Scielo RSS http://www.scielo.org.mx/rss.php?pid=0185-330920100001&lang=en vol. 28 num. 1 lang. en http://www.scielo.org.mx/img/en/fbpelogp.gif http://www.scielo.org.mx http://www.scielo.org.mx/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0185-33092010000100001&lng=en&nrm=iso&tlng=en La identificación de bacterias fitopatógenas es de alta relavancia. En este trabajo se evaluó la identificación de especies fitopatógenas dentro del género Pseudomonas mediante análisis de esteres metílicos de ácidos grasos (FAME). A partir de una base de datos de FAME, se han generado conjuntos de conjuntos de datos de alta calidad. Dos aspectos fueron investigados: la separación de especies fitopatógenas de Pseudomonas, y la diferenciación del grupo de espcies fitopatógenas de Pseudomonas de las no fitopatógenas. En la primera fase se realizó un análisis de componentes principales para evaluar la variabilidad de los datos. Posteriormente el método de aprendizaje árboles aleatorios fue evaluado para propósitos de identificación. El método inteligente permite aprender de la variabilidad y los patrones de los datos y mejorar la identificación de especies. El análisis de componente principal de especies fitopatógenas mostró claramente sobreposición de grupos de datos. Se desarrolló un modelo de árboles aleatorios que permitió alcanzar una eficiencia de identificación de especies del 71.1%. Discriminar el grupo de especies fitopatógenas del grupo de especies no fitopatógenas fue más sencillo, dado el desempeño de los bosques al azar del 85.9%. Por otra parte se demostró que existe una relación estadística entre los perfiles de ácidos grasos y la patogénesis sobre la planta.<hr/>The identification of plant-pathogenic bacteria is often of high importance. In this paper, we evaluate the identification of plant-pathogenic species within the genus Pseudomonas by fatty acid methyl ester (FAME) analysis. Starting from a FAME database, high quality data sets were generated. Two research questions were investigated: can plant-pathogenic Pseudomonas species be discriminated from each other and can the group of plant-pathogenic Pseudomonas species be distinguished from the group of non-plant-pathogenic Pseudomonas species. In a first stage, a principal component analysis was performed to evaluate the variability within the data. Secondly, the machine learning method Random Forests was evaluated for identification purposes. This intelligent method allows to learn from the variability and patterns in the data and to improve the species identification. The principal component analysis of plant-pathogenic species clearly showed overlapping data clouds. A Random Forests model was developed that achieved a species identification performance of 71.1%. Discriminating the group of plant-pathogenic plant-pathogenic species from the group of non-plant-pathogenic species was more straightforward, given by the Random Forests identification performance of 85.9%. Moreover, it was shown that a statistical relation exists between the fatty acid profiles and plant pathogenesis. http://www.scielo.org.mx/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0185-33092010000100002&lng=en&nrm=iso&tlng=en Se comparó el efecto de seis productos biocompatibles sobre el desarrollo de Sphaerotheca fuliginea en plantas de pepino cv. Borja en dos épocas de cultivo. Se trataron semanalmente las plantas con aspersiones o soluciones de aceites de girasol, oliva y neem, bicarbonato de potasio, silicato de potasio y fosfato monobásico de potasio, comparándose contra azoxystrobin. Los tratamientos más efectivos en reducir la severidad de daño de cenicilla en el follaje de pepino fueron los que contenían las dosis altas de silicato de potasio, bicarbonato de potasio, aceite de oliva, fosfato de potasio y aceite de neem, con un grado de control similar al azoxystrobin. El bicarbonato de potasio, silicato de potasio y los aceites vegetales presentaron fitotoxicidad. El grado de control de la cenicilla por productos fue menor en la etapa de cultivo donde se presentaron temperaturas más altas.