente descritas para estos aislamientos (<a href="/img/revistas/rmm/v35/a4f5.jpg" target="_blank">Figura 5</a>).</font></p>  	    ]]></body>
<body><![CDATA[<p align="justify"><font face="verdana" size="2">&nbsp;</font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2"><b>Discusi&oacute;n</b></font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2"><i>Vanilla planifolia</i> es la &uacute;nica orqu&iacute;dea que produce una sustancia consumible, la especia vainilla y aunque esta planta es originaria de Am&eacute;rica Tropical su producci&oacute;n agroindustrial se ha concentrado en Madagascar y otras islas del oc&eacute;ano &Iacute;ndico, y pa&iacute;ses del sudeste de Asia como Indonesia e India, entre otros (FAO, 2011). Las m&uacute;ltiples aplicaciones cosm&eacute;ticas, comestibles, industriales y terap&eacute;uticas de esta especia representan un mercado mundial de cerca de 500 millones de d&oacute;lares al a&ntilde;o y 6715 toneladas m&eacute;tricas/a&ntilde;o de vainas de vainilla (Ploetz, 2006). En Colombia, como ya se mencion&oacute; se reportan poblaciones nativas de <i>V. planifolia</i> en varias regiones, as&iacute; como otras trece especies del g&eacute;nero <i>Vanilla</i> (Ordo&ntilde;ez <i>et al.,</i> 2011). En los &uacute;ltimos a&ntilde;os se han establecido algunos cultivos en varias zonas mediante programas gubernamentales como el desarrollado con campesinos de las zonas de Urab&aacute; y el Putumayo, as&iacute; como cultivos establecidos por empresarios privados en varias regiones del departamento de Antioquia, con aproximadamente 100,000 plantas en producci&oacute;n, cifra que aunque resulta muy baja con respecto al mercado mundial, representa el inicio de una naciente agroindustria de saborantizantes naturales en Colombia (MADR, 2008). Entre los limitantes que afectan el desarrollo de esta agroindustria en el pa&iacute;s, se encuentran los problemas relacionados con la nutrici&oacute;n, el beneficio de las vainas, los sistemas de polinizaci&oacute;n y la presencia de enfermedades como la mancha foliar y la pudrici&oacute;n basal de tallo y ra&iacute;ces. Esta &uacute;ltima, es especialmente limitante, ya que causa la muerte prematura de las plantas, disminuyendo las densidades de siembra en las plantaciones y por ende la producci&oacute;n de vainilla por unidad de &aacute;rea. Dado que en Colombia no se conoc&iacute;a la naturaleza del agente causal de la pudrici&oacute;n basal de plantas de vainilla, en esta investigaci&oacute;n se abord&oacute; dicha problem&aacute;tica a partir del aislamiento, la caracterizaci&oacute;n morfol&oacute;gica y molecular de hongos asociados a plantas con tejidos sintom&aacute;ticos, y la conducci&oacute;n de pruebas de patogenicidad.</font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2">El desarrollo de este trabajo permiti&oacute; la obtenci&oacute;n de 20 aislamientos de hongos, y la identificaci&oacute;n de <i>F. oxysporum,</i> especie ampliamente reportada en la literatura afectando el cultivo de vainilla (Bhai y Dhanesh, 2008; Suprapta y Khalimi, 2009; Pinaria <i>et al.,</i> 2010), y de otros no registrados en dicha planta, pero s&iacute; ampliamente reconocidos como fitopat&oacute;genos, como <i>Phoma</i> sp., <i>L. theobromae</i> y <i>L. gonubiensis.</i> Adicionalmente, se detectaron hongos aparentemente saprofitos como <i>Arthrinium</i> sp., o cuyo nicho ecol&oacute;gico se desconoce en este cultivo como es el caso de <i>Bionectria</i> sp.</font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2">Tres de los hongos aislados, no pudieron ser identificados a nivel de g&eacute;nero y especie, con las metodolog&iacute;as moleculares y morfol&oacute;gicas utilizadas, dada la ausencia de secuencias de referencia en el GenBank que compartieran altos niveles de identidad con &eacute;stos y a la carencia de estructuras reproductivas en las colonias. La identificaci&oacute;n de dichos microorganismos merece ser retomada en un estudio que ofrezca continuidad al aqu&iacute; presentado, ya que es posible que correspondan a fitopat&oacute;genos o incluso