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<abstract abstract-type="short" xml:lang="en"><p><![CDATA[The ability of Pseudomonas sp. to associate with and penetrate potato seedling roots cv. Alpha propagated by tissue culture was evaluated. 38-day old potato seedlings were inoculated with 100 &#956;L of a bacterial suspension containing 10(8) CFU mL-1 of culture medium. A biofilm was observed surrounding the roots after seven days of incubation. The initial concentration of bacterial cells inside root plants was 1.53 X 10(7) CFU g-1 of plant tissue. In the fifth week of the incubation period the concentration was 1.92 X 10(5) CFU g-1 of plant tissue, which was similar to that obtained in the support medium. The digestion patterns of the ribosomal gene 16S of the DNAr showed that, with this kind of inoculation, Pseudomonas sp. can be established in an endophytic way and guarantee that the seedlings will associate only with bacteria of interest. In further investigations, aspects such as promotion of plant growth and degradation of certain agrochemicals will be evaluated.]]></p></abstract>
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</front><body><![CDATA[  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="4">Divisi&oacute;n II</font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2">&nbsp;</font></p>  	    <p align="center"><font face="verdana" size="4"><b>Producci&oacute;n <i>in vitro</i> de pl&aacute;ntula de papa inoculada con</b> <b><i>Pseudomonas</i></b> <b>sp.</b></font></p>  	    <p align="center"><font face="verdana" size="2">&nbsp;</font></p>  	    <p align="center"><font face="verdana" size="3"><b>Production of potato seedling <i>in vitro</i> inoculated with <i>Pseudomonas</i> sp.</b></font></p>  	    <p align="center"><font face="verdana" size="2">&nbsp;</font></p>  	    <p align="center"><font face="verdana" size="2"><b>Zuno&#45;Floriano Fabiola G.<sup>1</sup>*, Estrada&#45;de los Santos P.<sup>2</sup>, Gallegos&#45;Infante Jos&eacute; A.<sup>3</sup>, Rocha&#45;G&uacute;zman Nuria E.<sup>3</sup>, Aldana&#45;Madrid Mar&iacute;a L.<sup>4</sup>, Virgen&#45;Calleros Gil<sup>5</sup>, Miller M. G.<sup>6</sup> y Mu&ntilde;oz&#45;Ruiz Carlos V.<sup>1</sup></b></font></p>  	    <p align="center"><font face="verdana" size="2">&nbsp;</font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2"><sup><i>1</i></sup><i>&nbsp;Centro Interdisciplinario de Investigaci&oacute;n para el Desarrollo Integral Regional, Departamento de Biotecnolog&iacute;a. 59510 Jiquilpan, M&eacute;xico. <sup>*</sup> Autor responsable</i> (<a href="mailto:gaf24@hotmail.com">gaf24@hotmail.com</a>).</font></p>  	    ]]></body>
<body><![CDATA[<p align="justify"><font face="verdana" size="2"><i><sup>2</sup>&nbsp;Centro de Biotecnolog&iacute;a Gen&oacute;mica, Instituto Polit&eacute;cnico Nacional. 88710 Reynosa, Tamaulipas, M&eacute;xico.</i></font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2"><i><sup>3</sup>&nbsp;Instituto Tecnol&oacute;gico de Durango. 34080 Durango, M&eacute;xico.</i></font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2"><i><sup>4</sup>&nbsp;Universidad de Sonora. 83000 Hermosillo, Sonora, M&eacute;xico.</i></font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2"><i><sup>5</sup>&nbsp;Centro Universitario de Ciencias Biol&oacute;gicas y Agropecuarias. 45100 Zapopan, Jalisco, M&eacute;xico.</i></font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2"><i><sup>6</sup>&nbsp;Universidad de California, Departamento de Toxicolog&iacute;a Ambiental. Davis, CA. 95616 USA.</i></font></p> 	    <p align="justify">&nbsp;</p> 	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2">Recibido: noviembre de 2007.    <br>     Aceptado: febrero de 2009.</font></p> 	    <p align="center"><font face="verdana" size="2">&nbsp;</font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2"><b>RESUMEN</b></font></p>  	    ]]></body>
<body><![CDATA[<p align="justify"><font face="verdana" size="2">Se evalu&oacute; la capacidad de una cepa de <i>Pseudomonas</i> sp., para asociarse a las ra&iacute;ces e introducirse a pl&aacute;ntulas de papa (<i>Solanum tuberosum</i> L.) cv. Alpha propagadas mediante cultivo de tejidos. Las pl&aacute;ntulas de papa, de 38 d&iacute;as de edad, se inocularon con 100 &#956;L de una suspensi&oacute;n bacteriana con 10<sup>8</sup> UFC mL<sup>&#45;1</sup> de cultivo. Se observ&oacute; una biopel&iacute;cula, alrededor de las ra&iacute;ces, a los siete d&iacute;as de incubaci&oacute;n. La concentraci&oacute;n inicial de c&eacute;lulas en el interior de las pl&aacute;ntulas fue de 1.53 x 10<sup>7</sup> UFC g<sup>&#45;1</sup> de tejido vegetal. En la quinta semana de incubaci&oacute;n, la concentraci&oacute;n fue de 1.92 x 10<sup>5</sup> UFC g<sup>&#45;1</sup> de tejido vegetal, semejante a la obtenida en el medio de soporte. Los patrones de digesti&oacute;n del gen <i>ribosomal 16S</i> del DNAr demuestran que, con esta forma de inoculaci&oacute;n, la cepa de <i>Pseudomonas</i> sp. puede establecerse en forma endof&iacute;tica, garantizando que las pl&aacute;ntulas estar&aacute;n asociadas &uacute;nicamente a la bacteria de inter&eacute;s. En futuras investigaciones se evaluar&aacute;n aspectos como promoci&oacute;n de crecimiento y degradaci&oacute;n de ciertos agroqu&iacute;micos.</font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2"><b>Palabras clave:</b> <i>Solanum tuberosum</i> L., bacterias, inoculaci&oacute;n, endof&iacute;tica, biopel&iacute;cula, asociaci&oacute;n.</font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2">&nbsp;</font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2"><b>ABSTRACT</b></font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2">The ability of <i>Pseudomonas</i> sp. to associate with and penetrate potato seedling roots cv. Alpha propagated by tissue culture was evaluated. 38&#45;day old potato seedlings were inoculated with 100 &#956;L of a bacterial suspension containing 10<sup>8</sup> CFU mL<sup>&#45;1</sup> of culture medium. A biofilm was observed surrounding the roots after seven days of incubation. The initial concentration of bacterial cells inside root plants was 1.53 X 10<sup>7</sup> CFU g<sup>&#45;1</sup> of plant tissue. In the fifth week of the incubation period the concentration was 1.92 X 10<sup>5</sup> CFU g<sup>&#45;1</sup> of plant tissue, which was similar to that obtained in the support medium. The digestion patterns of the <i>ribosomal gene 16S</i> of the DNAr showed that, with this kind of inoculation, <i>Pseudomonas</i> sp. can be established in an endophytic way and guarantee that the seedlings will associate only with bacteria of interest. In further investigations, aspects such as promotion of plant growth and degradation of certain agrochemicals will be evaluated.</font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2"><b>Keywords:</b> <i>Solanum tuberosum</i> L., bacteria, inoculation, endophytic, biofilm, association.</font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2">&nbsp;</font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2"><b>INTRODUCCI&Oacute;N</b></font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2">La papa <i>(Solanum tuberosum</i> L.) es la hortaliza de mayor importancia en el mundo, debido a que su tub&eacute;rculo representa el cuarto alimento b&aacute;sico del mundo, superado s&oacute;lo por el ma&iacute;z, el trigo y el arroz, con una producci&oacute;n mayor de 325 mil toneladas aproximadamente hacia el 2008. Para poder obtener semillas libres de enfermedades, se emplea la producci&oacute;n de minitub&eacute;rculos <i>in vitro,</i> metodolog&iacute;a que, adem&aacute;s, facilita la manipulaci&oacute;n de la semilla por su tama&ntilde;o (Scott <i>et al.,</i> 2000).