Scielo RSS <![CDATA[Revista mexicana de fitopatología]]> http://www.scielo.org.mx/rss.php?pid=0185-330920160002&lang=en vol. 34 num. 2 lang. en <![CDATA[SciELO Logo]]> http://www.scielo.org.mx/img/en/fbpelogp.gif http://www.scielo.org.mx <![CDATA[Detection of <strong><em>Pineapple mealybug wilt-associated virus</em></strong> 1 and 3 in Mexico]]> http://www.scielo.org.mx/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0185-33092016000200131&lng=en&nrm=iso&tlng=en Resumen: En El Bajo Papaloapan, principal zona productora de piña, se colectaron hojas con síntomas de clorosis, flacidez, reducción del crecimiento y enrojecimiento foliar típicos de infecciones virales en este cultivo. Mediante RT-PCR con indicadores específicos para el gen hsp70 y posterior secuenciación, fueron detectados los virus Pineapple mealybug wilt associated-virus 1 (PMWaV-1) y Pineapple mealybug wilt associated-virus 3 (PMWaV-3). A partir de las secuencias obtenidas se construyó un árbol con secuencias procedentes de diferentes regiones del mundo disponibles en el GenBank para determinar su similitud. La secuencia obtenida del aislamiento mexicano del PMWaV-1 resultó ser más próxima genéticamente a secuencias de aislamientos procedentes de Cuba, Taiwán, Tailandia y Hawai y más distante del aislamiento australiano. La secuencia obtenida para el aislamiento mexicano del PMWaV-3 se encontró más relacionada con los aislamientos de Hawai, Cuba, Australia y Taiwán y más distante del aislamiento tailandés. Este es el primer reporte de la presencia de estos dos virus en México.<hr/>Abstract: In El Bajo Papaloapan, the main producing area of pineapple of Mexico, leaves with typical symptoms of viral infection consisting in chlorosis, flaccidity, reduced growth and reddening were collected. By RT-PCR with specific primers for the hsp70 gene and subsequent sequencing were detected Pineapple mealybug wilt virus associated-virus 1 (PMWaV-1) and Pineapple mealybug wilt virus associated-3 (PMWaV-3). From the sequences obtained a tree was done with sequences from different regions of the world available in GenBank in order to know their similarity. The sequence obtained from the Mexican isolate PMWaV-1 was genetically related to the sequences of isolates from Cuba, Taiwan, Thailand and Hawaii and more distant from the Australian isolate. The sequence obtained for the Mexican isolate PMWaV-3 was more related to isolates from Hawaii, Cuba, Australia and Taiwan and more distant from the Thailand isolate. This is the first report of the presence of these two viruses in Mexico. <![CDATA[Phytophthora cinnamomi Rands. pathogenicity tests in Pseudotsuga mensiezii]]> http://www.scielo.org.mx/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0185-33092016000200142&lng=en&nrm=iso&tlng=en Resumen: Phytophthora cinnamomi Rands es un microorganismo del suelo que ha causado grandes pérdidas económicas y ecológicas a nivel mundial, en una amplia gama de hospedantes. Es por esto que se identificó y evaluó la patogenicidad de cinco aislados de P. cinnamomi, procedentes de cinco regiones de México, en plantas de Pseudotsuga mensiezii. Los aislados se obtuvieron de suelo, raíz y cancros de árboles de Quercus salicifolia, de El Arrayanal, Col. (COL-A); Quercus elliptica de Tecoanapa, Gro. (GRO-P), Quercus peduncularis de Manántlan, Jal. (JAL-C), Pseudotsuga mensiezii del Edo. de México (EDO-T) y Persea americana, de Peribán Mich. (MICH-P). A través de un análisis morfológico a género y molecular a especie (No Accesión: KP773290, KP773291, KP773292, KP773293, KP773294) se corroboró la identificación de los aislados con los análisis moleculares que indican una homología de 99 % de identidad con P. cinnamomi. La patogenicidad se probó en plantas sanas de P. menziesii de tres años de edad. Para cada aislado se utilizaron cinco plantas con su respectivo testigo de cinco plantas sin inocular, las plantas se mantuvieron bajo condiciones de invernadero y las observaciones de síntomas se realizaron semanalmente durante ocho meses. Los resultados obtenidos indicaron que los cinco aislados de P. cinnamomi son capaces de infectar a las plantas de P. menziesii. El aislado COL-A, de la región del Arrayanal Col., se comportó como el más patogénico, causando la muerte en un periodo más corto de las plantas a los 120 ddi, le siguieron los aislados GRO-P a los180 ddi, JAL-C y EDO-T a los 210 ddi, y MICH-P a los 240 ddi. Para analizar los datos obtenidos en el ensayo se llevó a cabo la prueba de Kruskall-Wallis detectando diferencias estadísticas significativas de los aislados sobre el hospedante. El testigo no presentó síntoma alguno. Este es el primer reporte de P. cinnamomi aislado de Q. salicifolia, Q.elliptica, Q.peduncularis, P. mensiezii y P. americana evaluado en plantas de P. mensiezii, donde se corrobora la patogenicidad del patógeno.