SciELO - Scientific Electronic Library Online

 
vol.51 número4Synthesis and Absolute Configuration of (20R)-20-Acetyl-23,24-bisnorcholanic Lactones Prepared from (E)-(20S,25R)- and (E)-(20S,25S)-20,23-Diacetylfurost-22-enesThe Antibacterial Metabolites and Proacacipetalin from Acacia cochliacantha índice de autoresíndice de materiabúsqueda de artículos
Home Pagelista alfabética de revistas  

Servicios Personalizados

Revista

Articulo

Indicadores

Links relacionados

Compartir


Journal of the Mexican Chemical Society

versión impresa ISSN 1870-249X

J. Mex. Chem. Soc vol.51 no.4 Ciudad de México oct./dic. 2007

 

Article

 

The Electronic Influence on the Active Site-Directed Inhibition of Acetylcholinesterase by N-aryl-Substituted Succinimides

 

J. Alberto Guevara-Salazar,1 Michel Espinoza-Fonseca,2 Hiram I. Beltrán,3 José Correa-Basurto,1 Delia Quintana Zavala4 and José G. Trujillo-Ferrara1*

 

1 Sección de Graduados y Departamento de Bioquímica, Escuela Superior de Medicina, Instituto Politécnico Nacional. Apartado Postal 46-161, Mexico City 11340, México. jtrujillo@ipn.mx

2 Department of Biochemistry, Molecular Biology and Biophysics, University of Minnesota, Minneapolis, MN 55455

3 Departamento de Ciencias Naturales D.C.N.I., Universidad Autónoma Metropolitana - Cuajimalpa. Av. Pedro A. de los Santos 84, Col. San Miguel Chapultepec, 11850, D.F., México.

4 Laboratorio de Química Orgánica, Centro de Investigación en Ciencia Aplicada y Tecnología Avanzada. Instituto Politécnico Nacional. Unidad Legaría, Legaría No. 694, Col. Irrigación, Mexico 11500, D. F.

 

Recibido el 8 de junio de 2007
Aceptado el 7 de diciembre de 2007

 

Abstract

A computational docking approach, in combination with the Hammett relationship, has been employed to evaluate the electronic influence of substituents on ligand binding and the active site-directed inhibitory potency on acetylcholinesterase using nine N-aryl-substituted succinimides. Our results indicate that electron-withdrawing groups attached to benzene moiety of the compounds favor the inhibitory potency while electron-donating groups do not. This fact was confirmed by performing kinetic experiments on acetylcholinesterase from Electrophorus electricus; the experiments showed that para-substituted-NO2 compound inhibits better than para-substituted-OMe and -H derivatives. This approach may be useful for the rationalization of drugs design, as well as the mechanism of the active site.

Key words: Acetylcholinesterase, Hammett Relationship, Docking, N-aryl-substituted-succinimides.

 

Resumen

La aproximación por docking, en combinación con la relación de Hammett han sido empleadas conjuntamente para evaluar la influencia electrónica de sustituyentes sobre la unión del ligante y la potencia inhibitoria de la enzima acetilcolinesterasa de 9 N-aril-succinimidas sustituidas. Nuestros resultados indican que grupos electro-atractores favorecen su potencia inhibitoria, mientras que los electro-donadores no lo hacen. Este hecho fue confirmado experimentalmente sobre AChE de Electrophorus electricus; donde el grupo p-NO2 la inhibe de manera más potente que aquellos derivados con grupos p-OMe y -H. Esta aproximación podría ser utilizada para racionalizar tanto el diseño de fármacos, así como el mejor entendimiento del mecanismo de unión sobre el sitio activo.

Palabras Clave: Acetilcolinesterasa, relación de Hammett, Docking, N-aril-Succcinimidas sustituidas.

 

DESCARGAR ARTÍCULO EN FORMATO PDF

 

Acknowledgments

This work was supported from CONACYT, COFAA-IPN and SIP-IPN. HIB thanks for support grants provided by "Acuerdos 11/07 y 13/07 del Rector General de la UAM: Programa de Fomento al Desarrollo de Grupos Académicos en Formación y Programa de Apoyo a la Investigación Multidisciplinaria".

 

References

1. Quinn, D. M. Chem. Rev. 1987, 87, 955-979.         [ Links ]

2. Giacobini, E. Martin Dunitz Ltd., London, 2000.

3. Quinn, D. M.; Feaster, S. H.; Nair, H. K.; Baker, N. A.; Radiæ, Z.; Taylor, P. J. Am. Chem. Soc. 2000, 122, 2975-2980.         [ Links ]

4. Hammett, L. P. J. Am. Chem. Soc. 1937, 59, 96-103.         [ Links ]

5. Trujillo-Ferrara, J.; Vázquez, I.; Espinosa, J.; Santillán, R.; Farfán, N.; Hopfl, H. Eur. J. Pharm. Sci. 2003, 18, 313-322.         [ Links ]

6. Trujillo-Ferrara, J.; Montoya-Cano, L.; Espinoza-Fonseca, M. Bioorg. Med. Chem. Lett. 2003, 19, 1825-1827.         [ Links ]

7. Correa-Basurto, J.; Flores-Sandoval, C.; Marín-Cruz, J.; Rojo-Domínguez, A.; Espinoza-Fonseca, L.M.; Trujillo-Ferrara, J.G. Eur. J. Med. Chem. 2007, 42, 10-19.         [ Links ]