</font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2">El g&eacute;nero <i>Pseudomonas</i> ha sido utilizado para nombrar un amplio grupo de cepas bacterianas Gram&#45;negativas no ent&eacute;ricas, en general aer&oacute;bicas, no fermentativas y m&oacute;viles (Scarpellini <i>et al.,</i> 2004). Los miembros del g&eacute;nero <i>Pseudomonas</i> son considerados ubicuos, juegan un papel clave en el reciclado de nutrientes y son un importante componente en la comunidad microbiana del suelo (Turnbull <i>et al.,</i> 2001). Las cepas de <i>Pseudomonas</i> de inter&eacute;s para el hombre se encuentran en alguna de las siguientes categor&iacute;as: pat&oacute;genos, biodegradadores o controladores biol&oacute;gicos. Una de las principales caracter&iacute;sticas que presenta este g&eacute;nero es la facilidad para colonizar las ra&iacute;ces de las plantas (Hansen <i>et al.,</i> 1997; Ramos <i>et al.,</i> 2000). Los exudados que las plantas liberan por las ra&iacute;ces son ricos en carbohidratos, &aacute;cidos org&aacute;nicos y amino&aacute;cidos (Davey y O'Toole, 2000; Knee <i>et al.,</i> 2001), los cuales son utilizados por las bacterias como fuente de alimento (Lugtenberg y Dekkers, 1999).</font></p>  	    ]]></body>
<body><![CDATA[<p align="justify"><font face="verdana" size="2">Cuando se lleva a cabo la colonizaci&oacute;n de las ra&iacute;ces por microorganismos, se puede dar origen a los siguientes procesos: (i) causar enfermedad cuando se trate de pat&oacute;genos; (ii) controlar enfermedades por microorganismos que producen metabolitos antimicrobianos; (iii) estimular el desarrollo vegetal (p. ej., promoci&oacute;n del crecimiento de la planta por la producci&oacute;n de hormonas); (iv) biofertilizar (p. ej., los procesos por los cuales los microorganismos incrementan la disponibilidad de nutrientes a la planta, como nitr&oacute;geno, f&oacute;sforo y micronutrientes) y (v) degradar contaminantes qu&iacute;micos peligrosos para el hombre (Rainey, 1999). El proceso de colonizaci&oacute;n de las plantas se da mediante la formaci&oacute;n de agregados, microcolonias o biopel&iacute;culas.</font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2">En la primera fase de la formaci&oacute;n de la biopel&iacute;cula, la bacteria se desplaza por medio de flagelos polares y subsecuentemente se adhiere a un substrato. En tanto se fija la bacteria, se divide y diferencia, dando origen a las formas tridimensionales caracter&iacute;sticas de una biopel&iacute;cula madura (aglomerados) (Fujishige <i>et al.,</i> 2006). Las bacterias se encuentran alrededor de una matriz compuesta de polisac&aacute;ridos, en especial exopolisac&aacute;ridos, prote&iacute;nas y DNA (Fujishige <i>et al.,</i> 2006). Una vez que las bacterias colonizan las ra&iacute;ces, pueden penetrar el tejido vegetal; en algunos casos, debido a la producci&oacute;n de enzimas celul&iacute;ticas y pectinol&iacute;ticas, mismas que contribuyen a la degradaci&oacute;n de las paredes celulares. La penetraci&oacute;n tambi&eacute;n puede realizarse a trav&eacute;s de las fisuras que se forman durante la emisi&oacute;n de las ra&iacute;ces secundarias, o a trav&eacute;s de las heridas que se producen cuando la ra&iacute;z se va desarrollando (Lodewyckx <i>et al.,</i> 2002; Germaine <i>et al.,</i> 2004). En la actualidad se han desarrollado numerosas t&eacute;cnicas con la intenci&oacute;n de inocular bacterias a plantas, ya sea para aumentar su resistencia contra fitopat&oacute;genos o para ser utilizadas en la fitorremediaci&oacute;n de suelos contaminados con compuestos qu&iacute;micos, como hidrocarburos, residuos de plaguicidas, entre otros. Algunas de estas t&eacute;cnicas son: inoculaci&oacute;n hidrop&oacute;nica (Duffy y D&eacute;fago, 1977); inoculaci&oacute;n a tub&eacute;rculo por heridas (Schisler <i>et al.,</i> 1997); inoculaci&oacute;n a semillas (Kim <i>et al.,</i> 1997); inoculaci&oacute;n a suelo (Dupler y Baker, 1984; Kloepper y Beauchamp, 1992; Raupach <i>et al.,</i> 1996; Kenney <i>et al.,</i> 1999; Kloepper <i>et al.,</i> 1999; Reddy <i>et al.,</i> 1999; Ryu <i>et al.,</i> 1999; Zehnder <i>et al.,</i> 2000); inoculaci&oacute;n en suelo y semilla (De Meyer y H&ouml;fte, 1997); inoculacu&oacute;n a la planta (Leeman <i>et al.,</i> 1995; Liu <i>et al.</i>, 1995); e inoculaci&oacute;n <i>in vitro</i> a semilla (Sharma y Nowak, 1998).</font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2">En ninguna de las t&eacute;cnicas mencionadas se garantiza la ausencia de microorganismos en el interior de las semillas o de las plantas que puedan interaccionar o entrar en un estado de competencia por los nutrientes con el microorganismo a inocular. Sin embargo, si la pretensi&oacute;n es realizar estudios en los cuales se requiera conocer el efecto de un microorganismo, es necesario contar con una t&eacute;cnica de inoculaci&oacute;n que garantice la presencia del microorganismo en el interior de las plantas. El objetivo de este estudio ha sido producir pl&aacute;ntulas de papa <i>in vitro</i> e inocularlas con la cepa de <i>Pseudomonas</i> sp., aprovechando su capacidad de asociaci&oacute;n con las ra&iacute;ces de las pl&aacute;ntulas y su introducci&oacute;n al tejido vegetal.</font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2">&nbsp;</font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2"><b>MATERIALES Y M&Eacute;TODOS</b></font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2">Para el manejo de pl&aacute;ntulas libres de microorganismos end&oacute;fitos, las de papa cv. Alpha fueron propagadas por la t&eacute;cnica de cultivo de tejidos (Wilson <i>et al.,</i> 2001), utilizando como medio de soporte Murashige y Skoog. Se tom&oacute; parte de la reserva de pl&aacute;ntulas de papa del Centro Interdisciplinario de Investigaci&oacute;n para el Desarrollo Integral Regional (CIIDIR&#45;IPN&#45; Michoac&aacute;n, M&eacute;xico). En condiciones de esterilidad, se elimin&oacute; el follaje de las pl&aacute;ntulas y se cortaron segmentos de dos n&oacute;dulos, los cuales se colocaron en frascos (175 mL), conteniendo 15 mL del medio MS (siguiendo la polaridad de la pl&aacute;ntula). Posteriormente, &eacute;stas se expusieron a un fotoperiodo de 16 h luz y 8 h oscuridad a temperaturas de 19 y 16 &deg;C, respectivamente, durante un periodo de 30 d&iacute;as, con la finalidad de obtener suficientes pl&aacute;ntulas para llevar a cabo su inoculaci&oacute;n.</font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2">La cepa de <i>Pseudomonas</i> sp. se obtuvo de la riz&oacute;sfera de pl&aacute;ntulas de papa de un cultivo comercial establecido en el valle de Zamora, Michoac&aacute;n. El aislamiento de la bacteria se realiz&oacute; impregnando una esponja est&eacute;ril con suelo de la riz&oacute;sfera, y descargando a manera de impronta sobre medio Agar Papa Dextrosa. El cultivo bacteriano se incub&oacute; a 30 &deg;C durante 24 h. La cepa de <i>Pseudomonas</i> sp. se transfiri&oacute; a medio B de King, para posteriormente conservarla mediante liofilizaci&oacute;n.</font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2">Se determin&oacute; la cin&eacute;tica de crecimiento de la cepa de <i>Pseudomonas</i> sp. durante un periodo de 27 h. Para ello, se inocul&oacute; la cepa bacteriana en 25 mL de medio de infusi&oacute;n de papa y se incub&oacute; a 22 &deg;C durante 24 h en agitaci&oacute;n horizontal. Posteriormente, 1 mL de la suspensi&oacute;n anterior, con una concentraci&oacute;n de 6.3 x 10<sup>5</sup> UFC mL<sup>&#45;1</sup>, se transfiri&oacute; a 25 mL de medio PDI incubado en las condiciones mencionadas. Cada hora, durante un periodo de 27 h, se monitore&oacute; la absorbancia a una longitud de onda de 535 nm, utilizando un espectrofot&oacute;metro. Asimismo, se cuantificaron las unidades formadoras de colonias por mililitro de medio de cultivo (UFC mL<sup>&#45;1</sup>). La suspensi&oacute;n bacteriana para la inoculaci&oacute;n se prepar&oacute; a una concentraci&oacute;n de 10<sup>8</sup> UFC mL<sup>&#45;1</sup> aproximadamente.