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<article-title xml:lang="es"><![CDATA[Detección de Pantoea stewartii Mergaert, Verdonck & Kersters directamente de la semilla de maíz utilizando INMUNO -PCR]]></article-title>
<article-title xml:lang="en"><![CDATA[Detection of Pantoea stewartii Mergaert, Verdonck & Kersters directly from maize seeds using IMMUNO-PCR]]></article-title>
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<abstract abstract-type="short" xml:lang="en"><p><![CDATA[Immunological and molecular techniques based on DNA have been used for microorganism detection due to their sensitivity, specificity and speed. However, when the identification of bacteria with zero tolerance is required (eg. Pantoea stewartii), molecular and immunological techniques do not offer a 100% reliability. The objective of this study was to combine the ELISA and PCR techniques in order to complement their advantages and efficiently detect bacteria directly on seeds. A maize seed sample imported from the USA and with a high probability of being infected with Pantoea stewartii, and this was verified with ELISA, was used in this study. Having confirmed the presence of the bacterium, it was isolated and identified with microscopical, biochemical, physiological, tobacco hypersensibility, pathogenicity and PCR amplification of rDNA 16S tests. The immuno-PCR technique was then optimised (primer annealing temperature, antibody concentration, incubation temperature and microtube branding). The study showed that it is possible to amplify the DNA of P. stewartii directly from maize seeds, with an annealing temperature of 62 and 65 °C, incubation times of 1-3 hours, antibody concentrations of 5:200 and 10:200 and Fisher and Axigen microtubes. The adaptation and optimisation of the immuno-PCR technique is important as it may aid in the reduction of the risk of P. stewartii propagation towards areas free of bacteria.]]></p></abstract>
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</front><body><![CDATA[ <p align="justify"><font face="verdana" size="4">Art&iacute;culos</font></p>      <p align="justify"><font face="verdana" size="2">&nbsp;</font></p>     <p align="center"><font face="verdana" size="4"><b>Detecci&oacute;n de <i>Pantoea stewartii </i>Mergaert, Verdonck &amp; Kersters directamente de la semilla de ma&iacute;z utilizando INMUNO &#150;PCR</b></font></p>     <p align="center"><font face="verdana" size="2">&nbsp;</font></p>     <p align="center"><font face="verdana" size="3"><b>Detection of <i>Pantoea stewartii </i>Mergaert, Verdonck &amp; Kersters directly from maize seeds using IMMUNO&#150;PCR</b></font></p>     <p align="center"><font face="verdana" size="2">&nbsp;</font></p>     <p align="center"><font face="verdana" size="2"><b>JC Rocha&#150;Revilla<sup>1</sup>, R Rodr&iacute;guez&#150;Herrera<sup>*1</sup>, CN Aguilar&#150;Gonz&aacute;lez<sup>1</sup>, &#917; Ram&iacute;rez&#150;Ram&iacute;rez<sup>2</sup>, F Lara&#150;Victoriano<sup>2</sup></b></font></p>     <p align="justify"><font face="verdana" size="2">&nbsp;</font></p>     <p align="justify"><font face="verdana" size="2"><i><sup>1</sup> Facultad de Ciencias Qu&iacute;micas, Universidad Aut&oacute;noma de Coahuila, Blvd. V. Carranza y J. C&aacute;rdenas s/n, Saltillo Coahuila, CP25280. Saltillo Coahuila, M&eacute;xico. (JCRR)(RRH)(CNAG)</i> * Correo electr&oacute;nico: <a href="mailto:rrh961@hotmail.com"> rrh961@hotmail.com</a></font></p>     <p align="justify"><font face="verdana" size="2"><sup>2 </sup>Centro Internacional de Servicios Fitosanitarios S.A. de C.V. (ERR)(FLV)</font></p>     ]]></body>
<body><![CDATA[<p align="justify"><font face="verdana" size="2">&nbsp;</font></p>     <p align="justify"><font face="verdana" size="2">Art&iacute;culo recibido: 21 de febrero de 2008    <br>   Aceptado: 19 de noviembre de 2009</font></p>     <p align="justify"><font face="verdana" size="2">&nbsp;</font></p>     <p align="justify"><font face="verdana" size="2"><b>RESUMEN</b></font></p>     <p align="justify"><font face="verdana" size="2">T&eacute;cnicas moleculares basadas en ADN e inmunol&oacute;gicas han sido usadas para la detecci&oacute;n de microorganismos debido a su sensibilidad, especificidad y rapidez. Sin embargo, cuando se trata de identificar bacterias con cero tolerancia en los niveles de presencia (eg. <i>Pantoea stewartii</i>), los m&eacute;todos de an&aacute;lisis moleculares e inmunol&oacute;gicos no ofrecen el 100 por ciento de certeza de su detecci&oacute;n. El objetivo de la presente investigaci&oacute;n fue combinar las t&eacute;cnicas ELISA y PCR, con el fin de complementar las ventajas de cada una de ellas para detectar eficientemente la bacteria directamente de la semilla. Se utiliz&oacute; una muestra de semilla de ma&iacute;z importada de los Estados Unidos de Am&eacute;rica con altas probabilidades de estar infectada con <i>Pantoea stewartii, </i>lo cual se verific&oacute; por medio de ELISA. Una vez confirmada la presencia de la bacteria se procedi&oacute; a su aislamiento e identificaci&oacute;n por pruebas microsc&oacute;picas, bioqu&iacute;micas, fisiol&oacute;gicas, hipersensibilidad