Se considera como un rasgo esencial de las ciencias médicas, el planteamiento de preguntas específicas a la naturaleza por medio de experimentos, El interés actual no es tanto el de determinar el principio fundamental subyacente que vincula a los diferentes fenómenos, cuanto las regularidades en los detalles¹. Así, los dominios de la biología se abordan a partir no de leyes generales, sino de propósitos particulares, o sea de las respuestas que ofrece la naturaleza a preguntas específicas. Este hecho se refleja en el desmembramiento actual de disciplinas madres en un sin número de subespecialidades hijas. Además, se ha impuesto el concepto de que los datos obtenidos en un experimento, sobre los cuales fincamos nuestras edificaciones científicas, nunca tienen un valor absoluto². Tal aserto, en la epistemología de hoy, ha sido afianzado por Karl Popper³, y por quienes se han inspirado en él. De hecho, la auténtica epistemología, en palabras de Heidegger⁴, corresponde a un círculo establecido entre el saber y la ciencia. En su espíritu, el saber no es la ciencia en el sentido moderno, sino la memoria del Ser o de la verdad. A su vez, el pensamiento es el poema de la verdad del Ser en el diálogo histórico de quienes piensan.

Los datos experimentales no son hechos puros, sino interpretados en el seno de un contexto hermenéutico. Por lo tanto, la experimentación no exime de pensar para que sea científicamente significativa⁵. Al analizar y describir un fenómeno, no se puede eliminar por completo la influencia del sistema experimental y de los métodos de registro. Se sabe que es frecuente la interacción del procedimiento de análisis y la manifestación del fenómeno. Resulta fundamental, pues, la importancia de la metodología en la interrogación que se dirige a la naturaleza. Ya había aseverado Kant⁶, que el método es lo primordial en el camino de la ciencia. En la época nuestra, Heidegger ha añadido otra valiosa reflexión⁷: "Todo el poder de la ciencia reside en el método. Cualquier tema halla su propio lugar en la metodología" ¿Qué entendemos por metodología? Esto ya se preguntaba antes de Platón⁸. Hablaba Parménides de odós (vía), pero no de método. Y más tarde, para Descartes, el método es el mismo pensamiento in se conversum. Baruch Spinoza lo consideró como cognitio reflexiva: conocimiento reflejado en sí mismo. Los fundamentos de la ciencia moderna consisten, al parecer, en un retorno en sí de la idea del método⁹.

"Ir a las cosas mismas" es una nueva formulación del antiguo principio de la autonomía de la razón, gracias al cual se establecieron la filosofía y la ciencia¹⁰. La técnica dominante en la investigación biológica moderna estriba en el concepto de que el ser vivo constituye un todo. En biología, lo real es el todo, de manera análoga a la que se sigue en física, donde se considera a lo real como la totalidad. En el campo de las ciencias biológicas, no puede decirse qué es un fenómeno sin antes haberlo colocado dentro de una relación: existencia de una capacidad (de ver, oir, etc.), e intentado de conocer el porqué de cuanto se observa. No es útil para la ciencia reducir a conceptos aislados la unidad misteriosa de lo real, captado por nosotros en la triple distinción de totalidad, todo y unidad. Según el Estagirita, lo real, que nos pone en conexión con todo el ente, es el noũs (intelecto).

No debe olvidarse que el quehacer científico lleva al conocimiento no del Ser, sino de un campo determinado del ente: "toda ciencia es particular" (Hamburger)¹¹. Podríamos decir que la ciencia vuelve a ser hoy lo que fueron inicialmente las ciencias para Platón y Aristóteles: filosofías especiales. Tales fueron también para Descartes, Leibniz y Newton, para quienes las cuestiones científicas apuntaban hacia principia philosophica. Para Kant esse est concipi, i.e. ser consiste en ser concebido: se trata del ser de las ciencias. Solo el idealismo alemán poskantiano rompió el círculo entre la filosofía y las ciencias.

Pero el efecto fundamental es la significación de la ciencia para el hombre. El sentido de la historia universal de la ciencia anima cuestiones ligadas esencialmente al problema del hombre y de su destino¹². Por eso no debe perderse de vista el aserto de Aristóteles: "La filosofía está dirigida a lo que es y a lo que corresponde al Ser por sí mismo" (Metafísica. Libro gama. 1:1003-1021).