<hr/>Abstract: Phytophthora cinnamomi Rands is a soil microorganism that has caused large economic and environmental losses worldwide in a wide array of hosts. For this reason, P. cinnamomi was identified and its pathogenicity was evaluated in five isolations from five different regions in Mexico on Pseudotsuga mensiezii plants. The isolations were taken from the soil, roots, and cankers of Quercus salicifolia trees, from El Arrayanal, Col. (COL-A); Quercus elliptica from Tecoanapa, Gro. (GRO-P), Quercus peduncularis from Manántlan, Jal. (JAL-C), Pseudotsuga mensiezii from Edo. de México (EDO-T), and Persea americana, defrom Peribán Mich. (MICH-P). Through a morphological analysis on genus and molecular analysis on species (accession number: KP773290, KP773291, KP773292, KP773293, KP773294) the identification of the isolations was corroborated with the molecular analyses that indicate a homology of 99 % identity with P. cinnamomi. Pathogenicity was tested on healthy three year old P. menziesii plants. Five plants were used for each isolation with its respective control of five uninoculated plants; the plants were kept under greenhouse conditions and the observations of symptoms were carried out weekly for eight months. The results obtained indicated that the five P. cinnamomi plants are capable of infecting the P. menziesii plants. The isolation COL-A, from the area of Arrayanal Col. Behaved as the most pathogenic, causing the death, in the shortest period, of the plants after 120 ddi, followed by the isolations GRO-P at 180 ddi, JAL-C and EDO-T at 210 ddi, and MICH-P at 240 ddi. The data obtained in the test was analyzed with the Kruskall-Wallis test, finding significant differences of the isolations on the host. The control presented no symptoms. This is the first report on P. cinnamomi isolated from Q. salicifolia, Q.elliptica, Q.peduncularis, P. mensiezii, and P. americana evaluated in P. mensiezii plants, where the pathogenicty of the pathogen is corroborated. <![CDATA[Review of diagnosis techniques for <strong><em>Brenneria</em></strong> spp in walnut ( <strong><em>Juglans regia</em></strong> )]]> http://www.scielo.org.mx/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0185-33092016000200158&lng=en&nrm=iso&tlng=en Resumen: Brenneria nigrifluens y Brenneria rubrifaciens, causan el cancro superficial y profundo de la corteza del nogal, respectivamente. B. nigrifluen ocasiona necrosis en la corteza exterior y manchas dispersas de exudado marrón oscuro. Los síntomas de B. nigrifluens involucra hoyos en la madera, grietas profundas longitudinales en el tronco, exudado color oscuro marrón con bacterias que fluyen de las grietas de las ramas. Finalmente, las dos enfermedades pueden ocasionar pérdida de vigor y muerte de los árboles. El cancro del nogal ocasionado por especies de Brenneria se ha reportado principalmente en Estados Unidos, Francia, España, Italia, Hungría, Persia e Irán. En México no se han reportado, sin embargo, SENASICA (Servicio Nacional de Sanidad, Inocuidad y Calidad Agroalimentaria) ha establecido mapas de riesgo, ya que en México el nogal pecanero es un cultivo rentable, para el año 2014, se tuvo una producción de 125 758 ton, con un valor mayor a 6 173 millones de pesos. Debido a la patogenicidad de las bacterias, el diagnóstico oportuno es clave en el manejo de la enfermedad. Los principales métodos de diagnóstico del género Brenneria spp son: observación de signos y síntomas, pruebas bioquímicas como el sistema API, Biolog y el análisis de los ácidos grasos celulares; técnicas serológicas; técnicas moleculares como PCR punto final y tiempo real; así como técnicas cromatográficas (HPLC, CCD) para detección de metabolitos específicos como la rubrifacina. El trabajo tiene como objetivo presentar la situación a nivel nacional y mundial del cancro del nogal, así como revisión de las técnicas de diagnóstico de la enfermedad.