en tabaco, pruebas de patogenicidad y amplificaci&oacute;n de rDNA 16S. Posteriormente, se optimiz&oacute; la t&eacute;cnica de inmuno&#150;PCR (temperatura de alineamiento de iniciadores, concentraci&oacute;n de anticuerpos, temperatura de incubaci&oacute;n y marca de tubos). El estudio demostr&oacute; que es posible amplificar el ADN de <i>P. stewartii </i>directamente de la semilla de ma&iacute;z, con una temperatura de alineamiento de 62 y 65 &deg;C, tiempos de incubaci&oacute;n de 1&#150;3 horas, concentraciones de anticuerpos de 5:200 y 10:200 y con tubos marca Fisher y Axigen. La adaptaci&oacute;n y optimizaci&oacute;n de la t&eacute;cnica inmuno&#150;PCR es importante dado que se podr&iacute;an reducir los riesgos de propagaci&oacute;n de <i>P. stewartii </i>hacia lugares libres de ella.</font></p>     <p align="justify"><font face="verdana" size="2"><b>Palabras clave: </b>ELISA, anticuerpos, marca del tubo, marchitez de Stewart.</font></p>     <p align="justify"><font face="verdana" size="2">&nbsp;</font></p>     <p align="justify"><font face="verdana" size="2"><b>ABSTRACT</b></font></p>     <p align="justify"><font face="verdana" size="2">Immunological and molecular techniques based on DNA have been used for microorganism detection due to their sensitivity, specificity and speed. However, when the identification of bacteria with zero tolerance is required (eg. <i>Pantoea stewartii</i>), molecular and immunological techniques do not offer a 100% reliability. The objective of this study was to combine the ELISA and PCR techniques in order to complement their advantages and efficiently detect bacteria directly on seeds. A maize seed sample imported from the USA and with a high probability of being infected with <i>Pantoea stewartii, </i>and this was verified with ELISA, was used in this study. Having confirmed the presence of the bacterium, it was isolated and identified with microscopical, biochemical, physiological, tobacco hypersensibility, pathogenicity and PCR amplification of rDNA 16S tests. The immuno&#150;PCR technique was then optimised (primer annealing temperature, antibody concentration, incubation temperature and microtube branding). The study showed that it is possible to amplify the DNA of <i>P. stewartii </i>directly from maize seeds, with an annealing temperature of 62 and 65 &deg;C, incubation times of 1&#150;3 hours, antibody concentrations of 5:200 and 10:200 and Fisher and Axigen microtubes. The adaptation and optimisation of the immuno&#150;PCR technique is important as it may aid in the reduction of the risk of <i>P. stewartii </i>propagation towards areas free of bacteria. </font></p>     ]]></body>
<body><![CDATA[<p align="justify"><font face="verdana" size="2"><b>Key words: </b>ELISA, antibodies, microtube brand, Stewart's wilt.</font></p>     <p align="justify"><font face="verdana" size="2">&nbsp;</font></p>     <p align="justify"><font face="verdana" size="2"><b>INTRODUCCI&Oacute;N</b></font></p>     <p align="justify"><font face="verdana" size="2"><i>Pantoea stewartii </i>Mergaert, Verdonck y Kersters es una bacteria en forma de bacilo, Gram negativa, anaerobia facultativa e inm&oacute;vil (Schaad et <i>al. </i>2001). Esta bacteria es agente causal de la enfermedad conocida como marchitamiento bacteriano del ma&iacute;z o marchitez de Stewart, la cual afecta a este cultivo, ocasionando grandes p&eacute;rdidas econ&oacute;micas y del producto. La enfermedad se caracteriza por provocar lesiones acuosas y marchitez vascular en pl&aacute;ntulas y hojas necrosadas linealmente en plantas maduras, semejante a plantas que han sufrido ataques de insectos, da&ntilde;o por sequ&iacute;a o deficiencia nutricional (Lelliot &amp; Stead, 1987). Esta enfermedad bacteriana puede causar que la planta no alcance un desarrollo &oacute;ptimo para fines de producci&oacute;n, o en el peor de los casos, la muerte de la misma. Existe evidencia de que la bacteria est&aacute; presente en semillas de ma&iacute;z, la cual es un punto clave en la diseminaci&oacute;n de la bacteria, por lo cual muchos pa&iacute;ses, incluyendo M&eacute;xico, han implementado normas cuarentenarias permitiendo s&oacute;lo la importaci&oacute;n de ma&iacute;z certificado como libre de la bacteria (Wilson <i>et al. </i>1999). En Estados Unidos la marchitez bacteriana es considerada como una enfermedad end&eacute;mica, debido a que en este pa&iacute;s es com&uacute;n el insecto Chaetocnema pulicara, presente tambi&eacute;n en M&eacute;xico, y que act&uacute;a como vector de P. <i>stewartii </i>(Wilson et al. 1999). La bacteria penetra a la planta por medio de las heridas que deja el insecto vector al alimentarse (De Le&oacute;n 1984). Los s&iacute;ntomas se pueden confundir con los producidos por <i>Clavibacter michiganensis </i>subsp. nebraskensis (White, 1999). Debido a que P. steawartii es de importancia cuarentenaria, el an&aacute;lisis de su presencia o ausencia debe ser r&aacute;pido. Actualmente, se cuenta con m&eacute;todos m&aacute;s eficientes, de los cuales sobresalen ELISA (Enzyme Linked Immuno&#150;Sorbent Assay) y la PCR (Reacci&oacute;n en Cadena de la Polimerasa) que requieren