</font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2">Se inocularon 25 pl&aacute;ntulas de papa de 38 d&iacute;as de edad, propagadas mediante cultivo de tejidos. Las pl&aacute;ntulas contenidas en frascos con el medio MS se inocularon con 100 &#956;L de la suspensi&oacute;n bacteriana; el resultado se deposit&oacute; sobre el medio MS. Las pl&aacute;ntulas se colocaron a un fotoperiodo de 16 h luz y 8 h oscuridad, con temperaturas de 19 y 16 &deg;C, respectivamente, y se revisaron cada d&iacute;a hasta que se observ&oacute; la aparici&oacute;n de una biopel&iacute;cula en la periferia de la rad&iacute;cula. Posteriormente, se reaislaron las bacterias del interior de cinco pl&aacute;ntulas cada semana durante un periodo de 35 d&iacute;as.</font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2">Las pl&aacute;ntulas se sumergieron durante un minuto en recipientes est&eacute;riles que conten&iacute;an una soluci&oacute;n de alcohol et&iacute;lico al 10%. Consecutivamente, se colocaron por 5 min en una soluci&oacute;n de hipoclorito de sodio al 3% y, finalmente, se retiraron los residuos de hipoclorito de sodio enjuagando abundantemente con agua destilada est&eacute;ril. El exceso de agua se elimin&oacute; utilizando toallas desechables est&eacute;riles. De acuerdo con el peso de las pl&aacute;ntulas, se llev&oacute; a cabo una diluci&oacute;n 10<sup>1</sup> en agua peptonada al 1% y se maceraron. Se realizaron diluciones seriadas hasta 10<sup>3</sup> y 10<sup>4</sup>, las cuales se inocularon en medio PDA. Los aislados bacterianos obtenidos se transfirieron al medio KB para su consecutivo an&aacute;lisis. Los datos de la densidad poblacional de <i>Pseudomonas</i> sp. en el interior de las pl&aacute;ntulas y en el medio MS se analizaron con el programa Statistical Analysis System (SAS Institute, 1990). Se realiz&oacute; una prueba de comparaci&oacute;n de medias mediante la prueba de Tukey con una probabilidad del 5%.</font></p>  	    ]]></body>
<body><![CDATA[<p align="justify"><font face="verdana" size="2">El DNA total de las cepas de <i>Pseudomonas</i> sp. se obtuvo utilizando un equipo comercial de purificaci&oacute;n Wizard Genomic DNA. El gen <i>ribosomal 16S</i> DNAr se amplific&oacute; con los iniciadores 27f y 1495r (Grifoni <i>et al.,</i> 1995), utilizando la enzima GoTaq DNA polymerase (Promega). La reacci&oacute;n en cadena de la polimerasa (PCR) se realiz&oacute; en un termociclador Mastercycler gradient, siguiendo las indicaciones descritas por el fabricante. Las condiciones de la amplificaci&oacute;n consistieron en un ciclo inicial de desnaturalizaci&oacute;n (95 &deg;C, 5 min), 35 ciclos de amplificaci&oacute;n (95 &deg;C, 1 min; 60 &deg;C, 1 min; 72 &deg;C, 1 min 30 s) y, finalmente, un ciclo de elongaci&oacute;n (72 &deg;C, 10 min). El fragmento del gen <i>ribosomal 16S</i> amplificado (ca. 1.5 kb) fue digerido con 5 U de las enzimas de restricci&oacute;n <i>Alu</i>I, <i>Hae</i>III y <i>Hha</i>I<b><i>.</i></b> El perfil de restricci&oacute;n se determin&oacute; y compar&oacute; entre las distintas cepas bacterianas mediante electroforesis en geles de agarosa al 3%. El fragmento amplificado del gen <i>16S</i> DNAr se clon&oacute; en el vector PCR2.1, utilizando un equipo comercial TA cloning kit. La secuencia del gen <i>16S</i> DNAr se obtuv&oacute; en un secuenciador de Applied Biosystems Mod. 3730, usando los iniciadores universales M13 presentes en el vector. La secuencia se compar&oacute; en la base de datos EMBL/GenBank, y las secuencias relacionadas se alinearon, utilizando el programa Clustal W (Thompson <i>et al.,</i> 1994). La topolog&iacute;a del &aacute;rbol se infiri&oacute; con el m&eacute;todo de neighbor&#45;joining (Saitou y Nei, 1987), utilizando el modelo de Jukes y Cantor (1969), presente en el programa MEGA, versi&oacute;n 4 (Kumar <i>et al.,</i> 2001).</font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2">&nbsp;</font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2"><b>RESULTADOS Y DISCUSI&Oacute;N</b></font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2"><b>Inoculaci&oacute;n de pl&aacute;ntulas con la cepa de <i>Pseudomonas</i> sp.</b></font></p> 	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2">De acuerdo con los datos de la absorbancia (<i>A</i><sub>535</sub>) y la concentraci&oacute;n de c&eacute;lulas expresada en Log<sub>10</sub> UFC mL<sup>&#45;1</sup> de cultivo, obtenidos en la cin&eacute;tica de crecimiento para la cepa de <i>Pseudomonas</i> sp. en medio PDI (<a href="../img/revistas/tl/v27n3/a5fi1.jpg" target="_blank">Figura 1</a>), el tiempo de duplicaci&oacute;n de la bacteria fue de 47.93 min (<a href="../img/revistas/tl/v27n3/a5fi2.jpg" target="_blank">Figura 2</a>). Comparando el tiempo de duplicaci&oacute;n de la cepa de <i>Pseudomonas</i> sp. con el de otras cepas correspondientes al mismo g&eacute;nero, se tiene, por ejemplo, que la cepa de <i>Pseudomonas fluorescens</i> present&oacute; un tiempo de duplicaci&oacute;n de 2 h, de acuerdo con el estudio realizado por Caldwell y Lawrence (1986).</font></p> 	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2">Con un valor de absorbancia (A<sub>535</sub>) cercano a 0.3 a las 8 h posteriores a la inoculaci&oacute;n del medio con la bacteria, se tuvo una concentraci&oacute;n promedio de c&eacute;lulas de 10<sup>8</sup> UFC mL<sup>&#45;1</sup> de cultivo: concentraci&oacute;n de c&eacute;lulas recomendada para llevar a cabo la inoculaci&oacute;n de las pl&aacute;ntulas de papa, de acuerdo con lo establecido por Germaine <i>et al.</i> (2004). En un periodo de siete d&iacute;as despu&eacute;s de la inoculaci&oacute;n de las pl&aacute;ntulas con la suspensi&oacute;n bacteriana de <i>Pseudomonas</i> sp., se observ&oacute; la asociaci&oacute;n ra&iacute;z&#45;bacteria dada por la formaci&oacute;n de la biopel&iacute;cula alrededor de las ra&iacute;ces (<a href="../img/revistas/tl/v27n3/a5fi3.jpg" target="_blank">Figura 3</a>).</font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2">Rainey (1999) report&oacute; que la asociaci&oacute;n de la ra&iacute;z de la ca&ntilde;a de az&uacute;car con diferentes cepas de <i>Pseudomonas</i> ocurri&oacute; a los 14 d&iacute;as de la inoculaci&oacute;n.</font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2">En la investigaci&oacute;n realizada por Turnbull <i>et al.</i> (2001), la colonizaci&oacute;n de las ra&iacute;ces de plantas de trigo tambi&eacute;n llev&oacute; m&aacute;s tiempo (nueve d&iacute;as). De acuerdo con estas investigaciones, el tiempo que tarda el microorganismo para asociarse a las ra&iacute;ces depende de varios factores; uno de los principales, es la afinidad que &eacute;ste presenta con respecto a la composici&oacute;n de los exudados liberados por la planta (Hansen <i>et al.</i>, 1997). Estos exudados, seg&uacute;n Rainey (1999), est&aacute;n compuestos de lipopolisac&aacute;ridos, celulosa, tiamina, amino&aacute;cidos, biotina e isoflavonoides, los cuales sirven como nutrientes para las bacterias que se asocian. En el caso de las cepas de <i>Pseudomonas,</i> se ha comprobado que su asociaci&oacute;n con la ra&iacute;z de solan&aacute;ceas (como el tomate), se da principalmente por la utilizaci&oacute;n de los &aacute;cidos org&aacute;nicos, los cuales les sirven como base nutrimental (Lugtenberg y Dekkers, 1999; Normander y Prosser, 2000; Bloemberg y Lugtenberg, 2001; Berg <i>et al.,</i> 2005).