<hr/>Abstract: Brenneria nigrifluens and B. rubrifaciens cause superficial and deep canker in walnut bark, respectively. B. nigrifluen causes necrosis in the outer bark and scattered dark brown exudate spots. The symptoms of Brenneria nigrifluens involve holes in the wood, deep longitudinal cracking in the trunk; dark brown bacterial exudate flowing through branch cracks, and eventually the two diseases can cause loss of vigor and death of the trees. Walnut canker caused by Brenneria species has been reported in USA, France, Spain, Italy, Hungary, Persia and Iran. These symptoms have not been reported in Mexico; however, SENASICA (National Service of Health, Food Safety and Food Quality) has developed risk maps to prevent Brenneria, since walnut in Mexico is a profitable crop that reached 125 758.45 tons in 2014, equivalent to more than 6 173 538 million pesos. Due to Brenneria's bacterial pathogenicity timely diagnosis is crucial to achieve good disease management. The main diagnosis methods for Brenneria genera are: Traditional techniques, biochemical test (API system, Biolog and fatty-acid cell analysis); the serological technique; molecular methods such as end-point PCR and real-time PCR; as well as chromatographic techniques (HPLC, CCD) for the detection of specific metabolites like rubrifacine. The purpose of this work is to provide an outlook of domestic and global walnut canker, as well as reviewing the diagnosis techniques for this disease. <![CDATA[Molecular identification of bacteria associated to ornamental plants obtained <strong><em>in vitro</em></strong>]]> http://www.scielo.org.mx/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0185-33092016000200173&lng=en&nrm=iso&tlng=en Resumen: En plantas ornamentales reproducidas in vitro en viveros del Centro de Desarrollo Tecnológico Tezoyuca perteneciente al FIRA, se detectaron síntomas de necrosamiento en hojas y tallo durante la fase de adaptación. El objetivo de este trabajo fue aislar e identificar los agentes asociados a éstas plantas. De tejido vegetal con síntomas de necrosamiento, se obtuvieron once aislamientos bacterianos, a los que se les extrajo el ADN con el paquete correspondiente para su secuenciación. Todos los productos de PCR se secuenciaron y se analizaron con el programa Chromas Lite®. Utilizando la búsqueda de homología por BLAST se identificaron las siguientes bacterias: Kosakonia oryzae, Pectobacterium cypripedii, Burkholderia tropica, Serratia marcescens, Pantoea dispersa, Erwinia cypripedii, Pantoea agglomerans y Erwinia rhapontici: son de importancia fitosanitaria en su fase de aclimatación in vitro.<hr/>Abstract: In ornamental plants propagated in vitro at Tezoyuca Technology Development Center, belonging to FIRA, symptoms of necrosis on leaves and stems during the adaptation stage. The objective of this study was to isolate and to identify the agents related to these plants. Eleven bacterial isolates were obtained from necrotic leaves and stems, from which ADN was extracted using a commercial PCR kit. The PCR products were sequenced and analyzed using the Chromas Lite® program. We search for homology with BLAST after which the following bacteria were identified: Kosakonia oryzae, Pectobacterium cypripedii, Burkholderia tropica, Serratia marcescens, Pantoea dispersa, Erwinia cypripedii, Pantoea agglomerans y Erwinia rhapontici. The last three bacteria are plant disease in phase of acclimation in ornamental plants get in vitro. <![CDATA[Identification and phylogenetic analysis of the leaf-galling nematode <strong><em>Orrina phyllobia</em></strong> affecting <strong><em>Solanum elaeagnifolium</em></strong> Cav. in Guanajuato, Mexico]]> http://www.scielo.org.mx/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0185-33092016000200184&lng=en&nrm=iso&tlng=en Resumen: El trompillo Solanum elaeagnifolium es una maleza de importancia económica afectada por enemigos naturales que podrían ser empleados como agentes de control biológico. Se detectó al nematodo agallador Orrina phyllobia parasitando S. elaeagnifolium en San Luis de la Paz, Guanajuato. Se realizó la identificación morfotaxonómica y molecular de especímenes extraídos de agallas y deformaciones foliares. Los valores de las características morfológicas y morfométricas concordaron con los rangos reportados en la descripción original de la especie a excepción de los índices de Man: a y b'. Los productos de la amplificación mediante la Reacción en Cadena de la Polimerasa de dos marcadores moleculares ITS1-5.8S-ITS2 y los segmentos de expansión D2-D3 del gen 28S fueron 850 y 900 pb respectivamente. La homología por BLASTING de secuencias genéticas de la población mexicana junto con secuencias de la base de datos del NCBI mostró un 99 % de identidad con Ditylenchus phyllobius (E=0.0). La inferencia bayesiana de la región ITS1-5.8S-ITS2 del ADN ribosomal con secuencias de géneros y especies de anguinidos depositados en el GenBank indicó una clara afinidad de agrupamiento con D. phyllobius. La combinación de caracteres morfométricos y genéticos permitió confirmar la identidad de Orrina phyllobia afectando S. elaeagnifolium en México.