de unas cuantas horas para obtener una respuesta, sin embargo, con estas t&eacute;cnicas se presentan algunas desventajas. En el caso de la prueba ELISA, si los t&iacute;tulos del pat&oacute;geno se ven disminuidos, la reacci&oacute;n de la enzima sobre el sustrato no genera valores que se puedan tomar como positivos. Por otra parte, la PCR a&uacute;n cuando presenta alta sensibilidad y es muy espec&iacute;fica, puede inhibir la acci&oacute;n de la enzima polimerasa debido a algunos componentes de la muestra. Esto es especialmente limitante cuando se trata de amplificar ADN proveniente de muestras con matriz compleja con alto contenido de carbohidratos, como ocurre en el caso de las semillas (Blakemore <i>et al. </i>1992). Lo anterior sugiere la falta de una t&eacute;cnica de diagn&oacute;stico que sea confiable, espec&iacute;fica, sensible, r&aacute;pida y que no presente las desventajas de ELISA y de PCR al aplicarse separadamente. El objetivo del presente trabajo fue adaptar el m&eacute;todo inmuno&#150;PCR para la detecci&oacute;n de <i>P. stewartii </i>directamente de la semilla de ma&iacute;z. Para ello se integraron los m&eacute;todos, ELISA y PCR, y se determinaron las mejores condiciones para la detecci&oacute;n de la bacteria.</font></p>     <p align="justify"><font face="verdana" size="2">&nbsp;</font></p>     <p align="justify"><font face="verdana" size="2"><b>MATERIALES Y M&Eacute;TODOS</b></font></p>     <p align="justify"><font face="verdana" size="2"><b>Material Vegetal</b></font></p>     <p align="justify"><font face="verdana" size="2">Semilla que se deseaba importar por un particular fue enviada para su an&aacute;lisis para la presencia de fitopat&oacute;genos cuarentenados al Centro Internacional de Servicios Fitosanitarios SA de CV, laboratorio aprobado por la SAGARPA (Secretaria de Agricultura, Ganader&iacute;a, Desarrollo Rural, Pesca y Alimentaci&oacute;n) para este tipo de an&aacute;lisis. La muestra de semilla de ma&iacute;z fue importada de los Estados Unidos de Am&eacute;rica de un lote previamente reportado con altas probabilidades de estar infectado con <i>Pantoea stewartii, </i>lo cual se verific&oacute; por medio de ELISA que se realiz&oacute; con un estuche comercial de Agdia para <i>P. stewartii </i>(Agdia, Elkhart, IN 46514, USA) de acuerdo al protocolo por el fabricante. Una vez confirmada la presencia de la bacteria se procedi&oacute; a su aislamiento e identificaci&oacute;n, para ello se realizaron las siguientes t&eacute;cnicas.</font></p>     <p align="justify"><font face="verdana" size="2"><b>Aislamiento de la bacteria</b></font></p>     <p align="justify"><font face="verdana" size="2">Se diluyeron 10 g de la muestra de ma&iacute;z infectada en una soluci&oacute;n fisiol&oacute;gica con un buffer salino (fosfato de potasio 0.01 M, pH 7.0; NaCl 0.8 %),despu&eacute;s se agit&oacute; por 2 horas a temperatura ambiente. A continuaci&oacute;n se diluy&oacute; la suspensi&oacute;n a concentraciones de 10<sup>&#150;1</sup> y 10<sup>&#150;10</sup>. Estas diluciones se sembraron en medios selectivos CPG (casamino&#150;acid peptone glucose) y en KB (King medium &#946; agar). Las placas fueron incubadas a 28 &deg;C por 72 h. Transcurrido este tiempo se procedi&oacute; a examinar las placas. Aquellas colonias que presentaron caracter&iacute;sticas morfol&oacute;gicas de <i>P. stewartii, </i>como son colonias peque&ntilde;as de color amarillo, lisas y brillantes se transfirieron a placas con medio de cultivo KB. Adem&aacute;s en el caso del medio CPG se buscaron colonias que fueran de consistencia mucosa y extensible y con una ligera pigmentaci&oacute;n, las cuales tambi&eacute;n se transfirieron a medio KB. Las placas con las posibles colonias de <i>P. stewartii </i>se incubaron por 72 h a 28 &deg;C y se prepararon las pruebas para la identificaci&oacute;n seg&uacute;n las caracter&iacute;sticas bioqu&iacute;micas y de patogenicidad. Para corroborar la identificaci&oacute;n de la bacteria se realizaron an&aacute;lisis microsc&oacute;picos, an&aacute;lisis bioqu&iacute;micos y fisiol&oacute;gicos de las colonias as&iacute; como pruebas de hipersensibilidad en tabaco.</font></p>     ]]></body>
<body><![CDATA[<p align="justify"><font face="verdana" size="2"><b>Prueba de patogenicidad</b></font></p>     <p align="justify"><font face="verdana" size="2">Esta prueba se realiz&oacute; en plantas de ma&iacute;z de las variedades Sweet Corn, Hybrid Prim, Bandit Film Coat Yellow SH2 y Silver Queen. A los 15 d&iacute;as de emergidas las pl&aacute;ntulas se inocularon por punci&oacute;n con una suspensi&oacute;n bacteriana a una concentraci&oacute;n de 10<sup>8</sup> UFC ml<sup>&#150;1</sup>. Posteriormente, las plantas se cubrieron con bolsas de pl&aacute;stico para favorecer el desarrollo bacteriano.