8. Correa-Basurto, J.; Vázquez-Alcántara, I.; Espinoza-Fonseca, L.M.; Trujillo-Ferrara, J. Eur. J. Med. Chem. 2005, 40, 732-735.         [ Links ]

9. Throuhout the manuscript, the amino acid numbering is referred to that of human AChE.

10. Morris, G. M.; Goodsell, D. S.; Halliday, R. S.; Huey, R.; Hart, W. E.; Belew, R. K.; Olson, A. J. J. Comput. Chem. 1998, 19, 1639-1662.         [ Links ]

11. Cornell, W. D.; Cieplak, P.; Bayly, C.I.; Gould, I.R.; Merz, K.M.; Ferguson, D. M.; Spellmeyer, D.C.; Fox, T.; Caldwell, J. W.; Kollman, P. A. J. Am. Chem. Soc. 1995, 117, 5179-5197.         [ Links ]

12. Kalé, L.; Skeel, R.; Bhandarkar, M.; Brunner, R.; Gursoy, A.; Krawetz, N.; Philips, J.; Shinozaki, A.; Varadarajan, K.; Schulten, K. J. Comput. Phys. 1999, 151, 283.         [ Links ]

13. Besler, B. H.; Merz, K. M.; Kollman, P. A. J. Comput. Chem. 1990, 11, 431-439.         [ Links ]

14. Becke, A. D. J. Chem. Phys. 1993, 98, 5648-5652.         [ Links ]

15. Frisch, M. J.; Trucks, G. W.; Schlegel, H. B.; Scuseria, G. E.; Robb, M. A.; Cheeseman, J. R.; Zakrzewski, V. G.; Montgomery Jr. , J. A.; Stratmann, R. E.; Burant, J. C.; Dapprich, S.; Millam, J. M.; Daniels, A. D.; Kudin, K. N.; Strain, M. C.; Farkas, O.; Tomasi, J.; Barone, V.; Cossi, M.; Cammi, R.; Mennucci, B.; Pomelli, C.; Adamo, C.; Clifford, S.; Ochterski, J.; Petersson, G. A.; Ayala, P. Y.; Cui, Q.; Morokuma, K. D.; Malick, K.; Rabuck, A. D.; Raghavachari, K.; Foresman, J. B.; Cioslowski, J.; Ortiz, J.V.; Baboul, A. G.; Stefanov, B. B.; Liu, G.; Liashenko, A.; Piskorz, P.; Komaromi, I.; Gomperts, R.; Martin, R. L.; Fox, D. J.; Keith, T.; Al-Laham, M. A.; Peng, C Y.; Nanayakkara, A.; González, C.; Challacombe, M. P.; Gill, M. W.; Johnson, B.; Chen, W.; Wong, M. W.; Andrés, J. L.; Head-Gordon, M.; Replogle, E. S.; Pople, J. A. Gaussian 98, Revision A.7, Gaussian, Inc., Pittsburgh PA, 1998.         [ Links ]

16. Gervasio, F. L.; Chelli, R.; Procacci, P.; Schettino, V. Proteins 2002, 48, 117-125.         [ Links ]

17. Gervasio, F. L.; Chelli, R.; Marchi, M.; Procacci, P.; Schettino, V. J. Phys.Chem. B 2001, 105, 7835-7846.         [ Links ]

18. Mehler, E.L.; Solmajer, T. Protein Eng. 1991, 4, 903.         [ Links ] Chem. B. 2001, 105, 7835-7846.         [ Links ]

19. Hunter, C.A. Chem. Soc. Rev. 1994, 23, 101-109.         [ Links ]

20. Gervasio, F. L.; Procacci, P.; Cardini, G.; Guarna, A.; Giolitti, A.; Schettino, V. J. Phys. Chem. B. 2000, 104, 1108-1114.         [ Links ]

21. Cockroft, S.L.; Hunter, C.A.; Lawson, K.R.; Perkins, J.; Urch, C.J. J. Am. Chem. Soc. 2005, 127, 8594-8595.         [ Links ]

22. Lin, J.H.; Perryman, A.L.; Schames, J.R.; McCammon, J.A. J. Am. Chem. Soc. 2002, 124, 5632-5633.         [ Links ]

23. Lin, J.H.; Perryman, A.L.; Schames, J.R.; McCammon, J.A. Biopolymers 2003, 68, 47-62.         [ Links ]

24. J. E. Leffler, E. Grunwald, Rates and Equilibria of Organic Reactions, John Wiley, New York, 1963.         [ Links ]

25. Bonting Sjoerd L. and Featherstone Robert M.; Arch. Biochem. Biophys. 1956, 61, 89-98.         [ Links ]

26. Masayuki, E.; Yasuto, T.; Fukichiro, O. J. Pharm. Experim. Ther.1997, 282; 3, 1480-1486.         [ Links ]

27. Sagane Y.; Nakagawa T.; Yamamoto K.; Michikawa S.; Oguri S.;  Momonoki Y.S. Plant Physiology, 2005, 138, 1359-1371.         [ Links ]

Creative Commons License Todo el contenido de esta revista, excepto dónde está identificado, está bajo una Licencia Creative Commons