Scielo RSS <![CDATA[Revista mexicana de fitopatología]]> http://www.scielo.org.mx/rss.php?pid=0185-330920160003&lang=en vol. 34 num. 3 lang. en <![CDATA[SciELO Logo]]> http://www.scielo.org.mx/img/en/fbpelogp.gif http://www.scielo.org.mx <![CDATA[Bacillus spp. in the Control of Wilt Caused by Fusarium spp. in Capsicum chinense]]> http://www.scielo.org.mx/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0185-33092016000300208&lng=en&nrm=iso&tlng=en Resumen. El género Fusarium es un patógeno asociado al marchitamiento del chile y con reducción del rendimiento del cultivo. Las rizobacterias son una alternativa para mejorar la producción agrícola y protección contra fitopatógenos. En el presente estudio se evaluó el antagonismo in vitro de diez cepas de Bacillus contra Fusarium equiseti ITCF1 y F. solani ITCF2, todas la cepas bacterianas inhibieron el crecimiento micelial entre 21.28 y 71.70 %, adicionalmente las cepas CBMT2 y CBMT51 presentaron halos de inhibición contra F. equiseti con halos de 3.76 y 6.37 mm. Los dos patógenos mostraron 100 % de incidencia de la enfermedad en plántulas de chile habanero y severidad de 90.0 % por F. solani y 77.5 % por F. equiseti. En pruebas de resistencia a la marchitez se utilizaron cuatro cepas de Bacillus con base en la actividad antagónica mostrada, se realizaron tres inoculaciones en la base del tallo a los 15, 28 y 35 días después de la germinación, se obtuvo que B. subtilis CBMT51 y B. cereus BL18 redujeron la severidad de la enfermedad ocasionada por F. equiseti y la cepa BL18 para F. solani, en un 47.7, 37.8 y 50.9 % respectivamente a los 28 días de la evaluación.<hr/>Abstract. The genus Fusarium is a pathogen associated with chili wilt and reduced crop yield. Rhizobacterias are an alternative to improve agricultural production and protection against plant pathogens. In this work the in vitro antagonism of ten Bacillus strains against Fusarium solani ITCF1 and F. equiseti ITCF2 were evaluated. Our results showed that all the bacterial strains inhibited mycelial growth between 21.28 and 71.70 %, additionally the CBMT2 and CBMT51 strains showed inhibition halos against F. equiseti with halos of 3.76 and 6.37 mm. The two pathogens showed 100 % incidence of disease in seedlings habanero chili and severity of 90.0 % by F. solani and 77.5 % by F. equiseti. In resistance tests wilt four strains of Bacillus based on the antagonistic activity were used, three inoculations were made in base of stem 15, 28 and 35 days after germination, we found that B. subtilis CBMT51and B. cereus BL18 reduced the severity disease caused by F. equiseti and BL18 strain for F. solani, in 47.7, 37.8 and 50.9 % respectively at 28 days of evaluation. <![CDATA[Sclerotial germination and ascospore formation of <em>Claviceps gigantea</em> Fuentes, De la Isla, Ullstrup y Rodríguez]]> http://www.scielo.org.mx/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0185-33092016000300223&lng=en&nrm=iso&tlng=en Resúmen. La enfermedad “diente de caballo” del maíz (Claviceps gigantea) afecta hasta 90 % del grano. Se estudiaron condiciones para germinación de esclerocios, formación de estructuras sexuales y se describe parte del ciclo del hongo en laboratorio y campo. Se estableció un diseño con sustrato y tiempo de incubación a 4 °C. Se evaluaron porcentaje de esclerocios germinados, tiempo de germinación y formación de cabezuelas estromáticas. En laboratorio, los esclerocios germinaron solamente en carbón residual después de 3 meses a 4 °C y 2 meses a 22-24 °C de incubación resultando en 55 % de germinación. Esclerocios germinados producen en promedio cinco cabezuelas por esclerocio 15 d después de la aparición de los primordios. En campo, los primordios aparecieron cuando los esclerocios se incubaron 3 meses a 4 °C y 64 d a temperatura promedio de 14.07 °C. En campo y laboratorio, la liberación de ascosporas se observó 23 d después de aparecer de los primordios. La aparición de cabezuelas estromáticas, su desarrollo y maduración en el mismo esclerocio no fué sincronizado. Se documentó la liberación de ascosporas largas y delgadas emergiendo de cabezuelas estromáticas. El patógeno se identificó morfológica y molecularmente como Claviceps gigantea.