</font></p>     <p align="justify"><font face="verdana" size="2"><b>Extracci&oacute;n de DNA bacteriano</b></font></p>     <p align="justify"><font face="verdana" size="2">Se diluy&oacute; la cepa aislada de <i>P. stewartii </i>en 0.2 ml de buffer TE 1X (10 mM de Tris&#150;HCl pH 8.0, 1 mM de Na<sub>2</sub>EDTA), a la cual se le a&ntilde;adi&oacute; 0.2 ml de la soluci&oacute;n de lisis 1X (4% Trit&oacute;n x&#150;100, 2 % SDS, 200 mM NaCl, 20 mM Tris&#150;HCl pH 8.0) m&aacute;s 10 ml de la enzima proteinasa K (10 mg ml<sup>&#150;1</sup>). En seguida se agit&oacute; suavemente en un vortex y se incub&oacute; por 30 minutos a 55 &deg;C, una vez terminada la incubaci&oacute;n se agreg&oacute; medio volumen de la soluci&oacute;n fenol&#150;cloroformo&#150;alcohol isoam&iacute;lico (25:24:1) y se agit&oacute; en el vortex por unos segundos. Posteriormente, se centrifug&oacute; por 5 min a 10 000 r.p.m., generando dos fases en la soluci&oacute;n, se tom&oacute; la fase superior (fase acuosa) y se mezcl&oacute; con 0.2 ml de la soluci&oacute;n cloroformo&#150;alcohol isoam&iacute;lico (24:1), se agit&oacute; en el vortex y se centrifug&oacute; por 5 min a 10,000 r.p.m. Se separ&oacute; la fase acuosa y se mezcl&oacute; con 0.2 ml de acetato de amonio al 7.5 M y se incub&oacute; en hielo por 10 min, despu&eacute;s se volvi&oacute; a centrifugar por 5 min a 10,000 r.p.m. Si se observ&oacute; alg&uacute;n precipitado, se pas&oacute; la fase l&iacute;quida a un tubo nuevo y se sigui&oacute; el procedimiento, si no fue as&iacute;, se sigui&oacute; el procedimiento en el mismo tubo. Se agregaron 0.4 ml de isopropanol y se dej&oacute; incubando la mezcla en el congelador a &#150;20 &deg;C por un m&iacute;nimo de 30 min, posteriormente se centrifug&oacute; por 5 min a 10,000 r.p.m. El ADN precipitado se lav&oacute; con 1 ml de etanol helado al 70 %, esta vez se centrifug&oacute; por 10 min a 10,000 r.p.m, despu&eacute;s se decant&oacute; el etanol y se dej&oacute; evaporar hasta su totalidad. El ADN precipitado se resuspendi&oacute; en 0.2 ml de buffer TE, el ADN obtenido se conserv&oacute; en refrigeraci&oacute;n hasta el momento de ser usado. El ADN extra&iacute;do se fraccion&oacute; en un gel de agarosa al 1 % para determinar su integridad. Adem&aacute;s de las colonias bacterianas se extrajo ADN de la bacteria <i>Bacillus subtilis </i>para usarlo como control negativo.</font></p>     <p align="justify"><font face="verdana" size="2"><b>Reacci&oacute;n en cadena de la polimerasa (PCR)</b></font></p>     <p align="justify"><font face="verdana" size="2">El volumen de reacci&oacute;n para una muestra fue de 25 <i>&#956;</i>l; 14.5 <i>&#956;</i>l de agua desionizada est&eacute;ril, buffer 1X, 2mM MgCl<sub>2</sub>, 200 <i>&#956;</i>M dNTPs y 2.0 <i>&#956;</i>L de cada iniciador. Los iniciadores utilizados fueron ESF 5' CCT TGA CGG GCT GAC CAC 3' y ESR 5' AGG AAT AAC GCG ACG ACC AG 3' que amplifican un segmento del gen ribosomal 16S (Blakemore <i>et al., </i>1999). Todo se mezcl&oacute; y se agregaron 0.5 <i>&#956;</i>l de la enzima Taq Polimerasa (5U<i>&#956;</i>l). Se depositaron 23 <i>&#956;</i>l del coctel en un tubo de 0.6 ml, se le adicion&oacute; 0.2 <i>&#956;</i>l de ADN de la muestra y se mezcl&oacute; suavemente. La muestra ya preparada se coloc&oacute; en el termociclador, el cual se program&oacute; con las condiciones para la reacci&oacute;n: un ciclo de 94 &deg;C por 4 min, 35 ciclos de unminuto a 94 &deg;C, 1 min de 62 &deg;C y 1 min de 72 &deg;C y por ultimo un ciclo de 72 &deg;C por cinco min. La amplificaci&oacute;n del fragmento de ADNse visualiz&oacute; por medio de una electroforesis en gel de agarosa al 1 %.</font></p>     <p align="justify"><font face="verdana" size="2"><b>T&eacute;cnica de inmuno&#150;PCR</b></font></p>     <p align="justify"><font face="verdana" size="2">La t&eacute;cnica inmuno&#150;PCR se compone de dos partes. La primera es la inmunol&oacute;gica, que consta de la fijaci&oacute;n de los anticuerpos (sensibilizaci&oacute;n) espec&iacute;ficos a <i>P. stewartii </i>seg&uacute;n el protocolo del m&eacute;todo ELISA, el cual se desarrolla de la siguiente manera: Primero se diluyeron los anticuerpos en un buffer alcalino de carbonatos en una relaci&oacute;n de 1:200, anticuerpo: buffer, tomando en cuenta que se usar&iacute;an 0.1 ml de la diluci&oacute;n por cada tubo. Se prepararon los microtubos, previamente esterilizados a 15 lb de presi&oacute;n a 120 &deg;C por 15 min, se usaron microtubos de polipropileno de las marcas Fisher y Axigen de capacidad de 0.6 ml. Los tubos se incubaron en c&aacute;mara h&uacute;meda a una temperatura de 4 &deg;C, esperando un m&iacute;nimo de 12 h antes de usarlos. A continuaci&oacute;n los tubos se lavaron repetidamente con un buffer de fosfatos PBST. Este &uacute;ltimo se verti&oacute; de manera que llevase cierta presi&oacute;n, para lo cual se us&oacute; una pizeta y se colocaron los tubos en forma invertida, permitiendo as&iacute; que la soluci&oacute;n cayera y arrastrara los anticuerpos no fijados al tubo; los tubos fueron secados en su totalidad golpete&aacute;ndolos en un papel sobre una base firme. Posteriormente, se prepar&oacute; la muestra de semilla molida de ma&iacute;z, diluy&eacute;ndola en el buffer de extracci&oacute;n en una relaci&oacute;n 1:10, muestra: buffer. Se tom&oacute; 0.1 ml de esta diluci&oacute;n por cada tubo, se coloc&oacute; en los tubos y se dejaron incubando a una temperatura de 4 &deg;C por 12 h m&iacute;nimo. Pasado este tiempo, los tubos se lavaron de la misma manera que los tubos sensibilizados.