</font></p> 	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2"><b>Reaislamiento de <i>Pseudomonas</i> sp. de pl&aacute;ntulas de papa cv. alpha</b></font></p> 	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2">La densidad poblacional promedio de <i>Pseudomonas</i> sp. en el interior de las pl&aacute;ntulas de papa, luego de observada la asociaci&oacute;n ra&iacute;z&#45;bacteria (siete d&iacute;as), fue de 64 UFC g<sup>&#45;1</sup> de tejido vegetal (<a href="../img/revistas/tl/v27n3/a5fi4.jpg" target="_blank">Figura 4</a>). Despu&eacute;s de dos semanas de incubaci&oacute;n, este valor aument&oacute;, alcanzando concentraciones promedio de 1.53 x 10<sup>7</sup> UFC g<sup>&#45;1</sup> de tejido vegetal. De acuerdo con el an&aacute;lisis estad&iacute;stico realizado, fue la concentraci&oacute;n m&aacute;s alta que se alcanz&oacute; durante el periodo de incubaci&oacute;n. Para las siguientes semanas disminuy&oacute; manteni&eacute;ndose constante con una concentraci&oacute;n promedio de 1.92 x 10<sup>5</sup> UFC g<sup>&#45;1</sup> de tejido vegetal. El crecimiento de la bacteria en medio MS, durante las cuatro primeras semanas, se mantuvo constante, siendo que se hab&iacute;a partido de una concentraci&oacute;n promedio de 17 UFC g<sup>&#45;1</sup> de medio MS en la primera semana y para la cuarta se lleg&oacute; a 4.48 x 10<sup>5</sup> UFC g<sup>&#45;1</sup> de medio MS. Al final de la investigaci&oacute;n, la densidad poblacional promedio de <i>Pseudomonas</i> sp. en la pl&aacute;ntula y en medio MS present&oacute; valores cercanos a 10<sup>5</sup> UFC g<sup>1</sup> de muestra. El comportamiento de la densidad poblacional de la cepa <i>Pseudomonas</i> sp. utilizada en el presente trabajo, fue semejante al observado por Ramos <i>et al.</i> (2000) cuando trabajaron con <i>Pseudomonas putida</i> en la colonizaci&oacute;n de ra&iacute;ces de cebada. En condiciones est&eacute;riles, <i>P. putida</i> present&oacute; altas velocidades de crecimiento durante un d&iacute;a, posterior a la colonizaci&oacute;n, pero el potencial de las velocidades de crecimiento disminuy&oacute; al trabajar en condiciones no est&eacute;riles. Los resultados obtenidos demuestran que, con esta forma de inoculaci&oacute;n, se consiguen altas densidades poblacionales en el interior de los tejidos (10<sup>7</sup> UFC g<sup>&#45;1</sup> de tejido vegetal) del microorganismo inoculado.</font></p> 	    ]]></body>
<body><![CDATA[<p align="justify"><font face="verdana" size="2">En este estudio, hacia la cuarta semana, se tuvo una densidad promedio de 1.92 x 10<sup>5</sup> UFC g<sup>&#45;1</sup> de tejido vegetal (<a href="../img/revistas/tl/v27n3/a5fi4.jpg" target="_blank">Figura 4</a>), cifras semejantes a las obtenidas por Sturz y Nowak (2000), quienes encontraron una densidad poblacional de 10<sup>2</sup> a 10<sup>7</sup> UFC g<sup>&#45;1</sup> de tejido vegetal. Al trabajar con cepas de <i>Pseudomonas,</i> Germaine <i>et al.</i> (2004) reportaron una densidad bacteriana en plantas de &aacute;lamo de 10<sup>3</sup> a 10<sup>4</sup> UFC g<sup>&#45;1</sup> de tejido vegetal. Adachi <i>et al.</i> (2002) encontraron una densidad poblacional de 10<sup>2</sup> a 10<sup>4</sup> UFC g<sup>&#45;1</sup> de tejido vegetal en camote. Garbeva <i>et al.</i> (2001) reportaron una concentraci&oacute;n de bacterias end&oacute;fitas en plantas de papa de 10<sup>3</sup> a 10<sup>5</sup> UFC g<sup>&#45;1</sup> de tejido vegetal. Recuenco y Van Vuurde (2000) encontraron valores de 10<sup>3</sup> a 10<sup>7</sup> UFC g<sup>&#45;1</sup> de tejido vegetal en el cultivo de pera. En la comparaci&oacute;n entre los resultados obtenidos y los reportados por otros investigadores (Garbeva <i>et al.,</i> 2001; Adachi <i>et al.,</i> 2002; Germaine <i>et al.,</i> 2004), con el tiempo requerido para la colonizaci&oacute;n y la densidad poblacional endof&iacute;tica, var&iacute;a de acuerdo con el tipo de microorganismo y al tipo de planta a la cual sea asociado.</font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2">Para corroborar que la cepa inoculada y la aislada de las pl&aacute;ntulas de papa era la misma, se hicieron dos pruebas: la primera consisti&oacute; en observar las caracter&iacute;sticas de las colonias sobre medio KB. Se obtuvieron colonias cremosas, redondas y con emisi&oacute;n de fluorescencia ante luz UV (<a href="#a5fi5">Figura 5</a>). La segunda prueba consisti&oacute; en comparar los patrones de la digesti&oacute;n del gen <i>ribosomal 16S</i> del DNAr, de la cepa inoculada y la extra&iacute;da.</font></p>  	    <p align="center"><font face="verdana" size="2"><a name="a5fi5"></a></font></p>  	    <p align="center"><font face="verdana" size="2"><b><img src="../img/revistas/tl/v27n3/a5fi5.jpg"></b></font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2"><b>An&aacute;lisis de la restricci&oacute;n del <i>16S</i> DNAr amplificado (ARDRA)</b></font></p> 	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2">El gen <i>ribosomal 16S</i> DNAr amplificado de seis aislados, correspondientes a dos aislados de la cepa de <i>Pseudomonas</i> inoculada, y cuatro aislados recobrados al t&eacute;rmino del periodo de incubaci&oacute;n de las pl&aacute;ntulas inoculadas, se digirieron individualmente con tres enzimas de restricci&oacute;n de corte frecuente. Los resultados mostraron que tanto los cuatro aislados recobrados de las pl&aacute;ntulas de papa, como la cepa inoculada, presentaban el mismo perfil ARDRA con las distintas enzimas de restricci&oacute;n (<a href="../img/revistas/tl/v27n3/a5fi6.jpg" target="_blank">Figura 6</a>), lo cual sugiere que las cepas recuperadas de las pl&aacute;ntulas de papa correspond&iacute;an a la cepa inoculada. La metodolog&iacute;a de ARDRA se ha utilizado anteriormente para diferenciar cepas de <i>Rhizobium</i> (Laguerre <i>et al.,</i> 1994) y <i>Burkholderia</i> (Estrada&#45;de los Santos <i>et al.,</i> 2001). No obstante, dada la gran similitud que puede llegar a existir entre las copias del gen <i>16S</i> DNAr de especies correspondientes a un mismo g&eacute;nero (Fox <i>et al.,</i> 1992; Mart&iacute;nez&#45;Murcia <i>et al.,</i> 1992), las cepas inoculadas y extra&iacute;das se analizaron con mayor grado de exhaustividad mediante la metodolog&iacute;a de rep&#45;PCR (Repetitive Extragenic Palindromic PCR) (Louws <i>et al.,</i> 1994). El an&aacute;lisis de los resultados mostr&oacute; que ambas cepas corresponden al mismo linaje bacteriano, confirmando que la cepa recuperada en los ensayos de inoculaci&oacute;n, realmente correspond&iacute;a a la cepa que se inocul&oacute; a las pl&aacute;ntulas de papa.</font></p> 	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2"><b>An&aacute;lisis filogen&eacute;tico del gen <i>16S</i> DNAr</b></font></p> 	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2">Para conocer la identidad del aislado bacteriano utilizado en este trabajo, la secuencia del gen <i>16S</i> DNAr se obtuvo y compar&oacute; en la base de datos del GenBank. El resultado mostr&oacute; que la cepa inoculada pose&iacute;a 97% de similitud con la cepa Nj&#45;55 de <i>Pseudomonas</i> sp. (AM409368) y con una clona bacteriana no cultivada (AY958838). El an&aacute;lisis filogen&eacute;tico de las secuencias del gen <i>16S</i> DNAr de la cepa inoculada y de la mayor&iacute;a de las especies del g&eacute;nero <i>Pseudomonas</i> descritas oficialmente, determin&oacute; que la cepa inoculada se localiz&oacute; en el grupo de <i>P. fluorescens</i> (Anzai <i>et al.,</i> 2000), pero sin corresponder a ninguna de las especies ya descritas en este g&eacute;nero bacteriano. Un an&aacute;lisis filogen&eacute;tico enfocado a las especies contenidas en el grupo de <i>P. fluorescens</i> (<a href="../img/revistas/tl/v27n3/a5fi7.jpg" target="_blank">Figura 7</a>), mostr&oacute; que la especie m&aacute;s cercana a la cepa inoculada fue <i>P. brenneri</i> con 96% similitud (Baida <i>et al.