<hr/>The effect of biocompatible products on the growth of cucumber powdery mildew (Sphaerotheca fuliginea) was evaluated. Plants were treated with dispersions or solutions of sunflower, olive and neem oils and potassium bicarbonate, potassium silicate and monopotassium phosphate, and compared with azoxystrobim. The most effective treatments for reducing the severity of powdery mildew damage in the cucumber foliage were those that contained the higher doses of potassium silicate, potassium bicarbonate, olive oil, monopotassium phosphate and neem oil showed a disease severity similar to azoxystrobin. Potassium bicarbonate, potassium silicate and oils were phytotoxic. Disease control was worse on climatic conditions with higher temperatures. http://www.scielo.org.mx/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0185-33092010000100003&lng=en&nrm=iso&tlng=en Durante los meses de julio-octubre del 2005 y 2006, se observaron manchas necróticas circulares, café oscuras en floretes de brócoli en Guanajuato, México. Se colectaron floretes de brócoli con síntomas y del tejido sintomático se aislaron Alternaria tenuissima, A. alternata y Fusarium oxysporum, los cuales fueron identificados morfológica y molecularmente. Las pruebas de patogenicidad mostraron que los tres hongos son agentes causales de la pudrición o manchado del florete de brócoli. Los primeros síntomas se observaron a las 48 h después de la inoculación A. tenuissima y A. alternata presentaron manchas necróticas de 1mm en los botones florales y F. oxysporum presentó crecimiento superficial. A las 96 h las manchas necróticas causadas por A. tenuissima y A. alternata eran de 3 cm de diámetro con una textura aguanosa, la necrosis avanzo rápidamente hasta llegar a los tallos próximos a los botones florales y en el caso de A. alternata penetró tallos de 2 y 3 cm de diámetro. Fusarium oxysporum a las 96 h causó una pudrición gris seca de 3 cm de diámetro en botones y pedicelos con abundante micelio blanquecino el cual se extendió rápidamente, la pudrición incluyó a los tallos próximos a los botones florales.<hr/>During the months of July-October of 2005 and 2006, circular necrotic spots, dark coffee were observed in florets of broccoli in Guanajuato, Mexico. Florets of broccoli with symptoms were collected and of the symptomatic tissue were isolated Alternaria tenuissima, A. alternata and Fusarium oxysporum, which were identified morphologically and molecularly. The pathogenicity tests showed that the three fungi are causal agents of the rotting of floret in broccoli. The first symptoms were observed to 48 h after inoculation, A. tenuissima and A. alternata presented necrotic spots of 1mm in the floral bellboys and y F. oxysporum presented superficial growth. To 96 h the necrotic spots caused by A. alternata y A. tenuissima were of 3 cm of diameter with a sodden texture, the necrosis advanced quickly until to arrive at the stems next to the floral bellboys and in the case of A. alternata penetrated stems of 2 and 3 cm of diameter. F. oxysporum to 96 h caused to a gray rotting of 3 cm of diameter in bellboys and pedicels with abundant white mycelium which extended quickly, rotting included the stems next to the floral bellboys. http://www.scielo.org.mx/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0185-33092010000100004&lng=en&nrm=iso&tlng=en Una enfermedad del maíz de etiología desconocida apareció epidémicamente en el estado de Veracruz, México durante 2003-2004. Las plantas enfermas se caracterizaron por muerte prematura de plantas, producción múltiple de jilotes estériles, pudrición vascular, hojas con manchas blancas, amarillamiento, enrojecimiento y franjeado foliar y necrosis. El fitoplasma Maize bushy stunt (MBS) se detectó por PCR asociado a plantas con amarillamiento, enrojecimiento foliar y proliferación de jilotes en los municipios de Tlalixcoyan, Cosoleacaque y Paso de Ovejas en 2006 y 2007. La incidencia, severidad y rendimiento se evaluaron en diez genotipos de maíz en una plantación experimental en Tlalixcoyan, Ver. en 2007. MBS se detectó por PCR en CP-562, 30F83, 30F92, Orca, 30F96, Nutria y Asgrow 7573, mientras que Pioneer 3086, 30F97 y CP-560 resultaron negativos. La mayor incidencia se presentó en los genotipos 30F83 (27%), AS7573 (21%) y 30F97 (21%) con una severidad de 0.29, 0.14 y 0.15, respectivamente. Los genotipos con mayor rendimiento de grano fueron AS-7573 (5.4 ton ha-1), Orca (4.7 ton ha-1) y 30F97 (4.0 ton ha-1). Hubo correlación positiva de la incidencia con la severidad de la enfermedad (r=0.69**), pero no de la enfermedad con el rendimiento.