<hr/>Abstract. The disease known as “horse’s tooth” in maize (Claviceps gigantea) can affect grain yield up to 90 %. In this research, the time of sclerotial germination and the development of the sexual structures were studied in field and laboratory. A design was implemented with substrate and time of incubation at 4 °C as factors. Percent of germinated sclerotia, time of germination, and formation of stromatic heads were evaluated. In laboratory, sclerotia germinated only when on residual charcoal, incubated for 3 months at 4 °C followed by 2 months at 22.24 °C, resulting in 55 % germination. Sclerotia germinated produced an average of five heads per sclerotium 15 d after primordial were produced. In field conditions, the primordial appeared after the sclerotia were incubated for 3 months at 4 °C and 64 d at an average temperature of 14.07 °C. In both types of sclerotia, primordia released thin, elongated ascospores after 23 d, showing that the appearance of primordia and maturity did not occur at the same time. Ascospores release from the stromatic heads was documented. The pathogen was identified morphologically and molecularly as Claviceps gigantea. <![CDATA[Characterization of <em>Phytophthora nicotianae</em> causing vinca blight in urban areas and ornamental nurseries in Culiacan, Mexico]]> http://www.scielo.org.mx/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0185-33092016000300242&lng=en&nrm=iso&tlng=en Resumen. Los objetivos de este estudio fueron obtener y caracterizar, mediante técnicas morfológicas y moleculares, aislados de Phytophthora asociados con tizón en plantas de vinca en áreas urbanas y viveros en Culiacán, México, determinar los tipos de compatibilidad sexual y evaluar la patogenicidad de los aislados. Los aislados desarrollaron micelio cenocítico y colonias algodonosas de color blanco en agar V8; clamidosporas (20 μm) intercalares y terminales, y esporangios papilados redondos a ovales (34.16 μm y 26.35 μm). Los aislados fueron heterotálicos: 21 del tipo de compatibilidad A1 y 18 del tipo A2. Un grupo de aislados representativos mostraron patogenicidad y causaron incidencia de tizón en vinca entre 13 y 66 %. La identidad de los aislados se confirmó por análisis de secuencias nucleotídicas de las regiones ITS y de los genes nucleares factor de elongación (TEF-1α) y beta tubulina (β-Tub). Las secuencias, comparadas con la base de datos del NCBI, mostraron alto grado de identidad con P. nicotianae (ITS, 98-100 %; TEF-1α, 99-100 %; βTub, 98-100 %) y se agruparon filogenéticamente con cepas de referencia. La utilización de oligonucleótidos específicos resultó en una amplificación positiva para los aislados evaluados. Este es uno de los pocos estudios relacionado con enfermedades en plantas ornamentales en áreas urbanas en México.<hr/>Abstract. The aims of this study were to obtain and characterize, by morphological and molecular techniques, Phytophthora isolates associated with blight symptoms on vinca plants in urban areas and nurseries in Culiacan, Mexico, determine the mating types and evaluate the pathogenicity of isolates. Isolates developed white and cottony colonies with coenocytic mycelium on V8 agar; intercalary and terminal chlamydospores (20 μm) and papillate sporangia, round or oval (34.16 μm and 26.35 μm). The isolates were heterothallic: 21 isolates resulted A1 type and 18 isolates were A2 type. A group of representative isolates showed pathogenicity and caused vinca blight incidence between 13 and 66 %. The identity of the isolates was confirmed by analysis of nucleotidic sequences of the ITS region and nuclear genes as elongation factor (TEF-1α) and beta tubulin (β-Tub). The sequences, compared to the NCBI database, showed a high degree of identity with P. nicotianae (ITS, 98-100 %; TEF-1α, 99-100 %; βTub, 98-100 %) and phylogenetically clustered with reference strains. The utilization of specific primers resulted in a positive amplification for the isolates tested. This is one of