biocontroladores con potencial para su uso en este cultivo. Las pruebas de patogenicidad realizadas con cinco aislamientos, indicaron que dos de ellos induc&iacute;an lesiones necr&oacute;ticas a nivel de la base de las plantas, luego de 30 d&iacute;as de inoculaci&oacute;n. Estos hongos fueron identificados como pertenecientes a la especie F. oxysporum y por la agresividad de su ataque, se considera que hacen parte de la forma specialis vanillae (F. oxysporum f.sp. vanillae), previamente denominada en Puerto Rico como F. batatas var. vanillae (Ploetz, 2006). Los s&iacute;ntomas que se presentaron en las plantas inoculadas fueron semejantes a los inicialmente observados en el cultivo y que se constituyen en el principal problema fitosanitario de las plantaciones en estudio. Dichos    <br> 	&iacute;ntomas se caracterizan por la presencia de lesiones necr&oacute;ticas, acuosas y rodeadas de halos clor&oacute;ticos en la parte basal de los tallos, que terminan con el estrangulamiento de la corona de las plantas, desprendiendo la parte a&eacute;rea del suelo y por tanto causando marchitez y en muy poco tiempo la muerte de las plantas. Estos s&iacute;ntomas ya hab&iacute;an sido descritos como asociados a dicho pat&oacute;geno en cultivos de vainilla de India (Ashoka, 2005; Bhai y Dhanesh, 2008), China (He, 2007), Puerto Rico (Ploetz, 2006) e Indonesia (Pinaria et al., 2010), entre otros. En este &uacute;ltimo pa&iacute;s, se ha estimado que la enfermedad puede causar perdidas de hasta 80% en los cultivos (Pinaria et al., 2010).</font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2">Adem&aacute;s de los s&iacute;ntomas descritos, se ha reportado que F. oxysporum f.sp. vanillae tambi&eacute;n puede causar muerte de brotes meristem&aacute;ticos, pudrici&oacute;n de vainas y necrosis en hojas, lo que incrementa sus da&ntilde;os (Bhai y Dhanesh, 2008). Generalmente su ataque est&aacute; relacionado con altos niveles de humedad en el suelo por exceso de lluvias, riego o deficiencias en el drenaje de los lotes, sombr&iacute;o excesivo, altas densidades de cultivo y falta de pr&aacute;cticas sanitarias tanto a nivel de cultivos establecidos, como en los bancos de propagaci&oacute;n (Bhai y Dhanesh, 2008). Algunas de dichas situaciones (ej. deficiencia en drenaje y manejo fitosanitario y presencia de altas densidades de siembra) son frecuentemente observadas en los cultivos bajo cobertizos de techo&#45;sombra presentes en Colombia y merecen por tanto se reevaluadas para continuar con el plan de expansi&oacute;n del cultivo de vainilla en este pa&iacute;s suramericano. Adicionalmente a la gravedad del problema, F. oxysporum produce gran cantidad de clamidosporas que le permiten sobrevivir en el suelo por largos per&iacute;odos de tiempo, haciendo de la resiembra una medida impr&aacute;ctica y del control qu&iacute;mico, una herramienta temporal a nivel de planta, pero no de suelo (Ploetz, 2006).</font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2">Por estas razones, el mejoramiento gen&eacute;tico por resistencia a F. oxysporum f.sp. vanillae es imperativo para el manejo de la pudrici&oacute;n del tallo y ra&iacute;ces. Algunos ensayos exitosos se han realizado a partir de cruces entre V. planifolia y especies no comerciales como V. phaeantha. Sin embargo, la calidad de las vainas resultantes es deficiente, siendo necesario un esfuerzo multilateral de fitomejoramiento para lograr h&iacute;bridos estables y altamente productivos, a partir de las poblaciones naturales de V. planifolia y de otras especies de Vanilla sp. como las presentes en Colombia y otros pa&iacute;ses tropicales.