</font></p>     <p align="justify"><font face="verdana" size="2">Para la segunda parte, se procedi&oacute; a preparar el c&oacute;ctel como se indic&oacute; en la metodolog&iacute;a para PCR, s&oacute;lo que esta vez se omiti&oacute; el ADN, ya que este se encontraba en los tubos sensibilizados. Adem&aacute;s se realiz&oacute; una PCR de ADN de <i>P. stewartii </i>anteriormente extra&iacute;do como control positivo y del ADN de <i>B. subtillis </i>utilizada como control negativo. La separaci&oacute;n y visualizaci&oacute;n de los fragmentos amplificados se realiz&oacute; como se describi&oacute; previamente.</font></p>     <p align="justify"><font face="verdana" size="2"><b>Optimizaci&oacute;n de la t&eacute;cnica de inmuno&#150;PCR</b></font></p>     ]]></body>
<body><![CDATA[<p align="justify"><font face="verdana" size="2"><i>a) Selecci&oacute;n de la temperatura de alineamiento de iniciadores. </i>Para la optimizaci&oacute;n de la t&eacute;cnica de inmuno&#150;PCR se probaron las temperaturas de alineamiento de 62, 65 y 68 &deg;C. Las temperaturas usadas fueron escogidas bas&aacute;ndose en la temperatura fusi&oacute;n (Tm) de los iniciadores. La inmuno&#150;PCR se realiz&oacute; por duplicado de muestra de ma&iacute;z infectada y de la bacteria pura, adem&aacute;s de realizar a la par una PCR de DNA de las bacterias puras <i>P. stewartii </i>y <i>B. subtillis. b) Influencia de la marca de tubo a usar. </i>Se probaron microtubos de las marcas Axigen y Fisher de polipropileno, en los cuales se corri&oacute; la t&eacute;cnica de inmuno&#150;PCR ya descrita, en esta prueba se volvieron a variar los tiempos de incubaci&oacute;n para la fijaci&oacute;n de la bacteria, usando tres tiempos de incubaci&oacute;n (1, 2 y 3 h) y la temperatura de alineamiento de iniciadores previamente seleccionada. <i>c) Influencia de la concentraci&oacute;n del anticuerpo. </i>Para el estudio de la concentraci&oacute;n del anticuerpo en la t&eacute;cnica de inmuno&#150;PCR, se utilizaron los anticuerpos en una relaci&oacute;n de 5:200 y 10:200, al realizar la diluci&oacute;n en el buffer de cobertura. Este experimento se realiz&oacute; a la par de la variaci&oacute;n de la temperatura de alineamiento de iniciadores. <i>d) Selecci&oacute;n del tiempo de incubaci&oacute;n de la muestra para la fijaci&oacute;n de la bacteria. </i>Con la finalidad de reducir los tiempos en la t&eacute;cnica de inmuno&#150;PCR,se plante&oacute; un experimento en el cual se variaron los tiempos de incubaci&oacute;n para la fijaci&oacute;n de la bacteria al anticuerpo. Se tomaron tubos previamente sensibilizados de la marca Fisher, se probaron cuatro tiempos de incubaci&oacute;n, (3, 6, 9, 12 h) y como muestra se uso semilla infectada. Transcurrido el tiempo de incubaci&oacute;n de los cuatro tubos se continu&oacute; la t&eacute;cnica de inmuno&#150;PCR, usando la temperatura de alineamiento ya seleccionada. Como control positivo se us&oacute; DNA extra&iacute;do de un cultivo puro de <i>P. stewartii, </i>el cual se proces&oacute; con el protocolo de la PCR, descrito anteriormente.</font></p>     <p align="justify"><font face="verdana" size="2">&nbsp;</font></p>     <p align="justify"><font face="verdana" size="2"><b>RESULTADOS </b></font></p>     <p align="justify"><font face="verdana" size="2"><b>ELISA</b></font></p>     <p align="justify"><font face="verdana" size="2">La prueba de ELISA evidenci&oacute; que en ocho de las 12 muestras analizadas se presentaron valores mayores o iguales a 0.100 de densidad &oacute;ptica tanto en el primer an&aacute;lisis como en su repetici&oacute;n. Para considerar aceptables los resultados de una placa ELISA, la media de las lecturas de densidad &oacute;ptica del testigo deben ser menor a = 0.06 y del testigo positivo diluido aproximadamente de 0.20. La reacci&oacute;n se consider&oacute; positiva (presencia de <i>P. stewartii) </i>si la lectura de densidad &oacute;ptica fue mayor o igual a tres veces la media del testigo negativo. Como el testigo negativo mostr&oacute; en promedio valores de densidad &oacute;ptica menores a 0.03, s&oacute;lo se consideraron positivas aquellas muestras con densidades &oacute;pticas mayores a 0.1.</font></p>     <p align="justify"><font face="verdana" size="2"><b>Identificaci&oacute;n de la bacteria</b></font></p>     <p align="justify"><font face="verdana" size="2">Al realizar la observaci&oacute;n del frotis con el objetivo de inmersi&oacute;n (100X) se lograron observar c&eacute;lulas en forma de bacilos de una coloraci&oacute;n rojiza que indica la presencia de bacilos Gram negativos. Estas bacterias fueron inoculadas en los medios con diferentes fuentes de carbono (rafinosa, sucrosa, manitol y sorbitol) y dieron positivo a la producci&oacute;n de &aacute;cido, demostrado por el cambio de color, comparados con el control que mantuvo el color original; dichos resultados corresponden a los reportados para <i>Pantoea stewartii </i>(Schaad <i>et al. </i>1999). En las pruebas de oxidaci&oacute;n/fermentaci&oacute;n, la bacteria present&oacute; un crecimiento facultativo, tal como lo indican los reportes para <i>P. stewartii, </i>es decir, que la bacteria es capaz de crecer tanto en presencia como en ausencia de ox&iacute;geno. Por &uacute;ltimo, la prueba confirmativa de hipersensibilidad del tabaco dio positivo, ya que la planta inoculada colaps&oacute; en un periodo de 12 h, con presencia de necrosamiento alrededor de la zona inoculada.