Resumen

PAREDES, O.; ROMO-VAZQUEZ, R.; VELEZ-PEREZ, H.  y  MORALES, J. A.. Análisis estadístico de los espectros de frecuencia de las regiones reguladoras del ENCODE. Rev. mex. ing. bioméd [online]. 2017, vol.38, n.3, pp.637-645. ISSN 2395-9126.  https://doi.org/10.17488/rmib.38.3.10.

En la actualidad, nuevas bases de datos genómicos (secuencias de ADN) son puestas al alcance del dominio público para su análisis. La bioinformática ha desarrollado algoritmos para extraer información y características de dichas secuencias. Sin embargo, estos algoritmos bioinformáticos tienen limitaciones. Una alternativa es utilizar herramientas propias del procesamiento digital de señales (DSP) adaptadas a secuencias genómicas (procesamiento de señales genómicas - GSP). El presente trabajo versa sobre el análisis de los cuatro primeros momentos centrales (media, desviación estándar, asimetría y curtosis) y dos momentos estadísticos (mediana y varianza) de los espectros frecuenciales de las 15 Regiones Reguladoras (RRs) de la base de datos ENCODE con el objetivo de estudiar diferencias estadísticas y frecuencias características. La base de datos seleccionada es “mapeada”. Luego, la FFT es calculada a estas señales genómicas y finalmente los momentos estadísticos son implementados. Los resultados mues tran la existencia de 3 grupos de RRs utilizando la media, mediana y curtosis. La desviación estándar y la varianza, parecen no resaltar información importante. Finalmente, la asimetría revela un comportamiento homogéneo ante la presencia de valores atípicos en algunas RRs. Estas observaciones permiten inferir que la periodicidad dentro de la secuencia está relacionada o podría determinar la función biológica que desempeña la misma secuencia.

Palabras llave : Procesamiento de señales genómicas; ENCODE; Espectro de frecuencia; Momentos Estadísticos; Transformada de Fourier.

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