<hr/>Abstract: The silver-leaf nightshade Solanum elaeagnifolium is an economic importance weed affected by natural enemies that would be used as biological control agent. The leaf-galling nematode Orrina phyllobia was detected parasitizing S. elaeagnifolium in San Luis de la Paz, Guanajuato. Morphotaxonomic and molecular analysis was performed on specimens extracted from foliar galls and distortioned leaves. The morphometric values were in agreement with those reported by the original species description except with de Man ratios: a and b. The Polymerase Chain Reaction amplification products of two molecular markers ITS1-5.8S-ITS2 and the D2-D3 expansion segments of 28S gene were 850 and 900 bp respectively. The homology by BLASTING of the mexican population genetic sequences together with those from NCBI database showed 99% similarity with Ditylenchus phyllobius (E=0.0). The bayesian inference of the ribosomal DNA marker ITS1-5.8S-ITS2 with sequences of genus and anguinid species uploaded in GenBank displayed a clear grouping affinity with Ditylenchus phyllobius. The combination of morphometric and genetic characters allowed to confirm the identity of O. phyllobia atacking S. elaeagnifolium in Mexico. <![CDATA[Virus associated to yellowing of <strong><em>Hibiscus sabdariffa</em></strong> in Guerrero, Mexico]]> http://www.scielo.org.mx/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0185-33092016000200200&lng=en&nrm=iso&tlng=en Resumen: En la zona productora de jamaica (Hibiscus sabdariffa L.) del estado de Guerrero en el ciclo otoño-invierno 2014 se observaron cinco parcelas con una incidencia de 90 a 100 % de plantas con aclaramiento de nervaduras, mosaico y amarillamiento. Se colectaron plantas asintomáticas y con los síntomas antes descritos y se injertaron en plantas sanas de jamaica observándose clorosis de venas y mosaico 17 días después en las plantas injertadas con hojas que mostraban síntomas. Se extrajo DNA y RNA de tejido de las plantas colectadas en campo y de las injertadas que mostraron síntomas y se analizó para fitoplasmas, begomovirus, virus de la familia Potyviridae y Okra mosaic virus (OkMV). Los resultados para fitoplasmas, virus de la familia Potyviridae y Okra mosaic virus fueron negativos. Sólo se tuvo el amplicón esperado en el caso de begomovirus. Las secuencias de ocho plantas con síntomas colectadas en campo tuvieron una similitud del 95 % con Okra yellow mosaic Mexico virus (OkYMMV). Dos plantas con síntomas colectadas en campo mostraron un porcentaje de similitud menor a otros begomovirus. Los resultados obtenidos indican que el amarillamiento de la jamaica está asociado a un complejo de begomovirus en el que se encuentra presente el OkYMMV.<hr/>Abstract: In the producing area of roselle (Hibiscus sabdariffa L.) in the state of Guerrero, five plots with an incidence of 90-100 % of plants showing vein chlorosis, mosaic and yellowing were observed in the autumn-winter 2014 crop cycle. Asymptomatic and symptomatic plants were collected and grafted onto healthy plants and at 17 days after inoculation vein chlorosis and mosaic were observed in plants grafted with leaves showing symptoms. DNA and RNA were extracted from plants collected in the field and those grafted that showed symptoms and analyzed for phytoplasmas, begomoviruses, viruses of the family Potyviridae and Okra mosaic virus (OkMV). No amplification were obtained for phytoplasmas, viruses of the family Potyviridae and Okra mosaic virus in plants collected in the field and grafted that showed symptoms; only they were positive for begomoviruses. Secuences from eigth plants with symptoms collected at field and one grafted showing symptoms had a similarity of 95 % and 91 %, respectively, with Okra yellow mosaic Mexico virus (OkYMMV). Two plants with symptoms collected at field showed a lower similarity with different begomoviruses. These results indicate that yellowing of Hibiscus sabdariffa is associated with a viral complex in which OkYMMV is present.