</font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2">La otra alternativa de manejo ha sido el control biol&oacute;gico, para lo cual se han utilizado cepas de Pseudomonas fluorescens como antagonistas (Tombe et al., 1997), formulaciones de extractos vegetales de Eugenia aromatica (Myrtaceae) y Piper betle (Piperaceae) (Suprapta y Khalimi, 2009) e incluso de plantas de clavos de olor (Syzygium aromaticum), que aparentemente inhiben el hongo a partir de compuestos como el eugenol (Tombe et al. 1997). El uso de especies de Fusarium no patog&eacute;nicas ha sido reportado como una forma de atenuar los efectos de las especies y f.sp. m&aacute;s agresivas de estos hongos. As&iacute; por ejemplo, se ha reportado que la inoculaci&oacute;n con cepas no patog&eacute;nicas de <i>F. oxysporum</i> reduce el efecto de la marchitez por <i>Fusarium</i> en mel&oacute;n, tomate e incluso vainilla <i>(Pinaria et al.,</i> 2010). Para nuestro caso en Colombia, la identificaci&oacute;n de <i>F. oxysporum</i> f. sp. <i>vanillae</i> como agente causal de la pudrici&oacute;n basal de tallo y ra&iacute;ces en vainilla, es el punto de partida para realizar recomendaciones de manejo fitosanitario en este cultivo, que incluyan algunas de las antes descritas y otras ajustadas a las particularidades de nuestros sistemas productivos, como son la propagaci&oacute;n vegetativa por esquejes, los arreglos agroforestales que se presentan en algunas plantaciones, la realizaci&oacute;n constante de podas de formaci&oacute;n y la utilizaci&oacute;n de sustratos org&aacute;nicos que pudieran ser fuente de in&oacute;culo del pat&oacute;geno, cuando no son sometidos a procesos adecuados de compostaje. En cualquier caso, el manejo de esta enfermedad debe estar fundamentado en evitar la llegada de prop&aacute;gulos del pat&oacute;geno, especialmente de clamidosporas, a los sustratos de propagaci&oacute;n y establecimiento de los cultivos, el tratamiento de herramientas tipo tijeras podadoras con desinfectantes gen&eacute;ricos, la detecci&oacute;n temprana de focos de enfermedad, el tratamiento cuarentenario de sitios de siembra afectados por el pat&oacute;geno y el establecimiento de bancos de plantas madre a partir de materiales provenientes de cultivo <i>in vitro.</i></font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2">&nbsp;</font></p>  	    ]]></body>
<body><![CDATA[<p align="justify"><font face="verdana" size="2"><b>Agradecimientos</b></font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2">Este trabajo se realiz&oacute; como parte de las actividades del proyecto "Manejo integrado de la nutrici&oacute;n del cultivo de vainilla" (contrato 082&#45;2008V6151&#45;3701), financiado por el Ministerio de Agricultura y Desarrollo Rural de Colombia, la Universidad Nacional de Colombia, Bioandes C. I. Ltda. y la Corporaci&oacute;n Aut&oacute;noma Regional del Centro de Antioquia.</font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2">&nbsp;</font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2"><b>Literatura citada</b></font></p>  	    <!-- ref --><p align="justify"><font face="verdana" size="2">Ashoka, S., 2005. Studies on fungal pathogenies of vanilla with special references to <i>Colletotrichum gloeosporioides.</i> PhD. Tesis, Department of Plant Pathology, University of Agricultural Sciences, Dharwad.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=8732228&pid=S0187-3180201200010000400001&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></font></p>  	    <!-- ref --><p align="justify"><font face="verdana" size="2">Bhai, S., J. Dhanesh, 2008. Occurrence of fungal diseases in vanilla (<i>Vanilla planifolia</i> Andrews) in Kerala. Journal of Spices and Aromatic Crops 17:140&#45;148.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=8732230&pid=S0187-3180201200010000400002&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></font></p>  	    <!-- ref --><p align="justify"><font face="verdana" size="2">Bory, S., P. Lubinsky, A.M. Risterucci, J.L. Noyer, M. Grisoni, M.F. Duval, P. Besse, 2008. Patterns of introduction and diversification of <i>Vanilla planifolia</i> (Orchidaceae) in R&eacute;union Island (Indian Ocean). American Journal of Botany 95: 805&#45;815.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=8732232&pid=S0187-3180201200010000400003&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></font></p>  	    ]]></body>
