Scielo RSS <![CDATA[Ciencias marinas]]> http://www.scielo.org.mx/rss.php?pid=0185-388020160004&lang=es vol. 42 num. 4 lang. es <![CDATA[SciELO Logo]]> http://www.scielo.org.mx/img/en/fbpelogp.gif http://www.scielo.org.mx <![CDATA[Rastreabilidad del pedigrí en camarón blanco ( <em>Litopenaeus vannamei</em> ) mediante marcadores genéticos: Una comparación entre microsatélites y SNP]]> http://www.scielo.org.mx/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0185-38802016000400227&lng=es&nrm=iso&tlng=es Abstract: To increase productivity, genetic improvement in cultivated shrimp is of much interest. Evaluation of genetic parameters (e.g., heritability, genotype-environment interaction, inbreeding) and the design of appropriate breeding plans are necessary steps towards genetic improvement. Pedigree traceability by genetic markers is relevant to these objectives. The aim of this study was to compare the performance of 2 genetic marker panels (microsatellites and single nucleotide polymorphisms [SNPs]) for pedigree traceability of a cultivated stock of whiteleg shrimp (Litopenaeus vannamei). Pedigree of a stock from 81 full-sib families reared in a common environment was assessed with microsatellites and SNPs as genetic markers. The panel of 76 SNPs performed better than microsatellites, allowing 94-96% of parentage assignment of the tested progeny (n = 192). A minimum number of 50 SNPs with a proportion of 60% loci with a minimum allele frequency of 0.3 is suitable for successful pedigree assignment. SNP markers are suggested for confidently testing the pedigree of shrimp from known parental broodstock.<hr/>Resumen: El mejoramiento genético en el camarón cultivado es de amplio interés para incrementar la productividad. La evaluación de parámetros genéticos (e.g., heredabilidad, interacción entre genotipo y ambiente, endogamia) y el diseño de planes de apareamiento son elementos necesarios para el mejoramiento genético. La rastreabilidad del pedigrí con marcadores genéticos es importante para estos objetivos. El objetivo de este trabajo fue comparar el desempeño de 2 paneles de marcadores genéticos (microsatélites y polimorfismos de nucleótido sencillo [SNP]) para rastrear el pedigrí en una población de camarón blanco (Litopenaeus vannamei) de cultivo. Se determinó el pedigrí de la progenie de 81 familias de hermanos completos mediante el uso de microsatélites y SNP como marcadores genéticos. Un panel de 76 SNP probó tener un mejor desempeño que los microsatélites para la asignación de parentesco, obteniéndose un 94-96% de asignación en una muestra de la progenie (n = 192). Un número mínimo de 50 SNP con una proporción de 60% de loci con una frecuencia alélica mínima de 0.3 es adecuado para una asignación exitosa de pedigrí. Se sugiere utilizar los marcadores SNP para determinar el parentesco de la progenie de camarón proveniente de padres conocidos. <![CDATA[Caracterización espacial de las pesquerías en el Sistema de Cañones de Avilés (mar Cantábrico, España)]]> http://www.scielo.org.mx/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0185-38802016000400237&lng=es&nrm=iso&tlng=es Abstract: Marine protected areas are one of the main tools in ecosystem-based fishery management. This approach requires analyzing the role of fisheries in the ecosystem by, for example, identifying fishing tactics and analyzing the spatial distribution with sufficient precision to allow us to determine whether fishing activities and the habitat or ecosystem to be protected can coexist spatially. In the Avilés Canyon System (Cantabrian Sea, Spain), we detected 6 different gears and 17 fishing tactics were identified by a non-hierarchical classification technique (CLARA). The spatial distribution of demersal fishing activity is strongly affected by the topography of the study area and the large presence of rocky ground. There is a clear spatial segregation between gear types, mainly due to the operating requirements of the gears and the distribution of target species. This minimizes conflicts between different components of the fleet. The fishing tactics targeting pelagic species were mainly located on the coast and shelf, while those targeting demersal species were used on the shelf and slope. Longline fishing tactics are those that had a more restricted spatial distribution.