</i>, 2001).</font></p> 	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2">Con respecto a los resultados del an&aacute;lisis de la secuencia del gen <i>16S</i> DNAr, la cepa utilizada en los experimentos se identific&oacute; como perteneciente al g&eacute;nero <i>Psesudomonas.</i> Se ha sugerido que un porcentaje mayor al 97% de similitud entre secuencias del gen <i>16S</i> DNAr corresponde a cepas que comparten una identidad gen&oacute;mica igual a o mayor de 70%, clasific&aacute;ndolas como la misma especie bacteriana (Stackebrandt y Goebel, 1994). No obstante, en la actualidad se requiere de un an&aacute;lisis taxon&oacute;mico de car&aacute;cter polif&aacute;sico, para proponer una nueva especie bacteriana (Stackebrandt <i>et al.,</i> 2002). Dado que el porcentaje de similitud entre <i>Pseudomonas</i> sp. y la especie m&aacute;s cercana (y descrita v&aacute;lidamente) es del 96%, se sugiere que podr&iacute;a tratarse de una nueva especie de <i>Pseudomonas.</i> Sin embargo, un estudio taxon&oacute;mico polif&aacute;sico de un n&uacute;mero importante de aislados, as&iacute; como especies ya descritas del g&eacute;nero <i>Pseudomonas,</i> deber&aacute; ser realizado para proponer a la cepa de <i>Pseudomonas</i> utilizada como una nueva especie de este g&eacute;nero bacteriano.</font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2">Del an&aacute;lisis de los resultados obtenidos sobre la densidad de la poblaci&oacute;n bacteriana en las pl&aacute;ntulas de papa y el an&aacute;lisis de la secuencia del gen <i>16S</i> DNAr de los aislados de la cepa inoculada y extra&iacute;da, puede decirse que, una vez que <i>Pseudomonas</i> sp. se asoci&oacute; a las ra&iacute;ces de las pl&aacute;ntulas, penetr&oacute; y coloniz&oacute; el interior de los tejidos, estableci&eacute;ndose en forma endof&iacute;tica.</font></p>  	    ]]></body>
<body><![CDATA[<p align="justify"><font face="verdana" size="2">A diferencia de las t&eacute;cnicas de inoculaci&oacute;n tradicionales: inoculaci&oacute;n hidrop&oacute;nica, inoculaci&oacute;n en semilla, planta, ra&iacute;ces, suelo y combinaciones de ellas, en las cuales, en ocasiones, es utilizado suelo con tratamiento t&eacute;rmico para disminuir la cantidad de microorganismos presentes, a&uacute;n se tiene el problema de la presencia de microorganismos pertenecientes a la comunidad endofitica aut&oacute;ctona de las semillas y las plantas, los cuales podr&iacute;an impedir la colonizaci&oacute;n de los tejidos de la planta con el microorganismo inoculado. Al utilizar las t&eacute;cnicas de inoculaci&oacute;n mencionadas, si se desea medir la poblaci&oacute;n endofitica de la cepa inoculada, es necesaria la utilizaci&oacute;n de herramientas como microscopia de fluorescencia o el uso de cepas resistentes a antibi&oacute;ticos (rifampicina) (Hallmann <i>et al.,</i> 2001; Germaine <i>et al.,</i> 2004). De esta manera, se podr&iacute;a descartar el crecimiento de los microorganismos distintos al estudiado. Con la forma de inoculaci&oacute;n utilizada en este trabajo, se requiere menor cantidad de suspensi&oacute;n bacteriana (100 &#956;L), con una concentraci&oacute;n de c&eacute;lulas de 10<sup>8</sup> UFC mL<sup>&#45;1</sup> para inocular cinco plantas; logrando la misma efectividad que con la metodolog&iacute;a propuesta por Benhamou <i>et al.</i> (1996), en donde se utilizan 2 mL de cultivo con la misma concentraci&oacute;n celular. En la metodolog&iacute;a propuesta por Sturz <i>et al.,</i> (1998) para la inoculaci&oacute;n de pl&aacute;ntulas de papa, se tiene una mayor manipulaci&oacute;n de las pl&aacute;ntulas, lo cual implica un mayor riesgo de contaminaci&oacute;n por microorganismos durante la inoculaci&oacute;n. Este m&eacute;todo para <i>Pseudomonas</i> sp. a pl&aacute;ntulas de papa se utiliz&oacute; para evaluar el efecto de la cepa con respecto a la degradaci&oacute;n de los plaguicidas m&aacute;s utilizados en el cultivo. De esta forma, se garantiz&oacute; que el &uacute;nico efecto observado sobre la degradaci&oacute;n del agroqu&iacute;mico, dado por el metabolismo microbiano, fuera del microorganismo inoculado. Esta metodolog&iacute;a, que permite introducir bacterias de inter&eacute;s antropol&oacute;gico para la producci&oacute;n de minitub&eacute;rculo, no implica m&aacute;s que la adici&oacute;n del in&oacute;culo bacteriano en el transcurso del desarrollo de la pl&aacute;ntula <i>in vitro.</i> Este mecanismo de producci&oacute;n de minitub&eacute;rculo, adem&aacute;s de ser innovador, pr&aacute;ctico y de aplicaci&oacute;n inmediata, ofrece una alternativa a la creciente demanda de productos agr&iacute;colas con bajos niveles de plaguicidas, ya que pueden ser introducidos a las pl&aacute;ntulas microorganismos degradadores de agroqu&iacute;micos, los cuales promuevan el crecimiento, o incluso microorganismos antag&oacute;nicos que reaccionen en contra de algunos fitopat&oacute;genos.</font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2">&nbsp;</font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2"><b>CONCLUSIONES</b></font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2">&#45;&nbsp;Se produjo <i>in vitro</i> pl&aacute;ntula de papa inoculada con la cepa de <i>Pseudomonas</i> sp. La cepa de <i>Pseudomonas</i> sp. form&oacute; una biopel&iacute;cula alrededor de las ra&iacute;ces de pl&aacute;ntula de papa a los siete d&iacute;as posteriores a la inoculaci&oacute;n y, a su vez, logr&oacute; establecerse en forma endof&iacute;tica en las pl&aacute;ntulas, alcanzando una densidad poblacional de 1.92 x 10<sup>5</sup> UFC g<sup>&#45;1</sup> de tejido vegetal en la quinta semana de incubaci&oacute;n.</font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2">&#45;&nbsp;De acuerdo con el an&aacute;lisis filogen&eacute;tico del Gen <i>16S</i> DNAr, la cepa utilizada en este trabajo qued&oacute; localizada en el grupo de <i>Pseudomonas,</i> pero sin corresponder a algunas de las especies ya descritas en este g&eacute;nero bacteriano, por lo que pudiera tratarse de una nueva especie.</font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2">&nbsp;</font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2"><b>AGRADECIMIENTOS</b></font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2">A la Maestra en Ciencias Ma. Antonia Cruz del Laboratorio de Interacci&oacute;n Planta Microorganismo del Centro de Biotecnolog&iacute;a Geon&oacute;mica del IPN, por su colaboraci&oacute;n en la caracterizaci&oacute;n de la fracci&oacute;n del gen <i>ribosomal 16S</i> de la cepa de <i>Pseudomonas</i> sp.</font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2">&nbsp;</font></p>  	    <p align="justify"><font face="verdana" size="2"><b>LITERATURA CITADA</b></font></p>  	    ]]></body>
