Estudio del rendimiento de la técnica DPD utilizando estrategias en arquitecturas paralelas

E. Escalanteª , C. Echeverria^ª,b, P. Guillén^c, S. Rojas^c y P.J. Colmenares^,d

ª Postgrado de Física Fundamental, Facultad de Ciencias, Universidad de Los Andes, Mérida, Venezuela,

^b Universidad Nacional Experimental del Táchira, San Cristobal, Venezuela,

^c Centro Nacional de Cálculo Científico, Universidad de los Andes,

^d Departamento de Química, Facultad de Ciencias, Universidad de Los Andes, e–mail: colmenar@ula.ve.

Recibido el 24 de noviembre de 2003
Aceptado el 12 de octubre de 2004

Resumen

Hemos estudiado la implementación de un código paralelo que simula la dinámica de un fluido mediante la técnica denominada Dinámica Disipativa de Partículas. Específicamente calculamos la función de distribución radial que describe la probabilidad de encontrar un par de partículas separadas una distancia r. Analizamos la eficiencia del código paralelizado en una computadora de cuatro procesadores con memoria compartida, comparando los resultados con aquellos provenientes de Coveney y Novik [1].

Descriptores: Simulation; dissipative particle dynamics;, stochastic processes.

Abstract

We have studied the implementation of a parallel code that simulates the dynamics of a complex fluid in the framework of the dissipative particle dynamics technique (DPD). In particular, we calculate the radial distribution function that describes the likelihood of finding two particles separated a distance r in the fluid. We look for the efficiency of the paralelized code in a shared memory machine with four processors by taking as a reference the results from Coveney and Novik [1] in order to assess the effectiveness of our code.

PACS: 02.50.Ey; 82.20.Wt; 83.10.Pp; 83.10.Rs

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Agradecimientos

Los autores agradecen al FONACIT por el financiamiento a través de la subvención S1–2001000910.

Referencias

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