<body><![CDATA[<!-- ref --><p align="justify"><font face="verdana" size="2">Doyle, J.J., J.L. Doyle, 1990. Isolation of plant DNA from fresh tissue. Focus 12:13&#45;15.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=8732234&pid=S0187-3180201200010000400004&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></font></p>  	    <!-- ref --><p align="justify"><font face="verdana" size="2">FAO (Food and Agriculture Organization), 2011. FAOSTAT website (<a href="http://faostat.fao.org/site/339/default.aspx" target="_blank">http://faostat.fao&#45;org/site/339/default.aspx</a>). Consultado en Octubre de 2011.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=8732236&pid=S0187-3180201200010000400005&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></font></p>  	    <!-- ref --><p align="justify"><font face="verdana" size="2">Felsenstein, J., 1985. Confidence limits on phylogenies: an approach using the bootstrap. Evolution 39: 783&#45;791.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=8732238&pid=S0187-3180201200010000400006&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></font></p>  	    <!-- ref --><p align="justify"><font face="verdana" size="2">Hall, T.A., 1999. BioEdit: a user&#45;friendly biological sequence alignment editor and analysis program for Windows 95/98/NT. Nucleic Acids Symposium Series 41: 95&#45;98.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=8732240&pid=S0187-3180201200010000400007&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></font></p>  	    <!-- ref --><p align="justify"><font face="verdana" size="2">Havkin&#45;Frenkel, D., R. Dorn, 1997. Vanilla spices, flavor chemistry and antioxidant properties. ACS Symposium 660: 29&#45;40.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=8732242&pid=S0187-3180201200010000400008&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></font></p>  	    ]]></body>
<body><![CDATA[<!-- ref --><p align="justify"><font face="verdana" size="2">He, X.H., 2007. Bio&#45;control of root rot disease in vanilla. PhD. Tesis, Yunnan Agricultural University.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=8732244&pid=S0187-3180201200010000400009&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></font></p>  	    <!-- ref --><p align="justify"><font face="verdana" size="2">Hopple, J., R. Vilgalys, 1999. Phylogenetic relationships in the mushroom genus <i>Coprinus</i> and dark&#45;spored allies based on sequence data from the nuclear gene coding for the large ribosomal subunit RNA: divergent domains, outgroups, and monophyly. Molecular Phylogenetics Evolution 13: 1&#45;19.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=8732246&pid=S0187-3180201200010000400010&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></font></p>  	    <!-- ref --><p align="justify"><font face="verdana" size="2">Leslie J.F., B.A. Summerell, 2006. <i>Fusarium</i> laboratory manual. Blackwell Pub., Iowa.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=8732248&pid=S0187-3180201200010000400011&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></font></p>  	    <!-- ref --><p align="left"><font face="verdana" size="2">MADR (Ministerio de Agricultura y Desarrollo Rural de Colombia), 2008. "PROYECTO: Manejo integrado de la nutrici&oacute;n del cultivo de vainilla 2008", Investigaci&oacute;n, Desarrollo Tecnol&oacute;gico e Innovaci&oacute;n. Disponible en: <a href="http://sigp.minagricultura.gov.co/portal/proyectosanteriores.jsp" target="_blank">http://sigp.minagricultura.gov.co/portal/proyectosanteriores.jsp</a> (Consultado en Noviembre de 2011).    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=8732250&pid=S0187-3180201200010000400012&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></font></p>  	    <!-- ref --><p align="justify"><font face="verdana" size="2">Ordo&ntilde;ez, N.F., A.I. Osorio, J. E. Calle, M.C. D&iacute;ez, F.H. Moreno, 2011. La vainilla en Colombia y en el mundo. In: Moreno, F., M. C. D&iacute;ez (eds.), Cultivo de vainilla: contribuciones para el desarrollo de su cadena productiva en Colombia. Universidad Nacional de Colombia, Medell&iacute;n. pp. 11&#45;23.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=8732252&pid=S0187-3180201200010000400013&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></font></p>  	    ]]></body>