<hr/>A maize disease of unknown etiology appeared in the state of Veracruz, Mexico, during 2003-2004. Diseased plants were characterized by premature death, proliferation and poor ear growth, sterility in both male and female flowers, stalk rot, leaves with white spots, yellowing and reddening on leaf margins, leaf stripes, and necrosis. Maize Bushy Stunt (MBS) phytoplasma was PCR detected and associated with plants with yellow and red leaves and ear proliferation in Tlalixcoyan, Cosoleacaque and Paso de Ovejas counties in 2006 and 2007. Ten maize genotypes were evaluated for incidence and severity of the disease and grain yield performance in an experimental plot in Tlalixcoyan, Ver. in 2007. MBS was PCR detected in CP-562, 30F83, 30F92, Orca, 30F96, Nutria and Asgrow 7573; whereas Pioneer 3086, 30F97 y CP-560 were MBS negative. Highest incidence and severity was detected in 30F83 (27 %, 0.29), AS-7573 (21 %, 0.14) and 30F97 (21 %, 0.15). Best grain yield was produced by AS-7573 (5.4 ton ha-1), Orca (4.7 ton ha-1), and 30F97 (4 ton ha-1). Positive correlation was obtained between incidence and severity of the disease (r=0.69**), incidence and number of symptomatic ears (r=0.43**) and severity with decrease in weight of healthy grain (r=0.51**). There was no correlation between disease and yield. http://www.scielo.org.mx/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0185-33092010000100005&lng=en&nrm=iso&tlng=en Los recubrimientos son matrices continuas formuladas a base de lípidos, proteínas o carbohidratos o mezclas de estos componentes, que les confieren diferentes propiedades fisicoquímicas. Un carbohidrato utilizado para la formulación de los recubrimientos comestibles es el quitosano, el cual reduce el crecimiento de hongos y bacterias. Los recubrimientos pueden servir como vehículos para un amplio rango de aditivos, incluyendo compuestos antimicrobianos, con la finalidad de proporcionarles mayores atributos como es el control de microorganismos. Entre los aditivos naturales están los aceites esenciales. Se tiene amplia evidencia que los aceites esenciales extraídos de diferentes plantas presentan inhibición contra hongos y bacterias. Al formular recubrimientos comestibles con quitosano y adicionar a las formulaciones productos como los aceites esenciales, se evita el desarrollo de microorganismos, se prolonga la vida de anaquel de los productos agrícolas, y se mantienen las propiedades sensoriales de éstos. En este artículo se llevó a cabo una revisión de literatura sobre el tema de recubrimientos comestibles y sus principales componentes sobre la fisiología del producto. Asimismo, se revisó literatura con respecto al efecto de la elaboración de recubrimientos con quitosano y la incorporación de aceites esenciales sobre su actividad en diferentes microorganismos patógenos.<hr/>Coatings and films are continuous matrixes typically formulated of lipids, proteins and carbohydrates or their combination. A carbohydrate used to formulate edible coatings is the chitosan that reduces the growth of fungi and bacteria. Coatings may work as vehicles of a broad range of food additives including antimicrobial compounds in order to provide higher attributes such as the control of microorganism. Essential oils are among the natural additives. There is broad evidence that essential oils extracted from different plant species present inhibition against fungi and bacteria. The incorporation of chitosan and essential oils into the edible formulations avoids the development of microorganism and extends the storage life of the horticultural commodity. In this article, a literature review about the main components of the coatings and its effect on the physiology of the commodity was carried. A revision of literature about the effect of chitosan and the addition of essential oils on the activity of pathogenic microorganisms was also carried out. http://www.scielo.org.mx/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0185-33092010000100006&lng=en&nrm=iso&tlng=en Mediante el análisis del DNA amplificado al azar, se realizó la identificación de biotipos de mosca blanca en las regiones productoras de tomate en la Península de Baja California, México. Se determinó un 75% de B. tabaci biotipo B, 12% del biotipo A, 10% de Trialeurodes vaporariorum y un 3% de especies no determinadas. Los análisis de PCR detectaron virus del enchinado del tomate de La Paz en el 95% de la población y distribuido en casi todas las zonas geográficas muestreadas.