<body><![CDATA[<!-- ref --><p align="justify"><font face="verdana" size="2">Adachi, K., M. Nakatani, and H. Mochida. 2002. Isolation of an endophytic <i>Diazotroph, Klebsiella oxytoca,</i> from sweet potato stems in Japan. Lett. Appl. Microbiol. 48: 889&#45;895.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=9800620&pid=S0187-5779200900030000500001&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></font></p>  	    <!-- ref --><p align="justify"><font face="verdana" size="2">Anzai, Y., H. Kim, J. H. Park, H. Wakabayashi, and H. Oyaizu. 2000. Phylogenetic affiliation of the pseudomonads based on 16S rRNA sequence. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 50: 1563&#45;1589.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=9800622&pid=S0187-5779200900030000500002&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></font></p>  	    <!-- ref --><p align="justify"><font face="verdana" size="2">Baida, N., A. Yazourh, E. Singer, and D. Izard. 2001. <i>Pseudomonas brenneri</i> sp. nov., a new species isolated from natural mineral waters. Res. Microbiol. 152: 493&#45;502.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=9800624&pid=S0187-5779200900030000500003&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></font></p>  	    <!-- ref --><p align="justify"><font face="verdana" size="2">Benhamou, N., J. W. Kloepper, A. Quadt&#45;Hallman, and S. Tuzun. 1996. Induction of defense&#45;related ultrastructural modifications in pea root tissues inoculated with endophytic bacteria. Plant Physiol. 112: 919&#45;929.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=9800626&pid=S0187-5779200900030000500004&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></font></p>  	    <!-- ref --><p align="justify"><font face="verdana" size="2">Berg, G., A. Krechel, M. Ditz, R. Sikora, A. Ulrich, and J. Llaman. 2005. Endophytic and ectophytic potato&#45;associated bacterial communities differ in structure and antagonistic function against plant pathogenic fungi. FEMS Microbiol. Ecol. 51: 215&#45;229.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=9800628&pid=S0187-5779200900030000500005&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></font></p>  	    ]]></body>
<body><![CDATA[<!-- ref --><p align="justify"><font face="verdana" size="2">Bloemberg, G. and B. Lugtenberg. 2001. Molecular basis of plant growth promotion and biocontrol by rhizobacteria. Curr. Opin. Plant Biol. 4: 343&#45;350.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=9800630&pid=S0187-5779200900030000500006&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></font></p>  	    <!-- ref --><p align="justify"><font face="verdana" size="2">Caldwell, D. E. and J. R. Lawrence. 1986. Growth kinetics of <i>Pseudomonas fluorescens</i> microcolonies within the hydrodynamic boundary layers of surface microenvironments. Microbial Ecology 12: 299&#45;312.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=9800632&pid=S0187-5779200900030000500007&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></font></p>  	    <!-- ref --><p align="justify"><font face="verdana" size="2">Davey, M. E. and G. A. O'Toole. 2000. Microbial biofilms: from ecology to molecular genetics. Microbiol. Mol. Biol. Rev. 64: 847&#45;867.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=9800634&pid=S0187-5779200900030000500008&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></font></p>  	    <!-- ref --><p align="justify"><font face="verdana" size="2">De Meyer, G. and M. H&ouml;fte. 1997. Salycilic acid produced by rhizobacterium <i>Pseudomonas aeuroginosa</i> 7NSK2 induces resistance to leaf infection by <i>Botrytis cinerea</i> on bean. Phytopathology 87: 588&#45;593.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=9800636&pid=S0187-5779200900030000500009&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></font></p>  	    <!-- ref --><p align="justify"><font face="verdana" size="2">Duffy, B. K. and G. D&eacute;fago. 1977. Zinc improves biocontrol of fusarium crown and root rot of tomato by <i>Pseudomonas fluorescens</i> and represses the production of pathogen metabolites inhibitory to bacterial antibiotic biosynthesis. Phytopathology 87: 1250&#45;1257.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=9800638&pid=S0187-5779200900030000500010&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></font></p>  	    ]]></body>
<body><![CDATA[<!-- ref --><p align="justify"><font face="verdana" size="2">Dupler, M. and R. Baker. 1984. Survival of <i>Pseudomonas putida,</i> a biological control agent, in soil. Phytopathology 74: 195&#45;200.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=9800640&pid=S0187-5779200900030000500011&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></font></p>  	    <!-- ref --><p align="justify"><font face="verdana" size="2">Estrada&#45;de los Santos, P., R. Bustillos&#45;Cristales, and J. Caballero&#45;Medallo. 2001. <i>Burkholderia,</i> a genus rich in plant&#45;associated nitrogen fixers with wide environmental and geographic distribution. Appl. Environ. Microbiol. 67: 2790&#45;2798.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=9800642&pid=S0187-5779200900030000500012&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></font></p>  	    <!-- ref --><p align="justify"><font face="verdana" size="2">Fox, G. E., J. D. Wisotzkey, and P. Jurtshuk. 1992. How close is close: 16S rRNA sequence identity may not be sufficient to guarantee species identity. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 42: 166&#45;170.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=9800644&pid=S0187-5779200900030000500013&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></font></p>  	    <!-- ref --><p align="justify"><font face="verdana" size="2">Fujishige, N. A., N. N. Kapadia, and A. M. Hirsch. 2006. A feeling for the micro&#45;organisms: structure on a small scale. Biofilms on plant roots. Bot. J. Linn. Soc. 150: 79&#45;88.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=9800646&pid=S0187-5779200900030000500014&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></font></p>  	    <!-- ref --><p align="justify"><font face="verdana" size="2">Garbeva, P., L. S. van Overbeek, J. W. L. van Vuurde, and J. D. van Elsas. 2001. Analysis of endophytic bacterial communities of potato by planting and denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE) of 16S rDNA based PCR fragments. Microbiol. Ecol. 41: 369&#45;383.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=9800648&pid=S0187-5779200900030000500015&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></font></p>  	    ]]></body>
<body><![CDATA[<!-- ref --><p align="justify"><font face="verdana" size="2">Germaine, K., E. Keogh, G. Garc&iacute;a&#45;Cabellos, B. Borremans, D. van der Lelie, T. Barac, L. Oeyen, J. Vangronsveld, F. Porteus Moore, E. R. B. Moore, C. D. Campbell, D. Ryan, and D. N. Dowling. 2004. Colonization of popular trees by gfp expressing bacterial endophytes. FEMS Microbiol. Ecol. 48: 109&#45;118.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=9800650&pid=S0187-5779200900030000500016&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></font></p>  	    <!-- ref --><p align="justify"><font face="verdana" size="2">Grifoni, A., M. Bazzicalupo, C. Di Serio, S. Fancelli, and R. Fani. 1995. Identification of <i>Azospirillum</i> strains by restriction fragment length polymorphism of the 16S rDNA and of the histidine operon. FEMS Microbiol. Lett. 127: 85&#45;91.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=9800652&pid=S0187-5779200900030000500017&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></font></p>  	    <!-- ref --><p align="justify"><font face="verdana" size="2">Hallmann, J., A. Quadt&#45;Hallmann, W. G. Miller, R. A. Sikora, and S. E. Lindow. 2001. Endophytic colonization of plants by the biocontrol agent <i>Rhizobium etli</i> G12 in relation to <i>Meloidogyne incognita</i> infection. Phytopathology 91: 415&#45;422.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=9800654&pid=S0187-5779200900030000500018&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></font></p>  	    <!-- ref --><p align="justify"><font face="verdana" size="2">Hansen, M., L. Kragelund, O. Nybroe, and J. S&oslash;rensen. 1997. Early colonization of barley roots by Pseudomonas fluorescens studied by immunofluorescence technique and confocal. FEMS Microbiol. Ecol. 23: 353&#45;360.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=9800656&pid=S0187-5779200900030000500019&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></font></p>  	    <!-- ref --><p align="justify"><font face="verdana" size="2">Jukes, T. H. and C. R. Cantor. 1969. Evolution of protein molecules. pp. 21&#45;132. <i>In:</i> H. N. Munro (ed.). Mammalian protein metabolism. Academic Press. New York, NY, USA.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=9800658&pid=S0187-5779200900030000500020&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></font></p>  	    ]]></body>