<hr/>Resumen: Las áreas marinas protegidas son una de las principales herramientas en la gestión pesquera basada en el ecosistema. Este enfoque requiere evaluar el papel de las pesquerías en el ecosistema mediante, por ejemplo, la identificación de tácticas pesqueras y el análisis de su distribución espacial, y esto permitirá identificar la coexistencia espacial de las actividades pesqueras y los hábitats o ecosistemas objeto de protección. En el Sistema de Cañones de Avilés (mar Cantábrico, España), hemos identificado el uso de 6 artes de pesca y 17 tácticas pesqueras, éstas últimas con una técnica de clasificación no jerárquica (CLARA). La distribución espacial de las actividades pesqueras demersales está fuertemente afectada por la topografía del área de estudio y la gran presencia de sustrato rocoso. Hay una clara segregación espacial entre tipos de artes de pesca, principalmente debido a los requerimientos operativos de las artes de pesca y la distribución de las especies objetivo. Esto minimiza los conflictos entre los distintos componentes de flota. Las tácticas pesqueras dirigidas a especies pelágicas se localizaron principalmente en la zona litoral y en la plataforma continental, mientras que aquellas dirigidas a especies demersales se distribuyeron por la plataforma continental y en el talud continental. Las tácticas pesqueras de palangre de fondo son las que tuvieron una distribución espacial más restringida. <![CDATA[Abundancia relativa del manatí antillano en la Reserva de la Biosfera Pantanos de Centla en la planicie costera de Tabasco, México]]> http://www.scielo.org.mx/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0185-38802016000400261&lng=es&nrm=iso&tlng=es Abstract: Abundance estimates for the Antillean manatee, Trichechus manatus manatus, in the southern Gulf of Mexico are based on interviews, mortality reports, and opportunistic sightings. The lack of quantitative data is explained by the complexity of hard-to-access fluvial-lake systems, low water transparency, and the elusive behavior of manatees. Side-scan sonar is a promissory tool to detect and count manatees in fluvial systems. The Pantanos de Centla Biosphere Reserve (PCBR), in the coastal plain of Tabasco (Mexico), could play a key role in the regional conservation of manatees, but it is under constant pressure, especially from the oil and gas industry, and it is important to generate quantitative data for this area. The objective of this study was to quantify the relative abundance of manatees at 4 selected sites within PCBR and at 2 reference sites outside the reserve using side-scan sonar, as a basis for the long-term monitoring of the species and to determine the importance of the reserve for regional manatee conservation. We conducted 5 to 7 boat surveys on 10-km line transects along selected water courses and recorded 63 manatee sightings. Manatees occurred at all sampling sites and abundance increased upriver. The site with the highest mean abundance (5.17 ± 1.9 manatees/10 km) was located at the southeastern end of PCBR. There was statistical difference among sites. The southeastern portion of Tabasco is a key region for manatee conservation and management in Mexico. PCBR is a key regional feature but it is necessary to define protection strategies within and beyond its southern limits.<hr/>Resumen: Los registros de abundancia del manatí antillano, Trichechus manatus manatus, en el golfo de México provienen en su mayoría de entrevistas, casos de mortalidad y avistamientos oportunistas. La falta de datos cuantitativos se explica por la complejidad y el difícil acceso a los sistemas fluviolagunares, la baja transparencia del agua y la conducta evasiva de los manatíes. El sonar de barrido lateral es una herramienta promisoria para detectar y contar manatíes en ambientes fluviales. La Reserva de la Biosfera Pantanos de Centla (RBPC), en la planicie costera de Tabasco (México), puede representar un mecanismo importante de conservación regional del manatí. La RBPC está en constante presión de desarrollo, especialmente por parte de la industria de los hidrocarburos, lo que resalta la importancia de generar datos cuantitativos y comparativos. El objetivo de este trabajo fue cuantificar la abundancia relativa de manatíes en 4 sitios seleccionados dentro de la RBPC y en 2 sitios de referencia fuera de la reserva utilizando un sonar de barrido lateral, como base para el monitoreo a largo plazo de la especie y para evaluar la importancia de la RBPC como un mecanismo de conservación regional del manatí. Se realizaron de 5 a 7 recorridos en lancha a lo largo de 10 km lineales en cursos de agua selectos, y se registraron 63 avistamientos de manatíes. Los manatíes estuvieron presentes en todos los sitios y la abundancia se incrementó río arriba. El sitio con mayor abundancia promedio (5.17 ± 1.9 manatíes/10 km) se localizó en el límite sureste de la RBPC. La porción sureste de Tabasco es una región clave para la conservación y manejo del manatí en México. La RBPC es clave en esta región, pero es necesario definir estrategias de protección dentro y fuera de su límite sureste. <![CDATA[Análisis de la capacidad antioxidante y compuestos bioactivos en extractos macroalgales y liquénicos mediante la aplicación de diferentes solventes y métodos de evaluación]]> http://www.scielo.org.mx/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0185-38802016000400271&lng=es&nrm=iso&tlng=es