<body><![CDATA[<!-- ref --><p align="justify"><font face="verdana" size="2">Pinaria, A.G., E.C.Y. Liew, LW. Burguess, 2010. <i>Fusarium</i> species associated with vanilla stem rot in Indonesia. Australasian Plant Pathology 39:176&#45;183.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=8732254&pid=S0187-3180201200010000400014&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></font></p>  	    <!-- ref --><p align="justify"><font face="verdana" size="2">Ploetz, R.C. 2006, <i>Fusarium</i>&#45;induced diseases of tropical, perennial crops. Phytopathology 96:48&#45;652.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=8732256&pid=S0187-3180201200010000400015&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></font></p>  	    <!-- ref --><p align="justify"><font face="verdana" size="2">Richard, A., K. Farreyrol, B. Rodier, K. Leoce&#45;Mouk&#45;San, M. Wong, M. Pearson, M. Grisoni, 2009. Control of virus diseases in intensively cultivated vanilla plots of French Polynesia. Crop Protection 28: 870&#45;877.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=8732258&pid=S0187-3180201200010000400016&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></font></p>  	    <!-- ref --><p align="justify"><font face="verdana" size="2">Swofford, D.L., 1998. PAUP: Phylogenetic analysis using parsimony (* and other methods), Versi&oacute;n: 4. Sinauer Associates, Sunderland.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=8732260&pid=S0187-3180201200010000400017&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></font></p>  	    <!-- ref --><p align="justify"><font face="verdana" size="2">Suprapta D., K. Khalimi, 2009. Efficacy of plant extract formulations to suppress stem rot disease on vanilla seedlings. International Society for Southeast Asian Agricultural Sciences Journal 15: 3441.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=8732262&pid=S0187-3180201200010000400018&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></font></p>  	    ]]></body>
<body><![CDATA[<!-- ref --><p align="justify"><font face="verdana" size="2">Thomas, J., B. Suseela, 2001. <i>Sclerotium</i> rot &#45; a new disease of vanilla <i>(Vanilla planifolia</i> Andrews) in India. Journal of Spices and Aromatic Crops 9: 175&#45;176.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=8732264&pid=S0187-3180201200010000400019&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></font></p>  	    <!-- ref --><p align="justify"><font face="verdana" size="2">Tombe M., D. Sitepu, S. Mogi, 1997. Present status of biological control research of vanilla stem rot disease in Indonesia. In: Ogoshi, A., Kobayashi, K., Homma, Y., Kodama, F., Kondo N., Akino, S. (eds), Proceedings of the 4th international workshop on plant growth promoting rhizobacteria, Sapporo. pp. 13&#45;21.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=8732266&pid=S0187-3180201200010000400020&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></font></p>  	    <!-- ref --><p align="justify"><font face="verdana" size="2">White, T.J., T. Bruns, S. Lee, J. Taylor, 1990. Amplification and direct sequencing of fungal rRNA genes for phylogenetics. In: Innis A.M., Gelfand, D. H., Sninsky J.J., White, T.J. (eds). PCR Protocols: A guide to methods and applications. Academic Press, San Diego. pp. 315&#45;322.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=8732268&pid=S0187-3180201200010000400021&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></font></p>     <!-- ref --><p align="justify"><font face="verdana" size="2">Zuluaga, C., P. Buritic&aacute;, M. Mar&iacute;n, 2011. Filogenia de hongos roya (Uredinales) en la zona andina colombiana mediante el uso de secuencias del ADN ribosomal 28S. Revista Biolog&iacute;a Tropical 59:517&#45;540.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=8732270&pid=S0187-3180201200010000400022&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></font></p>      ]]></body><back>
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