<body><![CDATA[<!-- ref --><p align="justify"><font face="verdana" size="2">Kenney, D. S., M. S. Reddy, and J. W. Kloepper. 1999. Commercial potential of biological preparations for vegetable transplants. Phytopathology 89: S39.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=9800660&pid=S0187-5779200900030000500021&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></font></p>  	    <!-- ref --><p align="justify"><font face="verdana" size="2">Kim, D., J. Cook, and D. M. Weller. 1997. <i>Bacillus</i> sp. L324&#45;92 for biological control of three root diseases of wheat grown with reduced tillage. Am. Phytopathol. Soc. 87: 551&#45;558.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=9800662&pid=S0187-5779200900030000500022&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></font></p>  	    <!-- ref --><p align="justify"><font face="verdana" size="2">Kloepper, J. W. and C. J. Beauchamp. 1992. A Review of issues related to measuring colonization of plant roots by bacteria. Can. J. Microbiol. 38: 1219&#45;1232.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=9800664&pid=S0187-5779200900030000500023&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></font></p>  	    <!-- ref --><p align="justify"><font face="verdana" size="2">Kloepper, J. W., R. Rodriguez&#45;Kabana, D. S. Kenney, M. S. Reddy, N. Martinez&#45;Ochoa, N. Kokalis&#45;Burelle, and K. Arthur. 1999. Development of an integrated biological approach to develop transplants suppressive to various plant diseases. Phytopathology 89: S40.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=9800666&pid=S0187-5779200900030000500024&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></font></p>  	    <!-- ref --><p align="justify"><font face="verdana" size="2">Knee, E., F. Gong, M. Teplitski, A. Jones, A. Foxworthy, A. Mort, and W. Bauer. 2001. Root mucilage from pea and its utilization by rhizosphere bacteria as a sole carbon source. Mol. Plant&#45;Microbe Interact. 14: 775&#45;784.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=9800668&pid=S0187-5779200900030000500025&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></font></p>  	    ]]></body>
<body><![CDATA[<!-- ref --><p align="justify"><font face="verdana" size="2">Kumar, S., K. Tamura, I. B. Jakobsen, and M. Nei. 2001. MEGA2: Molecular Evolutionary Genetics Analysis Software. Arizona University. Tempe, AZ, USA.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=9800670&pid=S0187-5779200900030000500026&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></font></p>  	    <!-- ref --><p align="justify"><font face="verdana" size="2">Laguerre, G., M. R. Allard, F. Revoy, and N. Amarger. 1994. Rapid identification of rhizobia by restriction fragment length polymorphism analysis of PCR&#45;Amplified 16S rRNA genes. Appl. Environ. Microbiol. 60: 56&#45;63.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=9800672&pid=S0187-5779200900030000500027&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></font></p>  	    <!-- ref --><p align="justify"><font face="verdana" size="2">Leeman, M, J. A. van Pelt, F. M. den Ouden, M. Heinsbroek, P. A. H. M. Baker, and B. Schippers. 1995. Induction of systemic resistance against fusarium wilt of radish by lipopolysacarides of <i>Pseudomonas fluorescens.</i> Phytopathology 85: 1021&#45;1027.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=9800674&pid=S0187-5779200900030000500028&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></font></p>  	    <!-- ref --><p align="justify"><font face="verdana" size="2">Liu, L., J. W. Kloepper, and S. Tuzun. 1995. Induction of systemic resistance in cucumber by plant growth&#45;promoting <i>Rhizobacteria:</i> duration of protection and effect of host resistance on protection and root colonization. Phytopathology 85: 1064&#45;1068.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=9800676&pid=S0187-5779200900030000500029&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></font></p>  	    <!-- ref --><p align="justify"><font face="verdana" size="2">Lodewyckx, C., M. Megeay, J. Vangronsveld, J. Clijsters, and D. van der Lelie. 2002. Isolation, characterization and identification of bacteria associated to the zinc hyperaccumulator <i>Thlaspi caerulescens</i> subsp. <i>calaminaria.</i> Int. J. Phytorem. 4: 101&#45;115.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=9800678&pid=S0187-5779200900030000500030&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></font></p>  	    ]]></body>
<body><![CDATA[<!-- ref --><p align="justify"><font face="verdana" size="2">Louws, F. J., D. W. Fulbright, C. T. Stephens, and F. J. de Brujin. 1994. Specific genomic fingerprints of phytopathogenic <i>Xanthomonas</i> and <i>Pseudomonas pathovars</i> and strains generated with repetitive sequences and PCR. Appl. Environ. Microbiol. 60: 2286&#45;2295.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=9800680&pid=S0187-5779200900030000500031&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></font></p>  	    <!-- ref --><p align="justify"><font face="verdana" size="2">Lugtenberg, J. and L. Dekkers. 1999. What makes <i>Pseudomonas</i> bacteria rhizosphere competent? Environ. Microbiol. 1: 9&#45;13.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=9800682&pid=S0187-5779200900030000500032&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></font></p>  	    <!-- ref --><p align="justify"><font face="verdana" size="2">Mart&iacute;nez&#45;Murcia, A. J., S. Benlloch, and M. D. Collins. 1992. Phylogenetic interrelationships of members of the genera <i>Aeromonas</i> and <i>Plesiomonas</i> as determined by 16S ribosomal DNA sequencing: lack of congruence with results of DNA&#45;DNA hybridizations. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 42: 412&#45;421.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=9800684&pid=S0187-5779200900030000500033&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></font></p>  	    <!-- ref --><p align="justify"><font face="verdana" size="2">Normander, B. and J. Prosser. 2000. Bacterial origin and community composition in the barley phytosphere as a function of habitat and presowing conditions. Appl. Environ. Microbiol. 66: 4372&#45;4377.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=9800686&pid=S0187-5779200900030000500034&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></font></p>  	    <!-- ref --><p align="justify"><font face="verdana" size="2">Rainey, B. 1999. Adaptation of <i>Pseudomona fluorescens</i> to the plant rhizosphere. Environ. Microbiol. 1: 243&#45;257.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=9800688&pid=S0187-5779200900030000500035&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></font></p>  	    ]]></body>