<hr/>The technique of random amplified polymorphic DNA (RAPD) analysis was used to identify whitefly biotypes present in tomato fields on the Baja California, Mexico. We determined that 75% B. tabaci biotype B, 12% biotype A, 10% Trialeurodes vaporariorum, and 3% indeterminate species. According to PCR analysis Tomato chino La Paz virus was detected in 95% of the population and the virus was present in almost all the geographical areas. http://www.scielo.org.mx/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0185-33092010000100007&lng=en&nrm=iso&tlng=en Se reportan estudios sobre la penetración y establecimiento de Nacobbus aberrans población Chapingo en los cultivares (cvs) de ñrijol Azuñrado, Canario, Flor de Mayo, Negro Ejotero, Negro Jamapa y Negro Querétaro. Para el estudio de penetración las plantas se inocularon con 2000 J2 y evaluaron para número de nematodos por raíz a 2 y 3 días después de inoculados (ddi). En el estudio de establecimiento los cultivares fueron inoculados con 4000 huevecillos y se evaluaron a 105 ddi; se encontraron diferentes valores de penetración y establecimiento de los nematodos entre cultivares con detención del desarrollo del nematodo en estadios J3 y J4 a 105 ddi. Se hace referencia a los mecanismos de resistencia postinfectivos que inhiben el desarrollo del nematodo, la existencia de variabilidad en N. aberrans para parasitar el cultivo, variación en el germoplasma de frijol para respuesta al parásito, y se considera a los cvs probados como no hospederos eficientes.<hr/>Studies have been reported concerning penetration and settlement of Nacobbus aberrans Chapingo population in Azufrado, Canario, Flor de Mayo, Negro ejotero and Negro Queretaro bean cultivars (cvs). The plants were inoculated with 2000 J2 in order to perform the penetration study, and became evaluated by nematode amount per root at 2 and 3 days after inoculation (dai). The cvs were inoculated for the settlement study with 4000 eggs, performing a further evaluation after 105 dai. Different nematode penetration and settlement values were revealed among cultivars with a nematode development detention in J3 and J4 stadiums at 105 dai. The post-infective resistance mechanisms inhibiting nematode development are referred to, as well as the variability existence in N. aberrans for crop parasitization, plus bean genoplasma variation to respond to the parasite; the tested cvs are considered as efficient non-hosts. http://www.scielo.org.mx/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0185-33092010000100008&lng=en&nrm=iso&tlng=en C. purpurea es el hongo causante de la enfermedad llamada cornezuelo del trigo y afecta el rendimiento hasta en 40 %. En la región de Nanacamilpa, Tlaxcala, se sospecha la presencia de C. purpurea; además de que por el tamaño de los esclerocios encontrados se cree que podría ser Claviceps gigantea. Algunos autores argumentan que para un diagnóstico temprano y que diferencie a los dos patógenos, el tamaño del esclerocio a temprana edad es una característica distintiva. Mediante la extracción de DNA de esclerocios y la amplificación de la región ITS (Internal Transcribed Spacer) se pudo comprobar que el tamaño no es una característica distintiva para la separación de estos dos patógenos, además se observó que C. purpurea en la región de estudio puede alcanzar un tamaño temprano de esclerocio mayor al promedio que se menciona en la literatura. Finalmente se corroboró la presencia de C. purpurea en el municipio de Nanacamilpa, Tlaxcala.<hr/>C. purpurea is the fungus causing the disease called "ergot of wheat" and can affect the yield until 40 %. In the region of Nanacamilpa, Tlaxcala, suspects the presence of C. purpurea; in addition, by the sclerotia size its believes that could be C. gigantea. Some authors argue that for an early diagnosis and differentiation of these two pathogens, the sclerotia size at an early age is a distinctive feature. By extraction of DNA and amplification of the ITS region (Internal Transcribed Spacer), was proved that size is not a distinctive feature for the separation of these two pathogens, besides was observed that the fungus in the region may reach a greater early sclerotia size than average mentioned in the literature. Finally it was confirmed the presence of C. purpurea in the town of Nanacamilpa, Tlaxcala.