</font></p>     <p align="justify"><font face="verdana" size="2"><b>Patogenicidad de P. <i>stewartii </i>en pl&aacute;ntulas de ma&iacute;z</b></font></p>     <p align="justify"><font face="verdana" size="2"><i>a) Variedad Sweet Corn Hybrid Prim. </i>A los cinco d&iacute;as despu&eacute;s de la inoculaci&oacute;n la planta empez&oacute; a presentar manchas caf&eacute;s claro cercanas al sitio de inoculaci&oacute;n, en forma de l&iacute;neas delgadas, que pod&iacute;an apreciarse por ambos lados de la hoja con un tama&ntilde;o aproximado de 1&#150;4 mm de largo por 1 mm de ancho. Transcurrida una semana la planta presentaba decoloraci&oacute;n en casi todas las hojas, las cuales se encontraban secas con un color caf&eacute; (<a href="#f1">Figura 1</a>), de igual manera el tallo se mostraba con manchas del mismo color. <i>b) Variedad Bandit Film Coat YellowSH2. </i>A los cinco d&iacute;as aparecieron manchas de apariencia h&uacute;meda color caf&eacute; claro de aproximadamente 2 mm de largo por 1 mm de ancho, no fue sino hasta una semana despu&eacute;s de la inoculaci&oacute;n que se present&oacute; un encafecimiento casi total, en el tallo y en las hojas las cuales ten&iacute;an las puntas secas, adem&aacute;s de perder rigidez en el tallo principalmente en la zona pr&oacute;xima a la tierra y presentar un exudado en la parte media del tallo. <i>c) Variedad Silver Queen. </i>A los cinco d&iacute;as de la inoculaci&oacute;n las hojas presentaron manchas de color amarillo p&aacute;lido de aproximadamente 2 mm de di&aacute;metro, lineales de contorno irregular que se extend&iacute;an linealmente a lo largo de la hoja, por el lado del env&eacute;s hasta que se juntan las lesiones. A la semana de la inoculaci&oacute;n, las hojas presentaban casi una invasi&oacute;n total y las infecciones m&aacute;s viejas se tornaban color caf&eacute;. Tambi&eacute;n perdi&oacute; rigidez el tallo y se torn&oacute; de color caf&eacute;. As&iacute; mismo, se apreci&oacute; un aumento en el n&uacute;mero de manchas lineales de color amarillo p&aacute;lido que con el paso del tiempo causaron que las c&eacute;lulas de la hoja murieran, dando lugar a hojas de aspecto seco y quebradizo. Las plantas inoculadas de las tres variedades presentaron s&iacute;ntomas caracter&iacute;sticos de la enfermedad de Stewart despu&eacute;s de ser inoculadas con la bacteria.</font></p>     <p align="center"><font face="verdana" size="2"><a name="f1"></a></font></p>     ]]></body>
<body><![CDATA[<p align="center"><font face="verdana" size="2"><img src="/img/revistas/uc/v25n3/a6f1.jpg"></font></p>     <p align="justify"><font face="verdana" size="2"><b>Reacci&oacute;n en cadena de la polimerasa (PCR)</b></font></p>     <p align="justify"><font face="verdana" size="2">Con los iniciadores seleccionados se logr&oacute; la amplificaci&oacute;n de un segmento de ADN de 400 pb (<a href="#f2">Figura 2</a>) del ADN extra&iacute;do de la bacteria identificada como <i>P. stewartii, </i>logrando con esto corroborar la identificaci&oacute;n de la bacteria. Las amplificaciones de segmentos del ADN bacteriano se emplearon como controles positivos en todas las reacciones de PCR y de inmuno&#150;PCR.</font></p>     <p align="center"><font face="verdana" size="2"><a name="f2"></a></font></p>     <p align="center"><font face="verdana" size="2"><img src="/img/revistas/uc/v25n3/a6f2.jpg"></font></p>     <p align="justify"><font face="verdana" size="2"><b>Optimizaci&oacute;n de la t&eacute;cnica de inmuno&#150;PCR</b></font></p>     <p align="justify"><font face="verdana" size="2"><i>a) Selecci&oacute;n de la temperatura de alineamiento de los iniciadores. </i>Para la elecci&oacute;n de las tres temperaturas a analizar, se consider&oacute; temperatura de alineamiento que se determina te&oacute;ricamente; de las tres temperaturas seleccionadas s&oacute;lo con dos (62 &deg;C y 65 &deg;C) se obtuvieron segmentos de aproximadamente 400 pb (<a href="#f2">Figuras 2</a> y <a href="#f3">3</a>), con la tercera temperatura no se logr&oacute; amplificar ninguna muestra de la t&eacute;cnica inmuno&#150;PCR, pero s&iacute; la de PCR, lo cual puede deberse a la concentraci&oacute;n de ADN presente en la muestra (<a href="#f4">Figura 4</a>). <i>b) Selecci&oacute;n del tiempo de incubaci&oacute;n de la muestra para la fijaci&oacute;n de la bacteria. </i>En un primer estudio para determinar el tiempo adecuado de incubaci&oacute;n que debe permanecer la muestra en contacto con el anticuerpo, se apreci&oacute; que despu&eacute;s de la amplificaci&oacute;n de ADN por PCR se logr&oacute; amplificar las muestras con los cuatro tiempos de incubaci&oacute;n. En un segundo estudio se lograron amplificar muestras con tiempos de incubaci&oacute;n de tres, dos y una h (<a href="#f5">Figura 5</a>). <i>c) Influencia de