the few studies on plant diseases affecting ornamental plants in urban areas in Mexico. <![CDATA[Isolation of killer yeasts from ants of the genus <em>Atta</em> and their effect on the red tomato’s fungal pathogen <em>Geotrichum candidum</em>]]> http://www.scielo.org.mx/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0185-33092016000300258&lng=en&nrm=iso&tlng=en Resumen. Una de las enfermedades que sufre el tomate es la pudrición ácida causada por Geotrichum candidum. Para lo cual se aislaron levaduras a partir de hormigas del género Atta y se seleccionaron aquellas que mostraron actividad killer frente, resultando en 8 cepas killer (M1 - M8). Posteriormente se aislaron cepas de G. candidum a partir de tomates infectados y se seleccionó la más agresiva. Cada levadura killer fue inoculada en cortes hechos a los tomates de 1x1 cm2 y después de 3 horas de incubación, la cepa seleccionada del fitopatógeno fue inoculada en un volumen de 50 µL con una concentración de 1x104 células/mL. Después de 72 h de incubación en cámara húmeda, los daños fueron cuantificados mediante la medición de las lesiones alrededor del sitio de inoculación. Los datos fueron analizados mediante la prueba de Tukey (p&lt;0.05) resultando que las levaduras M1 y M2 presentaron las mayores actividades antagonistas. La identificación por API 20C AUX arrojó que las cepas corresponden a Candida (Pichia) guilliermondii.<hr/>Abstract. One of the diseases occurring in tomato is the sour rot caused by Geotrichum candidum. In order to evaluate the antagonism of killer yeasts, isolates were obtained from ants belonging to the genus Atta and those with killer activity were selected, resulting in 8 killer isolates (M1 - M8). Then, isolates of G. candidum were obtained from infected tomatoes and the most aggressive one was selected. Each killer yeast was inoculated in 1x1 cm2 cuts made to tomato fruits and after a 3 hour incubation, 50 μL of a G. candidum suspension of 1x104 cells/mL was inoculated. After incubation for 72 h in a moist chamber, the lesions were quantified using the Tukey test (p&lt;0.05) resulting in yeast isolates M1 and M2 as the most protective ones. The auxanogram test API 20C AUX identified them as Candida (Pichia) guilliermondii. <![CDATA[Diagrammatic logarithmic scales for assess the severity of spotted leaves and calyces of roselle]]> http://www.scielo.org.mx/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0185-33092016000300270&lng=en&nrm=iso&tlng=en Abstract Spotted leaves and calyces of roselle (Hibiscus sabdariffa L.) induced by Corynespora cassiicola, is currently considered the main disease for this crop in Mexico. Given its importance, it is necessary to have a standardized method to quantify the disease severity. Therefore, the objective of this study was to develop and validate two diagrammatic logarithmic scales to quantify the severity of this disease. Naturally infected roselle leaves and calyces were collected in Guerrero state commercial plantations, and the actual severity of each of these organs was assessed. The proposed scales, designed from 2LOG program, comprised six classes in leaves: 0=0, 1=(&gt;0-2-4), 2=(&gt;4-7-12), 3=(&gt;1219-29), 4=(&gt;29-42-57) and 5=(&gt;57-70-≤100); in calyces: 0=0, 1=(&gt;0-3-5), 2=(&gt;5-10-18), 3=(&gt;1830-46), 4=(&gt;46-63-77) and 5=(&gt;77-87-≤100). The accuracy, precision and reproducibility of the estimates were verified. For leaves and calyces, one evaluation was carried without scale, and two others evaluations were done with scale, each seven days apart. Evaluators showed better levels of accuracy, precision and reproducibility with the scales. The results suggest that the proposed scales are appropriate to estimate the severity of spotted leaves and calyces of roselle.