Abstract: Natural extracts of macroalgae are widely recognized for their antioxidant properties. In this work, the antioxidant capacity of various aqueous and hydroalcoholic extracts obtained from red and green marine algae and from one marine lichen collected from different sites in southern Spain (intertidal and estuarine waters) was evaluated by different methods: ABTS free radical scavenging assay, DPPH assay, and P-carotene bleaching method (BBM). Contents of total lipids, total carbohydrates, and UV photoprotectors with antioxidant capacity, such as mycosporine-like amino acids and phenolic compounds, were determined. Among the extraction solvents, the highest extraction yield was observed in H2O and 20% MeOH (v/v). The highest antioxidant activity was found in the extracts of the red macroalgae Hydropuntia cornea, Gracilariopsis longissima, Halopithys incurva, and Porphyra umbilicalis, whereas the lowest activity was detected in the green macroalga Ulva rotundata. In general, the antioxidant activity was higher using DPPH than BBM and ABTS. Even so, the ABTS assay is an easy and quick test that provides a comprehensive view of the entire extract in both the lipophilic medium and hydrophilic medium. The antioxidant activity was related to the composition of bioactive compounds and synergistic action is not discarded. The biotechnological use of macroalgal extracts with high antioxidant capacity is discussed.<hr/>Resumen: Los extractos naturales de las macroalgas son ampliamente reconocidos por sus propiedades antioxidantes. En este trabajo la capacidad antioxidante de diversos extractos acuosos e hidroalcohólicos obtenidos de algas marinas (rojas y verdes) y de un liquen marino, recolectados en diferentes puntos del sur de España (aguas intermareales y estuarinas), fue evaluada mediante diferentes métodos: método ABTS, ensayo DPPH y método de decoloración del β-caroteno (BBM). Se determinó el contenido de lípidos totales, carbohidratos totales y fotoprotectores de radiación UV con capacidad antioxidante como los aminoácidos de tipo micosporina y compuestos fenólicos. Entre los solventes de extracción, el mayor rendimiento de extracción se observó en los solventes H2O y MeOH 20% (v/v). La mayor actividad antioxidante se encontró en los extractos de las macroalgas rojas Hydropuntia cornea, Gracilariopsis longissima, Halopithys incurva y Porphyra umbilicalis, mientras que la actividad más baja se detectó en los de la macroalga verde Ulva rotundata. En general, la actividad antioxidante fue mayor usando el ensayo DPPH que el método ABTS y el BBM. Aun así, se propone el método ABTS como una prueba sencilla y rápida que proporciona una visión completa del extracto en su conjunto, ya que mediante esta metodología se evalúan los componentes que se encuentran tanto en el medio lipofílico como el medio hidrofílico. La actividad antioxidante se relacionó con la composición de compuestos bioactivos sin descartar la acción sinérgica entre sus compuestos. Se discute el uso biotecnológico de los extractos de macroalgas con alta capacidad antioxidante. <![CDATA[Alimentación suspensívora oportunista del gasterópodo intermareal <em>Olivella columellaris</em> y sus implicaciones en la regulación de las migraciones mareales]]> http://www.scielo.org.mx/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0185-38802016000400289&lng=es&nrm=iso&tlng=es Abstract: The gastropod Olivella columellaris inhabits sandy beaches of the Tropical East Pacific. These snails perform tidal migrations for continuous suspension feeding in the moving backwash zone, possibly controlled by an endogenous circatidal clock. However, O. columellaris readily modifies its circatidal behavior, for example when flow channels develop below natural and artificial tide pools at ebb tide. Suspension feeding continues in such channels while water is running, delaying tidal migration. Such behavioral plasticity questions the significance of endogenous rhythms for the regulation of tidal migrations in O. columellaris.<hr/>Resumen: El gasterópodo Olivella columellaris habita las playas arenosas del Pacífico Oriental Tropical. Estos caracoles suelen realizar migraciones mareales ya que se alimentan de partículas en suspensión en la zona de resaca que se mueve con la marea. Aunque este comportamiento posiblemente esté regulado por un reloj endógeno que sigue los ritmos mareales, O. columellaris fácilmente puede modificarlo. Por ejemplo, cuando se crean pequeños canales que drenan el agua de las pozas (naturales o artificiales) generadas en marea baja, la alimentación suspensívora continúa mientras el agua esté corriendo, retrasándose así la migración mareal. Dicha plasticidad en el comportamiento cuestiona la importancia de los ritmos endógenos en la regulación de las migraciones mareales de O. columellaris.