la marca de los tubos usados. </i>La marca de los tubos usados como soporte en la t&eacute;cnica de inmuno&#150;PCR no fue un factor importante para la fijaci&oacute;n de la bacteria, as&iacute; como para la amplificaci&oacute;n por PCR de los fragmentos, dado que despu&eacute;s de la electroforesis de los fragmentos amplificados por PCR se apreciaron bandas de aproximadamente 400 pb en todos los tubos sin importar la marca (Fisher y Axigen) (<a href="#f5">Figura 5</a>). <i>d) Influencia de la concentraci&oacute;n del anticuerpo para la fijaci&oacute;n de la bacteria. </i>Los resultados obtenidos de la inmuno&#150;PCR realizada con diferentes concentraciones del anticuerpo (5:200 y 10:200) para la fijaci&oacute;n de la bacteria fueron los mismos (<a href="#f3">Figura 3</a>), por lo cual se deduce que la concentraci&oacute;n del anticuerpo no influye en los resultados de la inmuno&#150;PCR.</font></p>     <p align="center"><font face="verdana" size="2"><a name="f3"></a></font></p>     <p align="center"><font face="verdana" size="2"><img src="/img/revistas/uc/v25n3/a6f3.jpg"></font></p>     <p align="center"><font face="verdana" size="2"><a name="f4"></a></font></p>     ]]></body>
<body><![CDATA[<p align="center"><font face="verdana" size="2"><img src="/img/revistas/uc/v25n3/a6f4.jpg"></font></p>     <p align="center"><font face="verdana" size="2"><a name="f5"></a></font></p>     <p align="center"><font face="verdana" size="2"><img src="/img/revistas/uc/v25n3/a6f5.jpg"></font></p>     <p align="justify"><font face="verdana" size="2">&nbsp;</font></p>     <p align="justify"><font face="verdana" size="2"><b>DISCUSI&Oacute;N</b></font></p>     <p align="justify"><font face="verdana" size="2">Si bien, hasta hoy los m&eacute;todos de mayor eficacia para la detecci&oacute;n de P. <i>stewartii </i>son los inmunoensayos (ELISA) o las t&eacute;cnicas moleculares como la PCR &oacute; la LCR (ligase chain reaction), estas t&eacute;cnicas tambi&eacute;n tienen sus desventajas. Con la t&eacute;cnica de inmuno&#150;PCR se logr&oacute; eliminar las desventajas de las t&eacute;cnicas ELISA y PCR que la componen, ya que se amplific&oacute; un segmento de ADN de P. <i>stewartii </i>de aproximadamente 400 pb directamente de la semilla de ma&iacute;z infectada as&iacute; como de la bacteria pura lo cual coincidi&oacute; con la amplificaci&oacute;n del ADN de la bacteria usada como control positivo. No se amplifico por PCR ninguna banda del ADN de la bacteria utilizada como control negativo, lo que nos indica la eficiencia de esta t&eacute;cnica y de los iniciadores utilizados, adem&aacute;s de corroborar las pruebas de especificidad realizadas por Blakemore <i>et al </i>1999, quienes dise&ntilde;aron los iniciadores utilizados en esta investigaci&oacute;n.</font></p>     <p align="justify"><font face="verdana" size="2">La optimizaci&oacute;n de las condiciones en que se realiza la inmuno&#150;PCR (temperatura de alineamiento, tiempo de incubaci&oacute;n, diluci&oacute;n del anticuerpo y efecto de la marca de los tubos), ha ayudado a mejorar la calidad de los resultados obtenidos, en comparaci&oacute;n con los conseguidos al usar las condiciones que especifica la teor&iacute;a. Dicha mejora incluye aspectos como: el aumentar la calidad de las bandas del segmento de 400 pb, disminuir el tiempo de incubaci&oacute;n de la muestra hasta una hora, reduciend o de esta forma el tiempo de la prueba, as&iacute; como descartar la necesidad del uso de productos o materiales de cierta marca o cantidades innecesarias de reactivos, lo que puede ayudar a reducir los costos de la prueba. En la determinaci&oacute;n de la temperatura de alineamiento fue necesario variar la concentraci&oacute;n del anticuerpo usado para la fijaci&oacute;n de la bacteria al tubo, debido a que no era posible realizar la amplificaci&oacute;n y de esta manera descartar el anticuerpo como origen del problema, lo que al parecer estaba afectando debido a la antig&uuml;edad de los anticuerpos, dicha concentraci&oacute;n se tuvo que cambiar de una relaci&oacute;n de 1:200 a 5:200.</font></p>     <p align="justify"><font face="verdana" size="2">A&uacute;n quedan otros factores por analizar,uno es el efecto de la composici&oacute;n qu&iacute;mica de los microtubos usados como soporte, as&iacute; como los niveles de detecci&oacute;n de la t&eacute;cnica, dichos factores no han sido evaluados en la investigaci&oacute;n debido a que seg&uacute;n los datos reportados para PCR es de 10 bacterias presentes en la reacci&oacute;n (Blakemore <i>et al. </i>1999), para tal caso se puede pensar que la t&eacute;cnica de inmuno&#150;PCR presenta una sensibilidad similar o mayor. Otros m&eacute;todos, como la PCR&#150;LCR, tambi&eacute;n tienen potencial como m&eacute;todos de detecci&oacute;n, debido a su gran capacidad de distinci&oacute;n a nivel de especies, bas&aacute;ndose en la diferencia de un solo par de bases (Wilson <i>et al. </i>1994). Otra opci&oacute;n es la variante de la PCR que usa m&eacute;todos inmunomagn&eacute;ticos para la separaci&oacute;n de la bacteria (Walcott &amp; Gitaitis, 2000). Po otro lado, el m&eacute;todo com&uacute;n para la visualizaci&oacute;n de los productos de PCR, es la electroforesis, la cual puede en ocasiones ser insensible cuando dichos productos se encuentran en valores bajos seg&uacute;n lo descrito por Pislak <i>et al. </i>2002. Dicho inconveniente podr&iacute;a ser solucionado implementando un m&eacute;todo fluorim&eacute;trico como el Taqman (Schaad <i>et al. </i>1999).</font></p>     <p align="justify"><font face="verdana" size="2">&nbsp;</font></p>     <p align="justify"><font face="verdana" size="2"><b>LITERATURA CITADA</b></font></p>     ]]></body>