<body><![CDATA[<!-- ref --><p align="justify"><font face="verdana" size="2">Ramos, C., L. Molbak, and S. Molin. 2000. Bacterial activity in the rhizosphere analyzed at the single&#45;cell level by monitoring ribosome contents and synthesis rates. Appl. Environ. Microbiol. 66: 801&#45;809.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=9800690&pid=S0187-5779200900030000500036&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></font></p>  	    <!-- ref --><p align="justify"><font face="verdana" size="2">Raupach, G. S., L. Liu, J. P. Murphy, S. Tuzun, and J. W. Kloepper, 1996. Induced systemic resistance in cucumber and tomato against cucumber mosaic cucumovirus using plant growth promoting rhizobacteria (PGPR). Plant Dis. 80: 891&#45;894.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=9800692&pid=S0187-5779200900030000500037&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></font></p>  	    <!-- ref --><p align="justify"><font face="verdana" size="2">Recuenco, M. E. and J. W. L. van Vuurde. 2000. Natural incidence of endophytic bacteria in pea cultivars under field conditions. Can. J. Microbiol. 46: 1036&#45;1041.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=9800694&pid=S0187-5779200900030000500038&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></font></p>  	    <!-- ref --><p align="justify"><font face="verdana" size="2">Reddy, M. S., R. Rodriguez&#45;Kabana, D. S. Kenney, C. M. Ryu, S. Zhang, Z. Yan, N. Martinez&#45;Ochoa, and J. W. Kloepper. 1999. Growth promotion and induced systemic resistance (ISR) mediated by a biological preparation. Phytopathology 89: S65.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=9800696&pid=S0187-5779200900030000500039&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></font></p>  	    <!-- ref --><p align="justify"><font face="verdana" size="2">Ryu, C. M., M. S. Reddy, S. Zhang, J. F. Murphy and J. W. Kloepper. 1999. Plant growth promotion of tomato by a biological preparation (LS213) and evaluation for protection against cucumber mosaic virus. Phytopathology 89: S67.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=9800698&pid=S0187-5779200900030000500040&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></font></p>  	    ]]></body>
<body><![CDATA[<!-- ref --><p align="justify"><font face="verdana" size="2">Saitou, N. and M. Nei. 1987. The neighbor&#45;joining method: a new method for reconstructing phylogenetic trees. Mol. Biol. Evol. 4: 406&#45;425.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=9800700&pid=S0187-5779200900030000500041&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></font></p>  	    <!-- ref --><p align="justify"><font face="verdana" size="2">SAS Institute. 1990. User's guide. Versi&oacute;n 6.12. SAS Institute. Cary, NC, USA.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=9800702&pid=S0187-5779200900030000500042&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></font></p>  	    <!-- ref --><p align="justify"><font face="verdana" size="2">Scarpellini, M., L. Franzetti, and A. Galli. 2004. Development of PCR assay to identify <i>Pseudomonas fluoresecens</i> and its biotype. FEMS Microbiol. Lett. 236: 257&#45;260.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=9800704&pid=S0187-5779200900030000500043&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></font></p>  	    <!-- ref --><p align="justify"><font face="verdana" size="2">Schisler, D. A., P. J. Slininger, and R. J. Bothast. 1997. Effects of antagonist cell concentration and two&#45;strain mixtures on biological control of fusarium dry rot of potatoes. Phytopathology 87: 177&#45;183.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=9800706&pid=S0187-5779200900030000500044&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></font></p>  	    <!-- ref --><p align="justify"><font face="verdana" size="2">Scott, G. J., M. W. Rosegrant, and C. Ringler. 2000. Roots and tubers for the 21<sup>st</sup> century. Trends, projections and policy options. Agriculture and the environment discussion. Paper 31. International Food Policy Research Institute. Washington, DC, USA.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=9800708&pid=S0187-5779200900030000500045&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></font></p>  	    ]]></body>
<body><![CDATA[<!-- ref --><p align="justify"><font face="verdana" size="2">Sharma, V. K. and J. Nowak. 1998. Enhancement of verticillium wilt resistance in tomato transplants by in vitro co&#45;culture of seedlings with a plant growth promoting rhizobacterium <i>(Pseudomonas</i> sp. strain PsJN). Can. J. Microbiol. 44: 528&#45;536.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=9800710&pid=S0187-5779200900030000500046&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></font></p>  	    <!-- ref --><p align="justify"><font face="verdana" size="2">Stackebrandt, E. and B. M. Goebel. 1994. Taxonomic note: a place for DNA&#45;DNA reassociation and 16S rRNA sequence analysis in the present species definition in bacteriology. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 44: 846&#45;849.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=9800712&pid=S0187-5779200900030000500047&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></font></p>  	    <!-- ref --><p align="justify"><font face="verdana" size="2">Stackebrandt, E., W. Frederiksen, G. M. Garrity, P. A. D. Grimont, P. Kampfer, M. C. J. Maiden, X. Nesme, R. Rossello&#45;Mora, J. Swings, G. Truper, L. Vauterin, A. C. Ward, and W. B. Whitman. 2002. Report of the <i>ad Hoc</i> Committee for the re&#45;evaluation of the species definition in bacteriology. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 52: 1043&#45;1047.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=9800714&pid=S0187-5779200900030000500048&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></font></p>  	    <!-- ref --><p align="justify"><font face="verdana" size="2">Sturz, A. V., B. R. Christie, and B. G. Matheson. 1998. Association of bacteria endophyte populations from red clover and potato crops with potential for beneficial allelopathy. Can. J. Microbiol. 44: 162&#45;167.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=9800716&pid=S0187-5779200900030000500049&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></font></p>  	    <!-- ref --><p align="justify"><font face="verdana" size="2">Sturz, A. V. and J. Nowark. 2000. Endophytic communities of rhizobacteria and the strategies required to create yield enhancing association with crops. Appl. Soil Ecol. 15: 83&#45;190.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=9800718&pid=S0187-5779200900030000500050&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></font></p>  	    ]]></body>
<body><![CDATA[<!-- ref --><p align="justify"><font face="verdana" size="2">Thompson, J. D., D. G. Higgins, and T. J. Gibson. 1994. CLUSTAL W: Improving the sensitivity of progressive multiple sequence alignment through sequence weighting, position&#45;specific gap penalties and weight matrix choice. Nucleic Acids Res. 22: 4673&#45;4680.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=9800720&pid=S0187-5779200900030000500051&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></font></p>  	    <!-- ref --><p align="justify"><font face="verdana" size="2">Turnbull, A., J. Morgan, J. Whipps, and J. Saunders. 2001. The role of bacterial motility in the survival and spread of <i>Pseudomonas fluorescens</i> in soil and in the attachment and colonisation of wheat roots. FEMS Microbiol. Ecol. 36: 21&#45;31.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=9800722&pid=S0187-5779200900030000500052&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></font></p>  	    <!-- ref --><p align="justify"><font face="verdana" size="2">Wilson, P., T. Whitwell, and J. Klaine. 2001. Metalaxyl toxicity, uptake, and distribution in several ornamental plant species. J. Environ. Qual. 30: 411&#45;417.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=9800724&pid=S0187-5779200900030000500053&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></font></p>  	    <!-- ref --><p align="justify"><font face="verdana" size="2">Zehnder, G. W., C. Yao, J. F. Murphy, E. R. Sikora, and J. W. Kloepper. 2000. Induction of resistance in tomato against cucumber mosaic cucumovirus by plant growth&#45;promoting rhizobacteria. Bio&#45;Control 45: 127&#45;137.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=9800726&pid=S0187-5779200900030000500054&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></font></p>      ]]></body><back>
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