<hr/>Resumen El manchado de hojas y cálices en jamaica (Hibiscus sabdariffa L.), inducido por Corynespora cassiicola, actualmente es considerada la principal enfermedad de este cultivo en México. Dada su importancia, es necesario contar con un método estandarizado para cuantificar la severidad de la enfermedad. Por lo anterior, el objetivo del presente estudio consistió en desarrollar y validar dos escalas logarítmicas diagramáticas para cuantificar ésta enfermedad. Para ello, se colectaron hojas y cálices de jamaica infectados de manera natural en plantaciones comerciales del estado de Guerrero, y se calculó la severidad real de cada uno de éstos órganos. Las escalas propuestas, diseñadas con el programa 2LOG, comprenden seis clases, en hojas: 0=0, 1=(&gt;0-2-4), 2=(&gt;4-7-12), 3= (&gt;12-19-29), 4= (&gt;29-42-57) y 5=(&gt;57-70-≤100); en cálices: 0=0, 1=(&gt;0-3-5), 2=(&gt;5-10-18), 3=(&gt;18-30-46), 4=(&gt;46-63-77) y 5=(&gt;77-87-≤100). Asimismo, se verificó la exactitud, precisión y reproducibilidad de las estimaciones. Se hizo una evaluación en hojas y cálices sin utilizar las escalas, y otras dos evaluaciones utilizando las escalas, a intervalos de siete días. Los evaluadores mostraron mejores grados de exactitud, precisión y reproducibilidad con el uso de las escalas. Los resultados sugieren que las escalas propuestas son apropiadas para estimar la severidad del manchado de hojas y cálices en jamaica. <![CDATA[Mechanisms, applications, and perspectives of antiviral RNA silencing in plants]]> http://www.scielo.org.mx/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0185-33092016000300286&lng=en&nrm=iso&tlng=en Resumen Las enfermedades virales en plantas causan pérdidas económicas importantes al reducir la calidad y rendimiento de los cultivos, lo que amenaza la seguridad alimentaria en algunos países. Dada la escasez de recursos naturales, plantas con resistencia genética a virus han sido desarrolladas con éxito por ingeniería genética. Un buen entendimiento de los mecanismos básicos que controlan las interacciones entre virus y plantas, incluido el silenciamiento génico de virus por ácido ribonucleico (ARN) de interferencia, es necesario para diseñar mejores estrategias de manejo y métodos biotecnológicos que servirán para desarrollar e implementar resistencia antiviral en plantas. En esta revisión, presentamos modelos moleculares vigentes para explicar el silenciamiento génico de virus por ARN de interferencia y sus aplicaciones en biotecnología e ingeniería genética de plantas.<hr/>Abstract Viral diseases of plants cause important economic losses due to reduction in crop quality and quantity to the point of threatening food security in some countries. Given the reduced availability of natural sources, genetic resistance to viruses has been successfully engineered for some plant-virus combinations. A sound understanding of the basic mechanisms governing plant-virus interactions, including antiviral RNA silencing, is the foundation to design better management strategies and biotechnological approaches to engineer and implement antiviral resistance in plants. In this review, we present current molecular models to explain antiviral RNA silencing and its application in basic plant research, biotechnology and genetic engineering. <![CDATA[Detection of <em>Iris yellow spot virus</em> in onion plants from Tepalcingo, Morelos state, Mexico]]> http://www.scielo.org.mx/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0185-33092016000300308&lng=en&nrm=iso&tlng=en Resumen. En el estado de Morelos recientemente se han observado enfermedades virales en cebolla (Allium cepa); una de ellas es la mancha amarilla causada por el Iris yellow spot virus perteneciente a la familia Bunyaviridae del género Tospovirus, el cual se trasmite a la cebolla por Thrips tabaci Lindeman (Thysanoptera: Thripidae). En el 2012 la incidencia de esta enfermedad fue de 100 % en las 2,500 ha cultivadas en la entidad con una severidad superior a 90 %. El objetivo de este trabajo fue detectar mediante RT-PCR en tiempo real y secuenciar la presencia de IYSV. Para su identificación se tomaron muestras de hojas de cebolla con manchas amarillentas alargadas, desde el trasplante hasta la cosecha en Tepalcingo, Morelos. La extracción de ARN total se realizó utilizando TRIzol® Reagent. La detección del virus se realizó con primers específicos al gen de la nucleoproteína de IYSV dando como resultado la amplificación de un producto específico mediante RT-PCR en tiempo real y una banda esperada de 896 pb la cual mediante secuenciación confirmó 99 % de identidad con el gen de la nucleoproteína de este virus. El IYSV fue detectado en plantas de cebolla en Tepalcingo, Morelos y su secuencia se registró en la base de datos del GenBank (JX946658).