<body><![CDATA[<!-- ref --><p align="justify"><font face="verdana" size="2">Blakemore EJA, Reeves JC, Ball FL (1992) Polymerase chain reaction used in the development of a DNA probe to identify <i>Erwinia stewartii, </i>a bacterial pathogen of maize. Seed Science and Technology, 20:331&#150;335.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=10109486&pid=S0186-2979200900030000600001&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></font></p>     <!-- ref --><p align="justify"><font face="verdana" size="2">Blakemore EJA, Law LR. Reeves JC (1999) PCR identification of <i>Erwinia stewartii </i>and its comparison with two other methods. Seed Science and Technology, 27(1): 385&#150;396.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=10109488&pid=S0186-2979200900030000600002&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></font></p>     <!-- ref --><p align="justify"><font face="verdana" size="2">De Le&oacute;n C(1984) Enfermedades del ma&iacute;z. CIMMYT. M&eacute;xico D. F. 90&#150;91 pp.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=10109490&pid=S0186-2979200900030000600003&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></font></p>     <!-- ref --><p align="justify"><font face="verdana" size="2">Lelliott, RA, Stead DE (1987) Methods for the diagnosis of bacterial diseases of plants. Ed. Blackwell Scientific Publications. 113&#150;114 pp.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=10109492&pid=S0186-2979200900030000600004&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></font></p>     <!-- ref --><p align="justify"><font face="verdana" size="2">Pislak, M, Ocepek M, Zabavnik&#150;Piano J, Pogacnik M (2002) PCR&#150;ELISA as method for improving the diagnostic of paratuberculosis. 7&deg; International colloquium on paratuberculosis: Bilbao, Espa&ntilde;a: 11&#150;14 pp.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=10109494&pid=S0186-2979200900030000600005&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></font></p>     ]]></body>
<body><![CDATA[<!-- ref --><p align="justify"><font face="verdana" size="2">Schaad NW, Berthier&#150;Schaad Y, Sechler A, Knorr D (1999) Detection of Clavibacter michiganensis subsp. sepedonicus in potato tubers by BIO&#150;PCR and an automated real&#150;time fluorescence detection system. Plant Disease, 83(12): 1095&#150;1100.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=10109496&pid=S0186-2979200900030000600006&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --> </font></p>     <!-- ref --><p align="justify"><font face="verdana" size="2">Schaad NW, Jones JB, Chun W (2001) Plant pathogenic bacteria.1a. Ed. APS USA, 73&#150;83 pp.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=10109498&pid=S0186-2979200900030000600007&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></font></p>     <!-- ref --><p align="justify"><font face="verdana" size="2">Walcott RR, Gitaitis RD (2000) Detection of <i>Acidovorax avenae subsp. citrulli </i>in watermelon seed using immunomagnetic separation and the polymerase chain reaction. Plant Disease, 84(4): 470&#150;474</font>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=10109500&pid=S0186-2979200900030000600008&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --><!-- ref --><p align="justify"><font face="verdana" size="2">White DG(1999) Compendium of corn diseases. Third edition. APS Press 4&#150;5 pp.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=10109501&pid=S0186-2979200900030000600009&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></font></p>     <!-- ref --><p align="justify"><font face="verdana" size="2">Wilson WJ, Wiedmann M, Dillard R Batt CA (1994) Identification of <i>Erwinia stewartii </i>by a ligase chain reaction assay. Applied and Enviromental Microbiology, 60(1): 278&#150;284.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=10109503&pid=S0186-2979200900030000600010&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></font></p>     <!-- ref --><p align="justify"><font face="verdana" size="2">Wilson W J, Dillard H R Beer SV (1999) Assessment of phenotypic variability in <i>Erwinia stewartii </i>based on metabolic profiles. Plant Disease, 83(2): 114&#150;118.    &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;[&#160;<a href="javascript:void(0);" onclick="javascript: window.open('/scielo.php?script=sci_nlinks&ref=10109505&pid=S0186-2979200900030000600011&lng=','','width=640,height=500,resizable=yes,scrollbars=1,menubar=yes,');">Links</a>&#160;]<!-- end-ref --></font></p>      ]]></body><back>
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