Resumo

MENDOZA-AVILES, Ismael; MUNOZ-ROJAS, Carla A; ROJAS, Mario  e  ESTRADA, Norma. Amplificación isotérmica mediada por bucle para diagnosticar patógenos marinos en tejidos de Crassostrea spp. y camarón blanco, Litopenaeus vannamei, cultivados en México. Cienc. mar [online]. 2021, vol.47, n.4, pp.227-239.  Epub 09-Dez-2022. ISSN 0185-3880.  https://doi.org/10.7773/cm.v47i4.3095.

La amplificación isotérmica mediada por bucle (LAMP, por sus siglas en inglés) es un método preciso, sensible, rápido y fácil de realizar para la amplificación de genes en condiciones isotérmicas, y ha servido como una herramienta de diagnóstico poderosa. En este estudio, desarrollamos un protocolo de diagnóstico con LAMP para la detección de Vibrio parahaemolyticus y el virus de la mancha blanca en camarón blanco (Litopenaeus vannamei) y de Perkinsus spp. en Crassostrea spp. en México. Estos patógenos están asociados a distintas enfermedades y se consideran una amenaza en la industria de la acuicultura. Se obtuvieron ostiones y camarones infectados y no infectados de granjas acuícolas en la costa noroeste de México para estandarizar la técnica de LAMP. Determinamos los genes candidatos a través de un primer análisis de muchos conjuntos de cebadores, y luego elegimos un conjunto de cebadores que amplificaron exitosamente con muestras mexicanas. Optimizamos las reacciones de LAMP para cada patógeno con los cebadores seleccionados usando gradientes de temperatura de 61 a 65 ºC, concentraciones de ADN de 2.5 pg a 250.0 ng y tiempos de reacción de 10 a 60 min. Este estudio estableció un procedimiento diagnóstico para la detección de patógenos de ostiones y camarones de México. El diagnóstico y el tratamiento temprano de patógenos pueden reducir enormemente la transmisión de enfermedades en granjas acuícolas.

Palavras-chave : Crassostrea spp.; Litopenaeus vannamei; amplificación isotérmica mediada por bucle; acuicultura; patógenos.

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