<hr/>Abstract. In Morelos state, recently have been observed viral diseases in onion (Allium cepa); one of them is caused by the Iris yellow spot virus (IYSV) which belong to the Bunyaviridae family and the Tospovirus gender and is transmitted by Thrips tabaci Lindeman (Thysanoptera: Thripidae) to onion plants. In 2012, there was a 100 % incidence of IYSV and severity of over 90 % on 2,500 ha of commercial crop. The objective of this research was to identify the presence of IYSV through real time RT-PCR and sequencing of the virus. To accomplish this, leaves were sampled from commercial fields at Tepalcingo, Morelos, from transplanting to harvest. Total RNA extraction was done with TRIzol® Reagent. Virus detection was done using specific primers for the nucleoprotein gen of IYSV giving as a result the amplification of a specific product through real-time RT-PCR, and an expected strip of 896 bp, which after sequencing confirmed 99 % identity with the nucleoprotein gen of the virus. The IYSV virus was detected in onion plants from Tepalcingo, Morelos and the sequence obtained was registered in the database of the GenBank (JX946658). <![CDATA[Histopathology of the infection process of <em>Colletotrichum truncatum</em> in papaya and pea leaves]]> http://www.scielo.org.mx/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0185-33092016000300316&lng=en&nrm=iso&tlng=en Resumen. Colletotrichum truncatum es un hongo patógeno causante de antracnosis en diversos hospedantes; se desconoce el proceso de infección de este patógeno en hojas de papaya, así como el comportamiento de una misma cepa de C. truncatum en distintos hospedantes. El objetivo de este estudio fue describir, mediante técnicas histológicas, el proceso de infección de una cepa de C. truncatum en hojas de papaya y chícharo. En los dos hospedantes, la penetración del hongo ocurrió de manera directa por medio de apresorios alrededor de las 20 h después de la inoculación (hdi). En papaya, las hifas crecieron intercelularmente a las 24-60 hdi; la colonización necrotrófica inició a las 60 hdi; hifas intracelulares crecieron en células del mesófilo causando una extensiva degradación celular; en contraste, en chícharo se observaron hifas primarias de infección a partir de las 36 hdi, las hifas secundarias de infección (estado necrótrofo) se observaron a las 72 hdi. En ambos hospedantes, los acérvulos se observaron a las 96 hdi, lo cual se asoció con la producción de lesiones típicas de antracnosis. Colletotrichum truncatum se comportó como patógeno intramural subcuticular en papaya y como hemibiótrofo intracelular en chícharo; por lo que la estrategia de infección es dependiente del hospedante.<hr/>Abstract. Colletotrichum truncatum is a pathogenic fungus causing anthracnose in several hosts; the infection process of this pathogen in papaya leaf as well as studies of the same strain of C. truncatum in different hosts is unknown. The aim of this study was to describe the infection process of a Colletotrichum truncatum strain by histological techniques in papaya and pea leaves. In both hosts, direct penetration occurred through appressoria around 20 h after inoculation (hai). In papaya, intercellular hyphae grew at 24-60 hai; the necrotrophic colonization began at 60 hai; intracellular hyphae grew in mesophyll cells causing extensive cellular degradation; in contrast, in pea primary infection hyphae began at 36 hai, secondary infection hyphae (necrotrophic state) began at 72 hai. In both hosts, the acervuli were observed at 96 hai, which was associated with typical anthracnose lesions. C. truncatum behaved as intramural subcuticular pathogen in papaya and as intracellular pathogen in pea; so that, the infection strategy is dependent on the host.